イネの易変性ヴィレッセント変異に係る新規DNAトランスポゾンの解析

与水稻不稳定绿体突变相关的新型 DNA 转座子的分析

• 批准号: 04J09255
• 负责人: 高木 恭子
• 金额: $ 1.79万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-04J09255/
• 关键词: イネ; DNAトランスポゾン; 自律性因子; 非自律性因子; 易変性変異; トランスポゾンディスプレイ; タギング; 遺伝子機能解析; 異変性変異

本研究は、易変性ヴィレッセント変異体pyl-vから同定されたイネの新規DNAトランスポゾンnDartによる遺伝子タギング系の確立を目的としており、トランスポゾンディスプレイ(TD)等の手法を用いて新規挿入変異や自律性因子の解析を行っている。昨年度までに信頼性の高いTD実験系の確立に成功したことから、今年度は同実験系を用いてnDart関連因子の転移能および挿入部位の特徴を調査した。1.nDart関連因子の転移能調査pyl-v自殖後代集団のTD解析により、イネゲノム内に存在する7種のnDart関連因子の転移能を調査した。その結果、pyl-vの原因遺伝子に挿入したnDart因子(nDart1-0)のホモログであるnDart1-3サブグループ因子のみが高頻度に転移しており、後代にも伝達していることが明らかになった。また、nDart1-0のみを特異的に可視化するTD系を確立して解析を行った結果、新規の挿入の半分以上はnDart1-0の転移によることが明らかになった。2.nDart1-3サブグループ因子の新規挿入部位解析上記1のTD解析で検出されたnDart1-3サブグループ因子の新規挿入バンドのシーケンス解析を行い、BLAST検索に基づいて約150の挿入部位を決定した。その結果、挿入箇所は大きな偏りなく染色体全域に分布し、挿入部位には特定の認識配列も存在していなかった。また、新規挿入因子の半分以上が予測遺伝子領域(非翻訳領城も含む)に挿入しており、特に5'-非翻訳領域へ挿入しやすい傾向が明らかになった。以上の結果より、nDart1-3サブグループ因子は、特定の領域および配列への挿入制限を受けず、高頻度に遺伝子領城に挿入する傾向を持つことが明らかになった。同因子を用いた遺伝子タギングは、今後のイネの遺伝子機能解析において非常に有用な手法となると確信している。

In this study, we used the new method to analyze the different and autonomous factors in order to establish the new DNA sequence. The high reliability TD system was successfully established last year, and the characteristics of migration and entry sites were investigated this year using the correlation factors of nDart. 1. To investigate the migration energy of nDart correlation factors in pyl-v autogenetic-tree set. As a result, the pyl-v cause gene is inserted into the nDart factor (nDart1-0) and the nDart1-3 causes the gene to shift frequently. The TD system is established and analyzed. The TD system is analyzed and analyzed. The TD system is updated and analyzed. The TD system is displayed. The TD system is displayed. 2. The TD analysis of nDart1 -3 new entry factors was performed on record 1, and the BLAST analysis was performed on record 1. About 150 new entry positions were determined. As a result, there is a large number of chromosomes in the whole region, and there is a specific understanding of the alignment of the entry site. More than half of the new entry factor is expected to be detected in the sub-domain (non-inverted domain), especially in the 5'-non-inverted domain. The above results show that the nDart1-3 distribution factor is negative, the entry limit of specific domain and allocation is negative, and the entry tendency of high frequency sub-domain is negative. The same factor is used in the analysis of gene function in the future, and it is very useful to be sure

项目成果

Transposon display for active DNA transposons in rice.

• DOI: 10.1266/ggs.82.109
• 发表时间: 2007-04
• 期刊: Genes & genetic systems
• 影响因子: 1.1
• 作者: K. Takagi;N. Ishikawa;M. Maekawa;Kazuo Tsugane;S. Iida

An active DNA transposon nDart causing leaf variegation and mutable dwarfism and its related elements in rice

• DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02600.x
• 发表时间: 2006-01-01
• 期刊: PLANT JOURNAL
• 影响因子: 7.2
• 作者: Tsugane, K;Maekawa, M;Iida, S
• 通讯作者: Iida, S