Characterization and Quantification of Proteins, Glycoproteins and Proteoglycans from Extracellular Matrix by Mass Spectrometry-Based Proteomics and Glycomics (Z02)

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In der nächsten Förderperiode sollen die von uns entwickelten und etablierten Massenspektrometrie-basierten Methoden auf analytische Fragestellungen der Proteomik, Glykoproteomik und Glykomik vor allem in Zusammenarbeit mit den Teilprojekten A2 (Peter Bruckner), A16 (Markus Missler), B15 (Kay Grobe), B18 (Rita Dreier), und B21 (Erez Raz) angewandt und erweitert werden. Hierzu sollen vor allem die Kombination und Kopplung verschiedener Mikrofluidik- und Chromatographietechniken mit der hochauflösenden FT-ICR Massenspektrometrie und der Q-Tof Tandemmassenspektrometrie zum Einsatz kommen. Weitere Schwerpunkte werden die massenspektrometrische Charakterisierung von intra- und inter-molekularen Disulfidbrücken in Proteinen und die strukturelle Untersuchung von längerkettigen Glykosaminoglykanen vor allem in Hinblick auf deren Sulfatierungsmuster sein. Darüberhinaus wird das Teilprojekt Z2 allen Arbeitsgruppen des SFB als core facility zur Lösung analytischer Fragestellungen mit Hilfe der Massenspektrometrie dienen.