熱帯雨林におけるフタバガキ科樹木の遺伝的変異維持機構
熱帯雨林におけるフタバガキ科樹木の遺伝的変異維持機構
批准号:
03J07578
负责人:
上谷 浩一
金额:
$2.11万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2005
中文摘要
生物集団が保有している遺伝的変異と遺伝構造に関する知見は,生物多様性を生み出す進化ポテンシャルを適切かつ効果的に保全していくために重要である.我々は,生物の適応進化と遺伝的多様性の維持機構を明らかにする目的で,種多様性の著しく高い熱帯雨林生態系の主要構成樹木であるフタバガキ科を対象にした遺伝的変異を調査した.本研究では,同所的に生育するショレア属近縁4種ついて複数個体のDNAを採集し,4核遺伝子座および1葉緑体遺伝子座の塩基配列を決定した.核遺伝子座の平均塩基多様度はサイレントサイトあたり0.0068-0.0162であった.遺伝子系図は遺伝子座間で異なり,すべての遺伝子座で別種の遺伝子がクラスターする例が見られた.最尤法によって,種分化後に起こった遺伝子交換の程度,祖先集団の集団サイズ,およびこれら近縁種の分岐年代を推定した.この結果,近縁種間では種分化後に遺伝子交換が起こったこと,祖先集団の集団サイズが現存種のものより小さいことがわかった.また,近縁種の分岐年代は200-300万年前と推定された.本研究は,熱帯雨林構成樹木のDNA配列レベルでの遺伝的変異量を推定した初めての例であり,熱帯雨林構成樹木は各種の個体群密度が非常に低いにもかかわらず,自然集団内の遺伝的多様性はこれまでに調べられている温帯の広域分布種をそれほど変わらないことを示した.また,過去に起こった遺伝子交換が遺伝子系統樹の不一致の原因となることを明らかにした.
英文摘要
生物集団が保有している遺伝的変異と遺伝構造に関する知見は,生物多様性を生み出す進化ポテンシャルを適切かつ効果的に保全していくために重要である.我々は,生物の適応進化と遺伝的多様性の維持機構を明らかにする目的で,種多様性の著しく高い熱帯雨林生態系の主要構成樹木であるフタバガキ科を対象にした遺伝的変異を調査した.本研究では,同所的に生育するショレア属近縁4種ついて複数個体のDNAを採集し,4核遺伝子座および1葉緑体遺伝子座の塩基配列を決定した.核遺伝子座の平均塩基多様度はサイレントサイトあたり0.0068-0.0162であった.遺伝子系図は遺伝子座間で異なり,すべての遺伝子座で別種の遺伝子がクラスターする例が見られた.最尤法によって,種分化後に起こった遺伝子交換の程度,祖先集団の集団サイズ,およびこれら近縁種の分岐年代を推定した.この結果,近縁種間では種分化後に遺伝子交換が起こったこと,祖先集団の集団サイズが現存種のものより小さいことがわかった.また,近縁種の分岐年代は200-300万年前と推定された.本研究は,熱帯雨林構成樹木のDNA配列レベルでの遺伝的変異量を推定した初めての例であり,熱帯雨林構成樹木は各種の個体群密度が非常に低いにもかかわらず,自然集団内の遺伝的多様性はこれまでに調べられている温帯の広域分布種をそれほど変わらないことを示した.また,過去に起こった遺伝子交換が遺伝子系統樹の不一致の原因となることを明らかにした.
期刊论文(3)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Short-term Drought Causes Synchronous Leaf Shedding and Flushing in a Lowland Mixed Diptrocarp Forest, Sarawak, Malaysia
马来西亚沙捞越州低地龙脑香混交林的短期干旱导致叶子同步脱落和冲刷
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Journal of Tropical Ecology 20
影响因子:
--
作者:
[T.Ichie, T.Hiromi, R.Yoneda, K.Kamiya, M.Kohira, I.Ninomiya, K.Ogino]
通讯作者:
K.Ogino
DOI:
10.3732/ajb.92.5.775
发表时间:
2005-05-01
期刊:
AMERICAN JOURNAL OF BOTANY
影响因子:
3
作者:
[Kamiya, K, Harada, K, Ashton, PS]
通讯作者:
Ashton, PS
Phylogeography of dipterocarp species based on whole chloroplast genome sequencing
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批准号:22K06374
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.75万
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财政年份:2022
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负责人:上谷 浩一
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依托单位: