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ゲノムからの遺伝子発現制御情報の抽出のための基礎研究

从基因组中提取基因表达控制信息的基础研究

基本信息

批准号：
13202017
负责人：
小嶋徹也
金额：
$ 2.82万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2001
资助国家：
日本
起止时间：
2001 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

最近のゲノム研究の進展により、我々はある生物種のゲノム上に存在する遺伝子をゲノム配列から予測出来る様になったが、遺伝子の発現制御に関しては未だ予測出来ない。そのためには数多くの遺伝子の発現制御領域の解析が必要だが、その際、同じ組織で、同じ時期に、類似したパターンで発現する遺伝子のシリーズについて解析し、それぞれのゲノム上の配列を比較することで効率的にゲノム配列と発現制御の関係を明らかに出来ると考えられる。本研究では、ショウジョウバエの成虫肢形成過程で遠近軸に沿って領域特異的に発現する遺伝子の発現制御領域の同定及び比較検討を試みた。既に単離・解析を進めてきたホメオボックス遺伝子Bar、a1、c11の制御領域について、それぞれ約8Okb、25kb、25kbのゲノム領域を解析する事により、現在までに約1kb,500bp,300bpにまでその必須領域を限定する事が出来た。これらの領域には共通してホメオドメイン・タンパク質の結合コンセンサス配列のコアであるTAATモチーフが密集していた。また、Barの制御領域は約450bpの肢原基で発現するのに必須な部分とその部分の活性を肢原基の特定の領域に限定するのに必要な部分の二つの部分からなっている事も分かった。さらに、制御領域を解析する候補を増やす為に、ショウジョウバエのホメオボックス遺伝子のうち、肢原基での発現が知られていないすべての遺伝子(75遺伝子)についてin situ hybridizationによりmRNAの発現パターンを調べた。その結果、Barやa1,c11と同様の領域で発現するものや、Barよりもさらに近位部側で発現するもの等、Bar, a1,c11と同様に遠近軸に沿って領域特異的に発現する遺伝子が少なくともつ新たに同定できた。

The recent progress of research on のゲノムのにより, and the existence of my 々はあるbiotic species のゲノム上する伝子をゲノThe か様になったが is expected to come out. It is necessary to analyze the field of control now Interaction, same organization, same period, similar situation Analysis of それぞれのゲノム上のalignment and comparison of することでEfficient にゲノムmatching and と発 appear to control the relationship を明らかに出ると考えられる. In this study, the formation process of adult limbs along the distal and proximal axis of the adult insect was determined and compared with the specific control areas of the distal and proximal axes.　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　ifies in a 1, a1, c11のcontrol domain について, それぞれabout 8Okb, 25kb, 2 The 5kb のゲノムfield をanalytic する事により, the current までに is about 1kb, 500bp, 300bp にまでそのRequired field をlimited する事が comes out.これらの地には合してホメオドメイン・タンパク性のcombinationコンセンサス配arrayのコアであるTAATモチーフがdensityしていた.また、Barのcontrol fieldはAbout 450bpのlimb primordial で発 appear するのにmust part とそのpart のactivityを Limb primordium's specific field is limited and necessary. Part of it is necessary. Part of it is part of it.さらに、Control domain analysisする candidateを嗗やす为に、ショウジョウバエのホメオボックス弝子のうち、 Limb primordial での発 appear が知られていないすべての缝子(75缝子)についてin situ hybridizationによりmRNAの発成パターンを动べた.そのRESULTS、Barやa1,c11と同様の区で発appearするものや、Barよりもさらに proximal part side で発appears するものetc., Bar, a1,c11 is the same as the distal and proximal axis and is along the same field as the specific one.