Phylogeography of dipterocarp species based on whole chloroplast genome sequencing

基于全叶绿体基因组测序的龙脑香科植物系统发育地理学

• 批准号: 22K06374
• 负责人: 上谷 浩一
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Ehime University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2022
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2022-04-01 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22K06374/
• 关键词: フタバガキ科; 東南アジア; 熱帯雨林; 葉緑体ゲノム; 遺伝的多様性; 系統地理; 葉緑体塩基配列

本研究では，従来の短いDNA配列解析からは不明瞭であったフタバガキ科樹木の分布域形成の歴史を解明するために，フタバガキ科主要3種の葉緑体全ゲノムデータを解析することで，遺伝的多様性の地理的分布を明らかにする。初年度は，これまでに採取したDNAサンプルの精製および乾燥標本からのDNAの再調整をおこなった。次世代シーケンシング用サンプルの調整に十分なDNA量を満たしていないサンプルが多数あったが，当初の予定していたフタバガキ科主要3種以外の種を含む複数種のDNAサンプルの準備が完了した。

在这项研究中，为了阐明roplastaceae树的分布区域形成的历史，这是从常规的短DNA序列分析中不清楚的，我们分析了roplast家族三个主要物种的整个叶绿体基因组数据，并阐明了遗传多样性的地理分布。在第一年，到目前为止收集的DNA样品被纯化，并从干燥的样品中重新调整了DNA。尽管许多样品没有满足足够的DNA含量来制备下一代测序样品，但是除了最初计划的焦莫西科家族的三个主要物种以外的多种DNA样品的制备已完成。

项目成果

Morphological and molecular evidence of natural interspecific hybridization between Dyera polyphylla and D. costulata in Sumatra and Kalimantan

苏门答腊岛和加里曼丹岛重叶植物与多叶植物自然种间杂交的形态学和分子证据

• 发表时间: 2022
• 作者: Aulianisa EN;Siregar UJ;Siregar IZ;Hamzah H;Ogasahara M;Kamiya K
• 通讯作者: Kamiya K

MIG-seq法を用いたフタバガキ科樹木セラヤの遺伝的変異と集団構造の評価

利用 MIG-seq 方法评价龙脑香树 Celaya 的遗传变异和种群结构

• 发表时间: 2023
• 作者: 小笠原実里;Cobb AR;Sukri RS;Metali F;田中憲蔵;米田令仁;Azani MA;Lum SKY;上谷浩一
• 通讯作者: 上谷浩一

Genetic structure and population history of a peat swamp forest tree species, Shorea albida (Dipterocarpaceae), in Brunei Darussalam

文莱达鲁萨兰国泥炭沼泽森林树种 Shorea albida（龙脑香科）的遗传结构和种群历史

• 发表时间: 2023
• 期刊: Genes & Genetic Systems
• 影响因子: 1.1
• 作者: Ogasahara M;Cobb AR;Sukri RS;Metali F;Kamiya K
• 通讯作者: Kamiya K

Leaf morphological traits of nine major tropical trees of Shorea species (Dipterocarpaceae)

龙脑香科九种主要热带乔木的叶片形态特征

• DOI: 10.13057/biodiv/d240344
• 发表时间: 2023
• 期刊: Biodiversitas Journal of Biological Diversity
• 作者: MUFARHATUN NUR;SUSILOWATI ARIDA;HILWAN IWAN;ARROFAHA NAWWALL;YULITA KUSUMADEWI SRI;DWIYANTI FIFI GUS;HIDAYAT ASEP;KAMIYA KOICHI;RACHMAT HENTI HENDALASTUTI
• 通讯作者: RACHMAT HENTI HENDALASTUTI