マダイイリドウイルス耐病形質を識別可能な遺伝マーカーの単離

鉴定红鲷虹彩病毒抗病性状的遗传标记的分离

• 批准号: 15780131
• 负责人: 坂本 崇
• 金额: $ 2.43万
• 依托单位: Tokyo University of Marine Science and Technology (2004-2005)東京水産大学 (2003)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2003
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2003 至 2005
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-15780131/
• 关键词: マイクロサテライト; 遺伝子地図; 連鎖地図; 耐病性; QTL解析; マダイ; 遺伝形質; 連鎖解析

1.マダイマイクロサテライト連鎖地図の作成昨年度までに合計132マーカー座からなるマダイマイクロサテライト連鎖地図を作成した。今年度は、昨年度開発したマイクロサテライトマーカーを用いて、新たに41マーカー座をマッピングし、合計173マーカー座を用いたマダイマイクロサテライト連鎖地図を作成した。2.マダイイリドウイルス耐病形質を識別可能な遺伝マーカーの単離(株)日本水産・中央研究所大分海洋研究センターにおいて飼育されているマダイイリドウイルス耐病性系統と感受性系統を交配したF_1家系を作出し、このF_1家系に感受性系統を戻し交配したマダイイリドウイルス耐病形質解析家系を作出した。この戻し交配家系において、マダイイリドウイルス人為感染実験を行い、各個体の表現型(生存と死亡)を評価した。各個体のゲノムDNAを抽出し、マイクロサテライトマーカーを用いてマーカー型を解析した。各個体の表現型とマーカー型との関連性を連鎖解析した結果、イリドウイルス耐性形質と関連する6マーカー座を明らかにした。さらに、この解析家系で耐病性形質と有意差な関連性みられたマーカー座に関して、遺伝的背景の異なる2家系でも連鎖解析を行った。その結果、6マーカー座のうち、2マーカー座で他の解析家系でも同様の関連性が見出された。この2マーカー座は、マダイイリドウイルス耐病形質を識別可能な遺伝マーカーとして特に有効であると考えられた。3.マダイMHC class Iとマダイイリドウイルス耐病形質との関連性の解析マダイMHC class Iをマダイマイクロサテライト連鎖地図上にマッピングした結果、マダイイリドウイルス耐病形質と関連性のあるマイクロサテライトマーカーが存在する領域と異なる領域にマッピングされた。この解析家系では、マダイMHC class Iはイリドウイルス耐性形質との関連性は低いと考えられた。

1. マ ダ イ マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト chain to 図 の done yesterday annual ま で に amounted to 132 マ ー カ ー seat か ら な る マ ダ イ マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト chain to 図 を made し た. Our は, yesterday's annual 発 し た マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト マ ー カ ー を with い て, new た に 41 マ ー カ ー seat を マ ッ ピ ン グ し, total 173 マ ー カ ー seat を with い た マ ダ イ マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト chain to 図 を made し た. 2. マ ダ イ イ リ ド ウ イ ル ス disease resistance character を identify possible な heritage 伝 マ ー カ ー の 単 from Japan's fisheries (strains), the central institute of oita ocean research セ ン タ ー に お い て rearing さ れ て い る マ ダ イ イ リ ド ウ イ ル ス disease resistance system と susceptibility を mating し た F_1 family を し, こ の F_1 family に sensibility system を 戻 し し mating Youdaoplaceholder0, ダ, ダ, リドウ, ス, disease-resistant body type analysis, family を, を, た. こ の 戻 し mating family に お い て, マ ダ イ イ リ ド ウ イ ル ス artificial infection be 験 を い, each individual の phenotype と death (survival) を review 価 し た. Each individual の ゲ ノ ム を DNA extraction し, マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト マ ー カ ー を with い て マ ー カ ー を resolving し た. Each individual の phenotype と マ ー カ ー type と の masato even sex を chain analytic し た results, イ リ ド ウ イ ル ス patience character と masato even す る 6 マ ー カ ー seat を Ming ら か に し た. Analytical family で さ ら に, こ の disease resistance character と deliberately bad な masato even sex み ら れ た マ ー カ ー seat に masato し て, but 伝 background の different な る 2 family で も chain line analytical を っ た. The results of そ そ, 6 <s:1> カ カ カ うち, 2 <s:1> <s:1> カ で で and his <s:1> analysis of the family で カ are the same. The <s:1> association が is seen as された. こ の 2 マ ー カ ー は, マ ダ イ イ リ ド ウ イ ル ス disease resistance character を identify possible な heritage 伝 マ ー カ ー と し て に had sharper で あ る と exam え ら れ た. 3. マ ダ イ MHC class I と マ ダ イ イ リ ド ウ イ ル ス disease resistance character と の masato even sex の parsing マ ダ イ MHC class I を マ ダ イ マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト chain on the ground 図 に マ ッ ピ ン グ し た results, マ ダ イ イ リ ド ウ イ ル ス disease resistance character と masato even sex の あ る マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト マ ー カ ー が exist す と る field vision な る field に マ ッ ピ ン グ さ れ た. こ の parsing family で は, マ ダ イ MHC class I は イ リ ド ウ イ ル ス patience character と の masato even sex low は い と exam え ら れ た.

项目成果

Characterization of novel microsatellite DNA markers in ayu. Plecoglossus altivelis.

香鱼中新型微卫星 DNA 标记的表征。

• 发表时间: 2006
• 期刊: Fisheries Science 72
• 作者: Hara M.;Sakamoto T.;Sekino M.;Ohara K.;Matsuda H.;Kobayashi M.;Taniguchi N.
• 通讯作者: Taniguchi N.

Structural and functional evolution of three cardiac natriuretic peptides

• DOI: 10.1093/molbev/msi243
• 发表时间: 2005-12-01
• 期刊: MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION
• 影响因子: 10.7
• 作者: Inoue, K;Sakamoto, T;Takei, Y
• 通讯作者: Takei, Y

マイクロサテライトマーカーを用いた連鎖地図作成と有用遺伝形質の解析

使用微卫星标记创建连锁图并分析有用的遗传性状

• 发表时间: 2004
• 期刊: 日本水産学会誌 70(4)
• 作者: M.Hara et al.;K.Fuji et al.;E.Ohara et al.;G.M.Perry et al.;K.Inoue et al.;R.G.Danzmann et al.;S-K Khoo et al.;坂本 崇
• 通讯作者: 坂本 崇

Maria R.M.Coimbra, et al.: "A genetic linkage map of the Japanese flounder, Paralichthys olivaceus."Aquaculure. 220. 203-218 (2003)

Maria R.M.Coimbra 等人：“日本比目鱼、Paralichthys olivaceus 的遗传连锁图。”水产养殖。

海洋生命系のダイナミクス(2)「海洋生物の機能」

海洋生物系统动力学（2）“海洋生物的功能”

• 发表时间: 2005
• 作者: M.Hara et al.;K.Fuji et al.;E.Ohara et al.;G.M.Perry et al.;K.Inoue et al.;R.G.Danzmann et al.;S-K Khoo et al.;坂本 崇;坂本 崇(分担執筆)
• 通讯作者: 坂本 崇(分担執筆)