共生細菌ブフネラを収納するアブラムシ菌細胞の宿主EST解析

含有共生细菌 Buchnera 的蚜虫真菌细胞的宿主 EST 分析

• 批准号: 03J01542
• 负责人: 中鉢 淳
• 金额: $ 5.76万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research (2005)National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (2003-2004)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03J01542/
• 关键词: アブラムシ; 菌細胞; ブフネラ(Buchnera); EST(Expressed Sequence Tag); トランスクリプトーム; ゲノム; normalized full-length cDNA library; リゾチームホモログ; EST(Exressed Sequence Tag); GO(Gene Ontology); リアルタイム定量的RT-PCR; 国際情報交換; フランス:アメリカ; キャップトラッパー; cDNAライブラリー

1.平成15年度から平成16年度にかけて得られたアブラムシ菌細胞のESTデータを、国外の複数の研究グループ(フランスINRA、アメリカ農務省、プリンストン大学、バレンシア大学など)により生産されたアブラムシ各部(頭部、触覚、唾液腺、消化管、初期胚など)のESTデータと突き合わせ、これらグループと共同でcDNAポピュレーションの詳細な解析を行った。2.Aphid Genomics Consortium Steering CommitteeのメンバーとしてNHGRI(National Human Genome Research Institute;米国NIH内の一機関)にエンドウヒゲナガアブラムシの全ゲノム塩基配列の決定を働きかけ、これを採択させた。その上で塩基配列決定後のgene findingやannotationを効率よく行うことが出来るよう、normalized full-length cDNA libraryを作製した。マイクロアレイ解析、FISH解析や個々の遺伝子のRNAiノックダウンなどはゲノム解析により全遺伝子の情報が得られた後に網羅的に行うのが効果的と考え、現時点で行うことは避けることとした。3.昨年度のトランスクリプトーム解析により、菌細胞特異的に著しく高発現していることが見出され、共生系を維持する上で重要な機能を担うと目されるリゾチームホモログ遺伝子について、タンパク質の発現系を構築し、得られた産物の酵素活性について検討した。さらにこのリゾチームホモログに対する抗体を作製し、より詳細な機能解析を行うための基盤を整えた。

1. In 2015, the number of EST of bacterial cells was increased from 2016 to 2015, and the number of foreign research groups was increased. Detailed analysis of EST data from all parts of the production system (head, touch, salivary gland, digestive tract, early embryo) was conducted. 2. The Aphid Genomics Consortium Steering Committee is responsible for determining the full range of gene combinations in the NHGRI(National Human Genome Research Institute; NIH). Gene finding and annotation after gene alignment determination are performed in a normalized full-length cDNA library The analysis and FISH analysis of two kinds of genetic information, the analysis of all kinds of genetic information, the analysis, the analysis of genetic information, the analysis, the genetic information, the analysis, the analysis 3. In the past year, the analysis of bacterial cell-specific activities has been carried out, and important functions of symbiotic system maintenance have been found, such as the construction of bacterial cell-specific production systems, the construction of bacterial cell-specific production systems, and the detection of enzyme activities of their products. This is the first time I've ever seen a picture of an antibody.

项目成果

Transcriptome analysis of the aphid bacteriocyte, the symbiotic host cell that harbors an endocellular mutualistic bacterium, Buchnera

• DOI: 10.1073/pnas.0409034102
• 发表时间: 2005-04-12
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
• 影响因子: 11.1
• 作者: Nakabachi, A;Shigenobu, S;Fukatsu, T
• 通讯作者: Fukatsu, T

昆虫の細胞内共生微生物(「難培養微生物研究の最新技術」中の1章)

昆虫细胞内共生微生物（《难培养微生物研究最新技术》第一章）

• 发表时间: 2004
• 作者: B.Sabater-Munoz他;Atsushi Nakabachi;中鉢 淳
• 通讯作者: 中鉢 淳