配位結合性ナノチューブの動的自己集合と機能化

配位纳米管的动态自组装和功能化

基本信息

  • 批准号:
    04J10928
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.22万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 2005
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

生体内におけるペプチド鎖の認識は、オリゴペプチドを介した細胞内外での情報伝達や、タンパク-タンパク間相互作用など、生命活動における極めて重要な役割を果たしている。ペプチド鎖は種々のアミノ酸残基からなり、さらにその配列によつて様々な配座をとり得る。そのため、ペプチド配列を選択的に認識するとともに、その立体配座を制御することが実用的な観点から重要であると考えられる。我々は前年度までの研究で、配位結合性チューブ状錯体および立方八面体かご型錯体が、各種トリペプチドを配列選択的に認識することを見いだしている。そこで本年度は、配位結合性錯体のチューブ状内部空間内にペプチド鎖を包接することにより、その立体配座を制御することに成功した。本研究で用いたチューブ状錯体は、ポルフィリン多座配位子3分子とシス位を保護したパラジウム錯体6分子から自己集合する。^1H NMRよりポルフィリンチューブ錯体は、アラニンのみからなるトリペプチド(Ala-Ala-Ala配列)を効率良く包接することが分かった。さらにNMRのNOESY測定による詳細な解析を行ったところ、Ala-Ala-Ala配列の立体配座が一義的に規制されていることが示唆された。一方、より長鎖のペプチドを包接するため、さらに大きな筒状内部空間を有する中空錯体を用いて検討を行った。両末端にトリプトファン残基を有する9残基のペプチド鎖(Trp-Ala-Glu-Ala-Ala-Ala-Glu-Ala-Trp配列)と、お椀型の中空構造を有するボウル型錯体を水中で混合したところ、2分子のボウル型錯体が両末端のトリプトファン残基を認識することがNMR滴定およびDOSY測定から示唆された。その際、9残基のペプチド鎖に由来する全ての^1H NMRシグナルが高磁場シフトしていたことから、ペプチド鎖はボウル型錯体2分子から形成される筒状内部空間内にほぼ完全に取り込まれていると考えられる。さらに各種2次元NMRおよびNOESY測定から、筒状空間内に取り込まれたペプチド鎖の立体配座を検討したところ、9残基のペプチドはヘリカル構造を形成していることが示唆された。9残基のペプチド単独では水中でランダムな配座をとっているため、筒状内部空間に包接されることで本来不利なヘリカル構造が安定化されたと考えられる。
In vivo, the understanding of the key factors, the selection of the key factors, the information transmission, the interaction between the key factors, the vital activities, and the effects of the key factors are discussed. The acid residues in the seed are removed from the seed, and the amino acid residues in the seed are removed from the seed. For example, if you want to use a computer, you can use a computer. In the past year, we have studied the coordination binding between the tetrahedral and cubic octahedral complexes, and the understanding of the coordination selection between the tetrahedral and cubic octahedral complexes. This year, the coordination binding complex was successfully controlled in the internal space of the shell. In this study, we used the multi-site ligand 3 molecule to protect the multi-site ligand 6 molecule from self-assembly. 1H NMR spectrum analysis shows that the 1H NMR spectrum analysis is very efficient. The detailed analysis of NOESY by NMR and the regulation of Ala-Ala-Ala-Ala- A square, long lock, and a large cylindrical inner space are used for the discussion. 9 residues of Trp-Ala-Glu-Ala-Glu-Ala-Trp alignment and 2 residues of Trp-Ala-Glu-Ala-Trp alignment were identified by NMR titration and DOSY determination. 1H NMR spectra of the 9-residue residue residues were obtained from the high magnetic field, and the 9-residue residues were obtained from the cylindrical interior space. All kinds of 2D NMR and NOESY measurements were carried out in the cylindrical space. 9 residues are isolated from the water, and the cylindrical internal space is surrounded by a stable structure.

项目成果

期刊论文数量(5)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Folding a De Novo Designed Peptide into an α-Helix through Hydrophobic Binding by a Bowl-Shaped Host
通过碗形宿主的疏水结合将从头设计的肽折叠成 α-螺旋
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kato;D;Nakagawa M;Y.Yamaguchi et al.;H.Sasakawa et al.;S.Tashiro et al.;M.Kawasaki et al.;M.Nakasako et al.;M.Akutsu et al.;S.Tashiro et al.
  • 通讯作者:
    S.Tashiro et al.
Selective recognition of Trp- and Tyr-rich oligopeptides by self-assembled coordination hosts
Peptide Recognition : Encapsulation and α-Helical Folding of a Nine-Residue Peptide within a Hydrophobic Dimeric Capsule of a Bowl-Shaped Host
肽识别:碗状宿主疏水二聚体胶囊内九残基肽的封装和 α 螺旋折叠
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    S.Tashiro;M.Tominaga;Y.Yamaguchi;K.Kato;M.Fujita
  • 通讯作者:
    M.Fujita
A 3.5-nm coordination nanotube.
  • DOI:
    10.1021/ja047048n
  • 发表时间:
    2004-08
  • 期刊:
  • 影响因子:
    15
  • 作者:
    Takumi Yamaguchi;S. Tashiro;Masahide Tominaga;M. Kawano;T. Ozeki;M. Fujita
  • 通讯作者:
    Takumi Yamaguchi;S. Tashiro;Masahide Tominaga;M. Kawano;T. Ozeki;M. Fujita
Sequence-selective recognition of peptides within the single binding pocket of a self-assembled coordination cage.
  • DOI:
    10.1021/ja044782y
  • 发表时间:
    2005-03
  • 期刊:
  • 影响因子:
    15
  • 作者:
    S. Tashiro;Masahide Tominaga;M. Kawano;B. Therrien;T. Ozeki;M. Fujita
  • 通讯作者:
    S. Tashiro;Masahide Tominaga;M. Kawano;B. Therrien;T. Ozeki;M. Fujita
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田代 省平其他文献

Pd(II)錯体集積型結晶の表面における金平糖型金ナノ粒子の形状選択的ワンステップ合成
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山下 優太郎;田代 省平;石井 義記;内橋 貴之;塩谷 光彦
  • 通讯作者:
    塩谷 光彦
ハロゲン結合と水素結合からなるチューブ状包接結晶におけるゲスト分子の可逆的フリッピング挙動の制御
由卤素键和氢键组成的管状夹杂晶体中客体分子可逆翻转行为的控制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山下 優太郎;田代 省平;塩谷 光彦
  • 通讯作者:
    塩谷 光彦
ハロゲン結合と水素結合からなるチューブ状包接結晶の構築とゲスト分子の可逆的フリッピング挙動
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山下 優太郎;田代 省平;塩谷 光彦
  • 通讯作者:
    塩谷 光彦
Records of Mao’s Militia: a brief overview of county-level archival resources regarding post-1949 militia organizations in the Yangtze Delta
毛泽东民兵记录:1949年后长三角民兵组织县级档案资源简述
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山下 優太郎;田代 省平;塩谷 光彦;GAO XIAOYAN
  • 通讯作者:
    GAO XIAOYAN

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