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DNA塩基損傷を特異的に認識し切断する分子の開発

开发特异性识别和切割 DNA 碱基损伤的分子

基本信息

批准号：
01J03383
负责人：
萩原伸也
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至 2002
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-01J03383/
关键词：
DNA mismatch bulge naphthyridine SNPs

项目摘要

DNAバルジ構造は、複製のエラー等により発生し、フレームシフト変異等の原因となっていると考えられている。また、RNAにおいてはバルジ構造がタンパクによる結合に重要な役割を果たしている。当研究室では、グアニンと相補的な水素結合パターンと、上下の塩基対間にインターカレートする方交換を併せ持つナフチリジン誘導体がグアニンバルジDNAに選択的に結合する事を報告している。さらに、ナフチリジン誘導体を二量化させたナフチリジン二量体がGGミスマッチに強く結合する事を報告している。ナフチリジン二量体のGGミスマッチに対する結合は、二つのGバルジへのナフチリジンの協奏的な結合であると考えられる。従って、C、T、Aなど他のバルジに結合する分子の開発は、それらの分子の組み合わせによりすべてのミスマッチの認識を可能にする。今回アデニンバルジ構造を特異的に認識する分子の開発を行った。これまでの研究から、水素同士が立体反発を生むキノリン誘導体や、芳香環がひとつすくないシトシン誘導体はグアニンバルジに結合しないことがわかっている。これらのことから、バルジに結合するためには少なくとも二つ以上の芳香環を持つことにより上下の塩基対と充分にスタックし、水素結合パターンが塩基と相補的である事が必要である。これらの知見をもとに、アデニンバルジDNAに結合すると考えられる分子としてナフチリジンから誘導されるヒドロキシアザキノロン誘導体(1)を合成した。1のアデニンバルジへの結合を、1の存在下におけるアデニンバルジDNAの二本鎖融解温度の上昇を測定することにより評価した。1の濃度を上げるに従いDNAの融解温度が上昇した事から、1はアデニンバルジDNA結合し二本鎖を安定化していると考えられる。また、1を他のバルジを含む二本鎖二加えても融解温度が上昇しなかったことから、1は選択的にアデニンバルジに結合していると考えられる。

The reasons for the development and variation of DNA structure and replication are discussed. The structure of RNA is very important for the combination of RNA and RNA. When the laboratory reports on the binding of complementary water elements, the exchange of water elements between the upper and lower base pairs, and the binding of selected DNA elements between the upper and lower base pairs, the laboratory reports on the binding of selected DNA elements. This paper reports the results of two quantitative studies on the interaction between GG and GG. The combination of two quantities of GG and GG and the combination of two quantities of GG and GG. The molecular development of C, T, A and other molecules may be related to the molecular composition of C, T, A and other molecules. The molecular development process of the present invention is characterized by a unique structure. This study is aimed at exploring the effects of water on the formation of stereo-reaction inducers and aromatic rings. It is necessary to combine the two or more aromatic rings together. The two or more aromatic rings are complementary to each other. This is the first time that a human being has been identified. 1. Determination of the increase in the melting temperature of DNA in the presence of 1 1. The concentration of DNA increases, and the melting temperature of DNA increases. 1. The binding of DNA to DNA is stabilized. The melting temperature of the solution increases with the increase of temperature.