パルスフィールドゲル電気泳動法による恙虫病リケッチアの染色体構造の解析

脉冲场凝胶电泳分析立克次体染色体结构

• 批准号: 06770209
• 负责人: 大橋 典男
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: Nigata University of Phermacy and Applied Life Sciences
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• 财政年份: 1994
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1994 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06770209/
• 关键词: 恙虫病; R.tsutsugamushi; PFGE; Chromosome; Physical map

恙虫病リケッチアの遺伝子構造については、16SrRNA遺伝子や、リケッチア構成蛋白である22,46,56,60kDa蛋白遺伝子の構造解析が行われているが、このリケッチアの染色体の全体構造に関する研究は皆無である。本研究では近年巨大DNAの解析法として開発されたパルスフィールドゲル電気泳動法を用いて、恙虫病リケッチアの染色体サイズの測定、染色体地図の作成及びこのリケッチアの株間の染色体構造の差異の検索、等を目的として研究を行った。その結果、(1)このリケッチアの染色体は一本の環状構造をしていること、(2)血清型を異にするGilliam,Karp,Kato及びKuroki株の染色体サイズは2.1〜2.7Mb(メガベース)であり、このサイズは発疹チフス群または紅斑熱群リケッチアのものよりも2倍近い長い染色体であること、(3)この染色体サイズは恙虫病リケッチアの上記4株の間で数100kbの差異があること、及び染色体の制限酵素SmaI,EagI,ApaIの切断パターンにこれらの株間で差異が見出されたこと、(4)すでに明らかにされているこのリケッチアの16SrRNA遺伝子や22,46,56,60kDa蛋白遺伝子をプローブとしたSouthern hybridization法により、これら遺伝子の染色体上の位置を明らかにし、Gilliam及びKarp株についての染色体地図の作成に成功したこと、などの新知見を得た。

The structure of the 16S rRNA gene and the 22,46,56,60kDa protein gene of tsutsugamushi disease have not been studied. This study aims at the application of large DNA analysis method, development of chromosome electrophoresis method, determination of chromosome structure of tsutsugamushi disease, construction of chromosome map and analysis of chromosome structure differences among strains of tsutsugamushi disease. The results are as follows: (1) The chromosome of Gilliam,Karp,Kato and Kuroki strains is 2.1 ~ 2.7Mb in serotype difference,(2) The chromosome of Gilliam,Karp,Kato and Kuroki strains is 2.1 ~ 2.7Mb in serotype difference, and (3) The chromosome of Gilliam, Karp, Kato and Kuroki strains is 2.1 ~ 2.7Mb in serotype difference.(3) 100kb difference between the four strains of this chromosome and the restriction enzymes SmaI,EagI,ApaI in the chromosome.(4) 16S rRNA gene 22,46,56,60kDa protein gene. The position of the chromosome of the gene was clearly identified, and the new knowledge of the chromosome of the Gilliam and Karp strains was successfully obtained.

项目成果

N.Ohashi et al.: "Cloning and sequencing of the gene(tsg56)encoding a type-specific antigen from Rickettsia tsutsugamushi." Gene. 91. 119-122 (1990)

N.Ohashi 等人：“编码恙虫病立克次体特异性抗原的基因 (tsg56) 的克隆和测序。”

N.Ohashi et al.: "Phylogenetic position of Rickettsia tsutsugamushi and the relationship among its antigenic variants by analyses of 16SrRNA gene sequences." FEMS Microbiol.Lett.125. 299-304 (1995)

N.Ohashi 等人：“通过 16SrRNA 基因序列分析，了解恙虫病立克次体的系统发育位置及其抗原变异之间的关系。”