ゲノムからの遺伝子発現制御情報の抽出のための基礎研究

从基因组中提取基因表达控制信息的基础研究

• 批准号: 13202017
• 负责人: 小嶋 徹也
• 金额: $ 2.82万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13202017/
• 关键词: ゲノム情報; 遺伝子発現制御; エンハンサー; ホメオボックス遺伝子; 発現パターン

最近のゲノム研究の進展により、我々はある生物種のゲノム上に存在する遺伝子をゲノム配列から予測出来る様になったが、遺伝子の発現制御に関しては未だ予測出来ない。そのためには数多くの遺伝子の発現制御領域の解析が必要だが、その際、同じ組織で、同じ時期に、類似したパターンで発現する遺伝子のシリーズについて解析し、それぞれのゲノム上の配列を比較することで効率的にゲノム配列と発現制御の関係を明らかに出来ると考えられる。本研究では、ショウジョウバエの成虫肢形成過程で遠近軸に沿って領域特異的に発現する遺伝子の発現制御領域の同定及び比較検討を試みた。既に単離・解析を進めてきたホメオボックス遺伝子Bar、a1、c11の制御領域について、それぞれ約8Okb、25kb、25kbのゲノム領域を解析する事により、現在までに約1kb,500bp,300bpにまでその必須領域を限定する事が出来た。これらの領域には共通してホメオドメイン・タンパク質の結合コンセンサス配列のコアであるTAATモチーフが密集していた。また、Barの制御領域は約450bpの肢原基で発現するのに必須な部分とその部分の活性を肢原基の特定の領域に限定するのに必要な部分の二つの部分からなっている事も分かった。さらに、制御領域を解析する候補を増やす為に、ショウジョウバエのホメオボックス遺伝子のうち、肢原基での発現が知られていないすべての遺伝子(75遺伝子)についてin situ hybridizationによりmRNAの発現パターンを調べた。その結果、Barやa1,c11と同様の領域で発現するものや、Barよりもさらに近位部側で発現するもの等、Bar, a1,c11と同様に遠近軸に沿って領域特異的に発現する遺伝子が少なくともつ新たに同定できた。

Recent advances in the study of biological species have been reported, and we believe that the existence of genetic agents on biological species has to be predicted, and that the control of genetic agents has not yet been predicted. The analysis of the occurrence and control fields of multiple genes is necessary to analyze the relationship between the occurrence and control of multiple genes, and the relationship between the occurrence and control of multiple genes. This study was conducted to investigate the identity and comparative model of the development of the mature offspring along the domain-specific distal and proximal axes during adult limb formation. In addition, the analysis of the domain of the gene Bar, a1, c11 is about 8 kb, 25kb, and 25kb. The analysis of the domain of the gene Bar is about 1kb,500bp, and 300bp. This domain is common to all types of products and services. The control domain of the Bar is about 450bp. The necessary part of the activity domain of the limb primordium is limited to the necessary part of the activity domain. In addition, the candidate for the analysis of the control domain is increased for the detection of mRNA in situ hybridization and the detection of mRNA in situ hybridization. As a result, Bar, a1,c11 and the domain of the same kind appear in the near part of the same kind, Bar, a1,c11 and the far and near axis appear along the domain specific domain of the same kind.