Studies on transcription controls operating in archaeal virus-host systems: regulation of transcription of genomes of the rudiviruses SIRV1 and SIRV2, and the lipothrixvirus SIFV of the hyperthermophilic archaeaon Sulfolobus
古细菌病毒宿主系统中转录控制的研究:鲁迪病毒 SIRV1 和 SIRV2 以及超嗜热古细菌硫化叶菌的脂丝病毒 SIFV 基因组转录的调节
基本信息
- 批准号:5314438
- 负责人:
- 金额:--
- 依托单位:
- 依托单位国家:德国
- 项目类别:Priority Programmes
- 财政年份:2001
- 资助国家:德国
- 起止时间:2000-12-31 至 2006-12-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
A pair of rod-shaped viruses SIRV1 and SIRV2 of hyperthermophilic Sulfolobus, the genomes of which have been recently completely sequenced, is an attractive and unique model for unravelling mechanisms, controls and signal structures involved in gene expression in Archaea. The virus SIRV1 responds to changes of a host in a way unusual for DNA viruses by extensive and rapid accumulation of point mutations in the genome. This allows rapid selection of new virus variants adapted to a new host, coinciding with a recovery of high fidelity of replication. In contrast to the genome of SIRV1, the genome of SIRV2, which is highly homologous to the latter, however, 3.2 kb longer, remains unchanged in the same hosts. In order to understand the SIRV1-specific mutator system and its control we plan to study transcription and replication of the genomes of the two viruses. Comparative studies of transcripts of the genomes of SIRV1 and SIRV2 in different hosts will enable us to identify candidate genes that are involved in a response to changes of host species, and those which cause differences in the behaviour of the viruses under such conditions. These genes will be selectively disrupted, or deleted/introduced from/into the DNAs of the viruses by constructing recombinant DNA molecules consisting of different portions of the genomes of the two viruses in a way not affecting essential viral functions. Transfection of an appropriate host with these DNAs and studies on their replication and transcription will shed light on functions of proteins encoded by the genes and controls of their expression. The studies will also enable to identify ORFs which are nonessential for virus function, and lay the basis for the development of a transformation vector based on the virus DNAs.
超级嗜热Sulfolobus的杆状病毒SIRV1和SIRV2的基因组最近已经完全测序,是解开古细菌基因表达的机制、控制和信号结构的一个有吸引力的独特模型。SIRV1病毒通过在基因组中广泛而快速地积累点突变来对宿主的变化做出反应,这种方式对DNA病毒来说是不寻常的。这允许快速选择适应新宿主的新病毒变体,同时恢复高保真复制。与SIRV1的基因组相比,SIRV2的基因组在相同的宿主中保持不变,但SIRV2的基因组与SIRV1高度同源,比SIRV1长3.2kb。为了了解SIRV1特异性突变子系统及其控制,我们计划研究这两种病毒基因组的转录和复制。对SIRV1和SIRV2基因组转录产物在不同宿主中的比较研究将使我们能够确定与宿主物种变化有关的候选基因,以及那些导致病毒在这种条件下行为不同的候选基因。通过以不影响基本病毒功能的方式构建由两种病毒基因组的不同部分组成的重组DNA分子,这些基因将被选择性地破坏,或从病毒DNA中删除/引入病毒DNA中。将这些DNA导入适当的宿主,并对它们的复制和转录进行研究,将有助于揭示由这些基因编码的蛋白质的功能及其表达控制。这些研究还将有助于识别对病毒功能非必需的ORF,并为基于病毒DNA的转化载体的开发奠定基础。
项目成果
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