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SAGE法を用いた担子菌におけるcAMP誘導性遺伝子発現プロファイリング

使用 SAGE 方法对担子菌中 cAMP 诱导的基因表达谱进行分析

基本信息

批准号：
14760054
负责人：
入江俊一
金额：
$ 2.18万
依托单位：
The University of Shiga Prefecture
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

项目摘要

白色腐朽菌Phanerochaete chrysosoporiumは培養後期に特定条件下でリグニン分解酵素を発現する。リグニン分解酵素はリグニンやダイオキシンなどの難分解性有機物質分解に関与すると考えられており、未利用資源のビアオマス変換や環境浄化への利用が期待されている。しかしながら、これらの発現機構については不分明な点が多く、また、現在判明しているリグニン分解酵素と同時年発現する未知因子が基質分解に関与していることも示唆されている。前年度までにアデニル酸シクラーゼ阻害剤アトロピン添加によってP.chrysosoporiumのリグニン分解酵素が発現抑制されることを確認した。そこでアトロピン添加条件、無添加条件、および培養初期の菌体からmRNAを抽出し、発現遺伝子を比較することでリグニン分解酵素発現にかかわる遺伝子、基質に働きかける未知の因子をコードする遺伝子の検出を試みることとした。具体的にはSerial analysis of Gene Expression (SAGE)法を用いて各条件での遺伝子発現量を正確に反映すると考えられるタグを調べ、プロファイリングを行うこととした。同時に、研究を開始した当時は糸状菌についてSAGE法を行った報告例が存在しなかったため、技術の獲得を目的として比較的遺伝子解析の進んでいるいもち病菌についてSAGE法を用いた付着器形成に関与するcAMP誘導性遺伝子発現プロファイリングを14年度から15年度にかけて行った。結果としては、いもち病菌付着器形成に関与する新規のcAMP誘導性遺伝子が多数検出され、多くの知見が得られた。研究結果はIrie, T., H.masumura, R.Terauchi and H.Saitoh.(2003) Mol Genet Genomics 270:181-189にまとめた。現在、いもち病菌で得た技術を用いてP.chrysosoporiumのSAGE法解析を行っているところである。まだタグレベルでの解析段階であるが、今後はP.crysosoporiumの全ゲノムデータとの比較によりタグ遺伝子のアノテーションを行い、遺伝子を特定し、個々の遺伝子における詳細な解析を行う予定である。

The white rot fungus Phanerochaete chrysosporium can produce enzymes under certain conditions in the later stage of culture. The decomposition of refractory organic substances by enzymes is expected to be carried out in the future, and the utilization of unutilized resources is expected. It is now clear that the unknown factors involved in substrate decomposition are related to the development of enzymes and enzymes. This is a confirmation of the presence of P. chrysosporium in the presence of P. chrysosporium. There are several factors that can be used to detect the expression of mRNA in the early stage of culture, such as addition condition, no addition condition, and expression of mRNA in the early stage of culture. Specific Serial analysis of Gene Expression (SAGE) method is used to accurately reflect the expression of gene expression under various conditions. At the same time, the SAGE method was used to report the existence and acquisition of technology at the beginning of the study, and the progress of gene analysis was made in the application of SAGE method in the formation of receptors and cAMP-induced gene expression in the 14th and 15th years. The results showed that most of the cAMP inducible genes were detected and most of them were found to be related to the formation of the pathogen. Irie, T., H.masumura, R.Terauchi and H.Saitoh. (2003) Mol Genet Genomics 270:181-189にまとめた。Now, the technology of P. chrysosporium is analyzed by SAGE method. In the future, the analysis of P. crysoporium will be carried out in detail by comparing the analysis of P. crysoporium with that of P. crysoporium.