DNA triplex上で鎖切断機能を発揮するオリゴヌクレオチドの新合成

新合成的寡核苷酸对 DNA 三链体具有链切割功能

• 批准号: 05771915
• 负责人: 小野 晶
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: Tokyo Metropolitan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1993
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1993 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-05771915/
• 关键词: DNA synthesis; post-synthetic modification; amino linker; Oligonudeotide; duplex; triplox

本研究は、活性型ヌクレオシドアナログをDNA鎖中に導入した後、そのヌクレオシドの反応性が高いことを利用して様々な反応性基をDNAに結合することを目的とするものである。活性型ヌクレオシドとして、新規ヌクレオシドアナログである5-methoxycarconyl-2′-deoxyuridine(1)を用いた。このものは、パラジウム触媒を用いて市販の5-iodo-2′-deoxyuridineと一酸化炭素、及びメタノールを反応させることにより高収率で得られた。このものはさらに、常法に準じて保護、亜リン酸化してヌクレオシド3'-アミダイトとした後、DNA合成に用いた。DNAオリゴマーとして、5′-d(TMTMTMTM1MTMTMTMT)-3′(M=5-methyl-2′-deoxycytidine)を合成した。Mは2′-deoxycytidineの代わりに用いた。完全保護オリゴマーはジアミノエタンあるいはジアミノヘキサンで処理した。この処理により1のエステル部位がアミドに変換され、オリゴマーはアミノ側鎖を持つことになる。反応は良好に進行し、精製後、目的とする修飾オリゴマーを収率よく得た。続い、てアミノ側鎖を利用してオリゴマーに反応性基を導入した。本年度はアンスラキノン誘導体を結合したオリゴマーを合成した。こうして得た修飾オリゴマーと相補的配列を持つオリゴマーとの形成する2本鎖、及び修飾オリゴマーとターゲット配列を持つDNAとの形成する3本鎖の安定性について、熱変性法により検討した。修飾オリゴマーは対応する天然型オリゴマーに比較して、より安定な2本鎖、3本鎖を形成した。

This study は type, active ヌ ク レ オ シ ド ア ナ ロ グ を DNA lock に import し た, そ の ヌ ク レ オ シ ド の anti 応 が high い こ と を using し て others 々 な the base を DNA に 応 sex combined す る こ と を purpose と す る も の で あ る. Activity type ヌ ク レ オ シ ド と し て, new rules ヌ ク レ オ シ ド ア ナ ロ グ で あ る 5 - methoxycarconyl - 2 '- deoxyuridine (1) を い た. こ の も の は, パ ラ ジ ウ ム catalyst を with い て in vendor の 5 - iodo - 2 '- deoxyuridine と acidification, carbon, and び メ タ ノ ー ル を anti 応 さ せ る こ と に よ り high rate of 収 で ら れ た. こ の も の は さ ら に, often に quasi じ て protection, 亜 リ ン acidification し て ヌ ク レ オ シ ド 3 '- ア ミ ダ イ ト と し た, DNA synthesis after に with い た. DNA オ リ ゴ マ ー と し て (TMTMTMTM1MTMTMTMT), 5 '- d - 3' (M = 5 - methyl - 2 '- deoxycytidine) を synthetic し た. M わ 2 '-deoxycytidine <s:1> is used instead of わ and に. Fully protect the processing of リゴ リゴ ジア ジア ジア ジア ノエタ <e:1> ある ジア ジア ジア ノヘキサ で で で and the handling of た. こ の 処 Richard に よ り 1 の エ ス テ ル parts が ア ミ ド に variations in さ れ, オ リ ゴ マ ー は ア ミ ノ side chain を hold つ こ と に な る. Reverse 応 good に に, after refinement, the purpose is to とする modify the <s:1> リゴ を を を yield よく to た. 続 い, て ア ミ ノ side chain を using し て オ リ ゴ マ ー に anti 応 sex base を import し た. In the current year, ア ア スラキノ スラキノ を inducers を combine with <s:1> た リゴ リゴ た を を を を を を を を を to form た た. こ う し て have た modified オ リ ゴ マ ー と phase of match column を hold つ オ リ ゴ マ ー と の form す る 2 lock, and modified オ び リ ゴ マ ー と タ ー ゲ ッ ト match column を hold つ DNA と の form す る 3 this lock の stability に つ い て, thermal variations method に よ り beg し 検 た. Modified オ リ ゴ マ ー は 応 seaborne す る type natural オ リ ゴ マ ー に compare し て, よ り settle な 2 three copies of this lock, lock を form し た.

项目成果

小野 晶 他: "A novel and convenient post-synthetic modification method for the synthesis of digodeoxy-ribonucleotides carrying amino linkers at 5-position of 2′-deoxyuridine" Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. 4. 361-366 (1994)

Akira Ono 等人：“一种新颖且方便的合成后修饰方法，用于合成在 2-脱氧尿苷 5 位上携带氨基接头的二脱氧核糖核苷酸”《生物有机与药物化学快报》4. 361-366 (1994)。