DNAの塩基配列による広義のペチュニア属の分子系統分類と種内変異

基于DNA碱基序列的广义矮牵牛属分子系统发育分类及种内变异

• 批准号: 14760012
• 负责人: 國分 尚
• 金额: $ 2.43万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-14760012/
• 关键词: Petunia; Calibrachoa; 分子系統分類; 葉緑体DNA; 遺伝子間スペーサー領域; ナス科; パラレトロウイルス; 遺伝子間領域

平成15年度までの葉緑体DNAの分析ではPetunia、Calibrachoaともに属内の系統樹は多分岐となり、属内の系統の推定が困難であった。そこで、最近存在が確認された核DNA内petunia vein clearing virus (PVCV)の塩基配列による系統の推定の可能性を探った。材料としてPetunia axillaris ssp.axillaris(7地点)、ssp.parodii(5地点)、ssp.subandina(5地点)、P.inflata(5地点)、P.integrifolia(6地点)の自生地由来の種子から育成した植物と品種‘Falcon Blue'、‘Ultra Blue'を用いた。葉から抽出したDNAをテンプレートとし、PVCVのプロテアーゼとレトロトランスクリプターゼの一部を含む塩基配列約500bpを増幅するプライマーを用いてPCRを行い、塩基配列を決定した。P.axillaris ssp.parodii, ssp.subandina, P.inflataでは供試全地点で染色体内PVCVを確認できなかった。一方、P.integrifoliaの全地点と両品種にはPVCVが存在し、ssp.axillarisは存在する4地点と存在しない3地点に分かれた。増幅された染色体内PVCVの塩基配列には、種間および地点間で多型が見られ、品種のPVCVは歴史的片親とされるssp.axillarisの配列に近かった。これらの結果によりPVCVは保有個体群と非保有個体群があるために、Petunia全種の系統を推定することはできないが、種内の変異が大きいため、保有個体群間の系統推定の可能性が示唆された。また、植物では核DNA内にレトロエレメントが多く存在することがわかってきたので、属内全種に存在するホモロガスなエレメントを利用することで属内の詳細な系統が分析できると思われた。

Analysis of chloroplast DNA in Heisei 15, Petunia, Calibrachoa, phylogenetic tree within the genus, multi-branched phylogeny, and inference of the system within the genus, difficulty.そこで、The existence of petunia vein clearing virus (PVCV) in nuclear DNA has recently been confirmed and the possibility of the petunia vein clearing virus (PVCV) in the system has been presumed and the possibility has been explored. Materials: Petunia axillaris ssp.axillaris (7 locations), ssp.parodii (5 locations), ssp.subandina (5 locations), P.inflata (5 locations), P.integrifolia (6 locations), naturally grown seeds, and cultivated plants, varieties ‘Falcon Blue’, ‘Ultra Blue'を用いた.叶から出したDNAをテンプレートとし、PVCVのプロテアーゼとレトロトランスクリプターゼのOne part contains a base sequence of about 500 bp, and the amplification method is determined by PCR and the base sequence. P.axillaris ssp.parodii, ssp.subandina, P.inflata has been tested for PVCV within the chromosome at all locations and has been confirmed. One party, P.integrifolia's all locations and varieties, PVCV's existence, ssp.axillaris's existence, 4 locations and 3 locations. The PVCV gene within the chromosome is arranged in a wide range, the polymorphism between species and locations is seen, and the variety of PVCV is arranged in a variety of species.これらのRESULTSによりPVCVはKeeping individual group and non-holding individual groupがあるために、Petunia full species のsystemをIt is presumed that there is no difference between species, there is a large difference between species, and there is a possibility of systematic estimation between groups of individuals.また, plant では nuclear DNA にレトロエレメントが多く exists することがわかってきたので, all species within the genusにExistence するホモロガスなエレメントを Utilize することで内のDetailed な system がanalyze できると思われた.

项目成果

ペチュニアと近縁属の遺伝資源解析(第54報)Petunia野生種の染色体DNA内に存在するpetunia vein clearing virus(PVCV)の分布と多様性

矮牵牛及相关属遗传资源分析（第54次报告）野生矮牵牛染色体DNA中矮牵牛静脉清除病毒（PVCV）的分布和多样性

• 发表时间: 2004
• 期刊: 園芸学会雑誌 73巻・別2号
• 作者: 國分尚ほか