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NMR法によるショウジョウバエSxl蛋白質のRNA分子の認識機構の解明

利用NMR方法阐明果蝇Sxl蛋白的RNA分子识别机制

基本信息

批准号：
06780478
负责人：
武藤裕
金额：
$ 0.58万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
财政年份：
1994
资助国家：
日本
起止时间：
1994 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

ショウジョウバエの性決定に関与していることが知られているSxl蛋白質は、分子中にRNA分子との結合に関与しているアミノ酸約80残基からなるドメインをタンデムに二つ持っている。このRNA結合ドメインのうち二番目のもの(RBD II)についてNMRによる構造解析を行い、このドメインが通常のRNA結合ドメインよりも長いループ構造を持つものであることを明らかにしている。今年度は、Sxl蛋白質が、認識すると考えられるRNA結合配列(GUUUUUUUUAGUG)とRBD IIとの相互作用をUVクロスリンクやNMRの手法を中心に解析を行った。まずUVクロスリンクの実験からSxl蛋白質によるRNA分子の強い結合には、RBD IとRBD IIの協同作用が必要であることがわかった。しかし、NMRによる解析からRBD II部分だけでもRNA分子の特異的な認識が行われていることが明らかになった。認識の様式を調べるため、数種類のRNA配列を合成し、RBD IIとの相互作用を調べたところ、UUUUUUUUの部分だけではなくCUAGUG部分もRBD IIと相互作用を行うことがわかった。また、UUUUUUUU部分とCUAGUG部分は、異なった認識様式によってRBD IIと相互作用を行っていることがわかった。この認識は、CCCCCCCCのような配列では、起こらず、配列特異性を持っている。さらにNOEによる実験からこの認識には、RBD IIのベータ-シート構造だけでなくRBD IIのN末端部分やC末端部分が関与していることが明らかなった。

Sxl protein and RNA molecules are involved in the binding of Sxl protein and RNA molecules. About 80 residues of Sxl protein are involved in the binding of Sxl protein and RNA molecules. The RNA binding sites of the two groups (RBD II) were analyzed by NMR, and the RNA binding sites of the two groups were analyzed by NMR. This year, Sxl protein is recognized by RNA binding alignment (GUUAGUG) and RBD II interaction, UV detection and NMR analysis. The synergy between RBD I and RBD II is necessary for the strong binding of RNA molecules to Sxl protein. The analysis of RBD II by NMR was carried out in a way that was specific to RNA molecules. Understanding of RNA alignment, RBD II interaction, UU interaction, CUAGUG interaction, RBD II interaction, etc. UU part CUAGUG part reverse, different understanding formula RBD II interaction CCCC The N-terminal part and C-terminal part of RBD II are closely related to each other.