Phylogeography of dipterocarp species based on whole chloroplast genome sequencing

基于全叶绿体基因组测序的龙脑香科植物系统发育地理学

• 批准号: 22K06374
• 负责人: 上谷 浩一
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Ehime University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06374/
• 关键词: フタバガキ科; 東南アジア; 熱帯雨林; 葉緑体ゲノム; 遺伝的多様性; 系統地理; 葉緑体塩基配列

本研究では，従来の短いDNA配列解析からは不明瞭であったフタバガキ科樹木の分布域形成の歴史を解明するために，フタバガキ科主要3種の葉緑体全ゲノムデータを解析することで，遺伝的多様性の地理的分布を明らかにする。初年度は，これまでに採取したDNAサンプルの精製および乾燥標本からのDNAの再調整をおこなった。次世代シーケンシング用サンプルの調整に十分なDNA量を満たしていないサンプルが多数あったが，当初の予定していたフタバガキ科主要3種以外の種を含む複数種のDNAサンプルの準備が完了した。

The purpose of this study is to explain the history of the formation of the distribution range of trees in the family of the family, the analysis of short DNA alignment, and the explanation of the unknown. There are three main types of chloroplasts in the ひノムデータを family of the フタバガキfamily, and the geographical distribution of the diversity of することで and the を明らかにする are all analyzed. In the first year of the year, the DNA was collected and refined, and the dried specimen was dried and the DNA was re-adjusted. The next-generation シーケンシング is adjusted with サンプルの10なDNA amountを満たしていないサンプルが多あったが, It was originally planned to prepare the DNA サンプルののDNA サンプルの which contains more than 3 main species of the のガキfamily.

项目成果

Morphological and molecular evidence of natural interspecific hybridization between Dyera polyphylla and D. costulata in Sumatra and Kalimantan

苏门答腊岛和加里曼丹岛重叶植物与多叶植物自然种间杂交的形态学和分子证据

• 发表时间: 2022
• 作者: Aulianisa EN;Siregar UJ;Siregar IZ;Hamzah H;Ogasahara M;Kamiya K
• 通讯作者: Kamiya K

MIG-seq法を用いたフタバガキ科樹木セラヤの遺伝的変異と集団構造の評価

利用 MIG-seq 方法评价龙脑香树 Celaya 的遗传变异和种群结构

• 发表时间: 2023
• 作者: 小笠原実里;Cobb AR;Sukri RS;Metali F;田中憲蔵;米田令仁;Azani MA;Lum SKY;上谷浩一
• 通讯作者: 上谷浩一

Leaf morphological traits of nine major tropical trees of Shorea species (Dipterocarpaceae)

龙脑香科九种主要热带乔木的叶片形态特征

• DOI: 10.13057/biodiv/d240344
• 发表时间: 2023
• 期刊: Biodiversitas Journal of Biological Diversity
• 作者: MUFARHATUN NUR;SUSILOWATI ARIDA;HILWAN IWAN;ARROFAHA NAWWALL;YULITA KUSUMADEWI SRI;DWIYANTI FIFI GUS;HIDAYAT ASEP;KAMIYA KOICHI;RACHMAT HENTI HENDALASTUTI
• 通讯作者: RACHMAT HENTI HENDALASTUTI

Genetic structure and population history of a peat swamp forest tree species, Shorea albida (Dipterocarpaceae), in Brunei Darussalam

文莱达鲁萨兰国泥炭沼泽森林树种 Shorea albida（龙脑香科）的遗传结构和种群历史

• 发表时间: 2023
• 期刊: Genes & Genetic Systems
• 影响因子: 1.1
• 作者: Ogasahara M;Cobb AR;Sukri RS;Metali F;Kamiya K
• 通讯作者: Kamiya K