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分子疫学的手法を用いた地域におけるHIV感染伝播経路の解析

利用分子流行病学方法分析区域性HIV感染传播途径

基本信息

批准号：
14770197
负责人：
小島洋子
金额：
$ 3.04万
依托单位：
Osaka Prefectural Institute of Public Health
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2004
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-14770197/
关键词：
遺伝子解析疫学サブタイプ HIV 遺伝的特徴 V3 薬剤耐性変異重感染抗体検査

项目摘要

遺伝子解析を行ったウイルスは53株で、env-V3の塩基配列分析からサブタイプを同定した結果、日本人男性でサブタイプBが49株、サブタイプAEが1株、外国人女性でサブタイプAEが3株であった。これらのウイルス株の中でサブタイプB株に着目すると、2001年以降に検出したサブタイプBの株では遺伝的に多様な広がりをもっていることが観察された。この傾向はpol領域でも認められた。env-V3のcrown tetrapeptideモチーフに関しても、サブタイプBの49株中に、主流であると言われているGPGRが27株の他にGIGPRモチーフをもつ株が2株、GPGQが8株、GPGGが4株、GPGKが4株、APGRが3株、GMGRが1株存在し、多様性が増加する傾向は示された。遺伝的に非常に近縁でV3 loop内で同一の珍しい特徴をもつアミノ酸の挿入や欠失がみられる複数の株が2グループ確認された。その1つは2001年に検出したサブタイプBの3株であり、V3loopの19番目と20番目の間にIleあるいはMetの挿入、24番目にアミノ酸の欠失がみられ、アミノ酸レベルでは90〜98%の相同性を示した。この3株に対してpol領域について系統樹解析を行うと、V3同様に非常に近縁で、アミノ酸レベルでは98〜100%と高い相同性がみられた。また別の特徴的配列をもつ2株はcrown tetrapeptideモチーフ内にIleの挿入変異がみられ、V3領域においてアミノ酸レベルでは97%の相同性を示した。これらの感染源が同一であると考えられるウイルスの存在は、地域におけるコミュニティーでのHIV感染の伝播経路を推定することができた。pol領域の解析により、多型の可能性も考えられるが薬剤耐性変異をもつウイルスがみつかり、薬剤を投与している感染者から新たに感染したと考えられる例もみられた。伝播経路や感染の広がり、また薬剤耐性変異ウイルスを調べる等、分子疫学的手法を用いることは有用な手段であると考えられた。

53 strains of Japanese male, 1 strain of Japanese female and 3 strains of Japanese female were analyzed by env-V3 gene alignment analysis. In 2001, the number of plants in China was increased by 10%. The tendency of pol Among the 49 env-V3 and crown tetrapeptide strains, there were 27 GPGR strains and 2 GIGPR strains, 8 GPGQ strains, 4 GPGG strains, 4 GPGK strains, 3 APGR strains and 1 GMGR strain. The same rare feature in the V3 loop is found in the very near vicinity of the plant. In 2001, 3 strains of Sabutaipo B were detected, Ile Arui Met was detected between the 19th and 20th sections of the V3loop, and the loss of Amiso acid was found in the 24th section. The Amiso acid betel is 90 ~ 98% identical. These three species are closely related to each other in the pol domain, and the phylogenetic tree analysis is very close to each other in the V3 homology domain. The phylogenetic tree analysis is 98 ~ 100% identical to each other in the V3 homology domain. The alignment of the characteristics of the two strains showed 97% identity between the two strains of crown tetrapeptide and the two strains of V3. The source of HIV infection is the same as the source of HIV infection. The analysis of pol domain is based on the possibility of multiple types of infection. The analysis of pol domain is based on the possibility of multiple types of infection. The method of molecular epidemiology is to use the method of transmission and infection, and to use the method of transmission and infection.