マイクロアレイを用いた大量遺伝子発現解析による加齢黄斑変性の病因解明

通过使用微阵列进行大规模基因表达分析来阐明年龄相关性黄斑变性的发病机制

• 批准号: 14770969
• 负责人: 鄭 守
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Kyoto Prefectural University of Medicine
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 2003
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-14770969/
• 关键词: 加齢黄斑変性; マクロファージ; cDNAマイクロアレイ; Elongation factor 1; ウィルムス腫瘍関連タンパク

加齢黄斑変性患者と正常者の単核球・マクロファージにおける遺伝子の同時大量発現解析を行い、遺伝子発現を比較検討した。滲出型加齢黄斑変性患者2例と年齢・性を適合させた正常者2例から、末梢静脈血50ccを採取し、リンパ球を分離した。抗CD14抗体を用いてセルソーティング法により、単核球とマクロファージを精製し、total RNAを抽出した。抽出したtotal RNAに対しcDNAマイクロアレイを用いて、2400個のヒト既知遺伝子に関し、発現解析した結果を比較検討した。2400個のヒト既知遺伝子の内、1060個の遺伝子は4例すべてで有意な発現が認められた。加齢黄斑変性患者2例と正常者2例の遺伝子発現の比較において、715個の遺伝子は、発現比が1/2倍以上2倍以内であった。正常者と比較して加齢黄斑変性患者で発現比が2倍以上であった遺伝子は55個あり、1/2倍以下であった遺伝子は2個のみであった。発現が2倍以上であった55個の遺伝子の内、Elongation factor 1とウィルムス腫瘍関連タンパク遺伝子の発現比は、3倍以上であった。この結果を元に、遺伝子発現の半定量化と組織発現を検討した。発現上昇を確認したElongation factor 1とウィルムス腫瘍関連タンパク遺伝子のプライマーを作成し、半定量的RT-PCRを行い、加齢黄斑変性患者と正常者での発現変動を検討したところ、cDNAマイクロアレイと同様の結果を得た。Elongation factor 1とウィルムス腫瘍関連タンパク遺伝子の発現が上昇していることが、加齢黄斑変性患者の脈絡膜新生血管においてマクロファージが蓄積していることに関与している可能性が示唆された。

A comparative study of the simultaneous occurrence of large numbers of genes in patients with macular degeneration and normal individuals Exudative type: 2 cases of macular degeneration, 2 cases of normal peripheral venous blood. Anti-CD14 antibodies were purified by PCR and total RNA was extracted. Total RNA was extracted from the cDNA library, and 2400 known cDNA fragments were analyzed and compared. 2400 known genes, 1060 genes and 4 cases of intentional discovery In addition, there were 2 cases of macular degeneration and 2 cases of normal. The ratio of 715 cases of macular degeneration was more than 1/2 times and less than 2 times. In normal cases, the incidence rate was more than 2 times, and the incidence rate was less than 1/2 times. More than 2 times more than 55 genes were detected, and the Elongation factor 1 was more than 3 times more than that of the other genes. The results of this study were analyzed by semi-quantitative and tissue analysis. Detection of Elongation Factor 1 and cDNA Expression in Patients with Melanotic Disease and Normal Subjects The increase in the occurrence of TNP-related proteins associated with Elongation factor 1 and melanoma has increased the possibility of accumulation of TNP-related proteins in choroidal neovascularization in patients with macular degeneration.