高次元データによる複雑非線形現象解明のための柔軟な統計モデルの理論・方法論の研究
高次元データによる複雑非線形現象解明のための柔軟な統計モデルの理論・方法論の研究
批准号:
15700231
负责人:
井元 清哉
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
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英文摘要
平成16年度に行った研究について以下にまとめます.(1)数千というオーダーの超多数確率変数の関連,特に因果関係を捉えるために平成15年度はベイジアン・ネットワークとノンパラメトリック回帰を組み合わせた統計モデルを提案し,その有効性をcDNAマイクロアレイによって観測された遺伝子発現データの解析を通し検討した.しかしながら,超多数の確率変数の関連を有向グラフ(directed graph)によってモデリングする際,観測されるデータのみからの推測では,そのサンプルサイズ,含まれる情報量から明らかな限界があること分かった.そのような場合,グラフ構造の事前知識を用いることが極めて有効であると考え,目的となる確率変数の関連・因果関係を表す有向グラフを推定するためのあらゆる知識,利用可能な様々なデータを階層モデルにまとめ,それらを統合するベイズモデルを構成した.(2)癌の分類・予測を目的に観測されたマイクロアレイ遺伝子発現データのクラスタリングに対しては従来の混合分布に基づく方法は,モデルに含まれる超多数のパラメータのため過適合をおこし有効に働かない.そこで因子分析の方法を拡張した超高次元特徴ベクトルを有する少数サンプルのクラスタリングのための手法(Mixed Factors Analysis)を開発した.
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Nakamichi R. et al.: "Case-control study of binary trait considering interactions between SNPs and environmental effects using logistic regression"Proc. 4th IEEE Bioinformatics and Bioengineering. in press. (2004)
Nakamichi R.等人:“使用逻辑回归考虑SNP与环境影响之间相互作用的二元性状病例对照研究”Proc。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Imoto S. et al.: "Bayesian network and nonparametric heteroscedastic regression for nonlinear modeling of genetic network"Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 1(2). 231-252 (2003)
Imoto S.等人:“用于遗传网络非线性建模的贝叶斯网络和非参数异方差回归”生物信息学和计算生物学杂志。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Imoto S. et al.: "Bayesian network and nonparametric heteroscedastic regression for nonlinear modeling of genetic network"Proc. 2nd IEEE Computational Systems Bioinformatics. 104-113 (2003)
Imoto S. 等人:“用于遗传网络非线性建模的贝叶斯网络和非参数异方差回归”Proc。
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
10.1109/csb.2004.13
发表时间:
2004-08
期刊:
Proceedings. 2004 IEEE Computational Systems Bioinformatics Conference, 2004. CSB 2004.
影响因子:
--
作者:
[Ryo Yoshida;T. Higuchi;S. Imoto]
通讯作者:
Ryo Yoshida;T. Higuchi;S. Imoto
Residual Bootstrapping and Median Filtering for Robust Estimation of Gene Networks from Microarray Data
残差引导和中值过滤用于从微阵列数据中稳健估计基因网络
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Computational Methods in Systems Biology, Lecture Notes in Bioinformatics
影响因子:
--
作者:
[中原淳, 西森年寿, S.Imoto]
通讯作者:
S.Imoto
共 7 条
疾患メタゲノム解析による腸内微生物叢の臓器機能評価のための情報基盤技術の開発
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批准号:21H03538
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.15万
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财政年份:2021
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负责人:井元 清哉
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依托单位:
生体内分子ネットワークに基づく大規模がんゲノムデータ解析の方法論の研究
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批准号:10F00364
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2010
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负责人:井元 清哉
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依托单位:
確率ネットワークモデルに基づく高次情報バイオマーカー探索多変量統計手法の開発
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批准号:20650039
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.05万
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财政年份:2008
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负责人:井元 清哉
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依托单位:
高次非線形データ解析の理論と方法論の研究
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批准号:99J03280
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.15万
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财政年份:1999
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负责人:井元 清哉
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依托单位:
海外基金