特異的糖鎖構造認識能を有する機能性ペプチドアレイの構築
特異的糖鎖構造認識能を有する機能性ペプチドアレイの構築
批准号:
15710157
负责人:
坂本 清志
金额:
$2.37万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004
中文摘要
本研究では、任意の糖鎖構造を高親和的かつ高選択的に認識可能な機能性ポリペプチドの構築を第一段階の目標とした。その目的をふまえ、α-ヘリックス構造やβ-ターン構造を形成すべくde novo設計したポリペプチド高次構造の化学合成を行った。さらに、設計したポリペプチド高次構造を基体として、人工機能性基であるボロン酸基の位置特異的導入を試みた。次いで、任意の糖分子に対して結合部位を最適化するため、ボロン酸導入位置周辺の数残基を19種の標準アミノ酸でランダム化したペプチドライブラリを、スプリット・ミックス法やパラレル合成法で調製した。蛍光ラベルしたオリゴ糖分子や糖ユニットを含む補酵素であるフラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)を基質としたスクリーニングの結果、格糖認識能を有する機能性ペプチド分子の獲得に成功した。得られた数種のポリペプチドの一次配列解析によって、効率的糖ユニット結合に必要となるファクターを分子レベルで見いだすことができた。また、得られたペプチド配列情報をもとに設計・合成した人工ペプチドは、溶液中で安定な高次構造を形成し、糖基質やFADを高い親和性と選択性をもって結合可能であることが明らかとなった。以上より、糖-ペプチド複合体形成に必要ないくつかのポリペプチド高次構造要素を確立することが出来た。また、得られた人工ペプチド配列と天然タンパク質の複合化に基づく新規融合タンパク質の構築も試みた。さらに、ペプチドライブラリの固相上への固定化を行い、糖鎖認識ペプチドアレイの構築を達成した。固相表面上での人工ペプチドの糖鎖認識機能を詳細かつ系統的に評価し、人工設計ペプチドアレイの性能を明らかとした。
英文摘要
本研究では、任意の糖鎖構造を高親和的かつ高選択的に認識可能な機能性ポリペプチドの構築を第一段階の目標とした。その目的をふまえ、α-ヘリックス構造やβ-ターン構造を形成すべくde novo設計したポリペプチド高次構造の化学合成を行った。さらに、設計したポリペプチド高次構造を基体として、人工機能性基であるボロン酸基の位置特異的導入を試みた。次いで、任意の糖分子に対して結合部位を最適化するため、ボロン酸導入位置周辺の数残基を19種の標準アミノ酸でランダム化したペプチドライブラリを、スプリット・ミックス法やパラレル合成法で調製した。蛍光ラベルしたオリゴ糖分子や糖ユニットを含む補酵素であるフラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)を基質としたスクリーニングの結果、格糖認識能を有する機能性ペプチド分子の獲得に成功した。得られた数種のポリペプチドの一次配列解析によって、効率的糖ユニット結合に必要となるファクターを分子レベルで見いだすことができた。また、得られたペプチド配列情報をもとに設計・合成した人工ペプチドは、溶液中で安定な高次構造を形成し、糖基質やFADを高い親和性と選択性をもって結合可能であることが明らかとなった。以上より、糖-ペプチド複合体形成に必要ないくつかのポリペプチド高次構造要素を確立することが出来た。また、得られた人工ペプチド配列と天然タンパク質の複合化に基づく新規融合タンパク質の構築も試みた。さらに、ペプチドライブラリの固相上への固定化を行い、糖鎖認識ペプチドアレイの構築を達成した。固相表面上での人工ペプチドの糖鎖認識機能を詳細かつ系統的に評価し、人工設計ペプチドアレイの性能を明らかとした。
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
登录
查看更多内容
Design of FAD-binding Peptide Using a Combinatorial α-Helix Peptide Library
使用组合 α-螺旋肽库设计 FAD 结合肽
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Chemistry Letters 33・8
影响因子:
--
作者:
[Seiji Sakamoto, Ippei Okano, Kazuaki Kudo]
通讯作者:
Kazuaki Kudo
Seiji Sakamoto, Ippei Okano, Kazuaki Kudo: "De Novo Design and Split Synthesis of an α-Helix Peptide Library Posessing an Artificial Sugar-Binding Site"Peptide Science 2003. 425-428 (2004)
Seiji Sakamoto、Ippei Okano、Kazuaki Kudo:“具有人工糖结合位点的 α-螺旋肽库的从头设计和拆分合成”肽科学 2003. 425-428 (2004)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Artificial Assembly of Myoglobin and Flavodoxin Reductase Using Designed Coiled-coil Peptides
使用设计的卷曲螺旋肽人工组装肌红蛋白和黄素氧还蛋白还原酶
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Chemistry Letters 33・9
影响因子:
--
作者:
[Seiji Sakamoto, Atsushi Ito, Kazuaki Kudo]
通讯作者:
Kazuaki Kudo
DOI:
--
发表时间:
2005
期刊:
Peptide Science 2004 (In press)
影响因子:
--
作者:
[Seiji Sakamoto, Kazuaki Kudo]
通讯作者:
Kazuaki Kudo
Seiji Sakamoto, Atsushi Itoh, Kazuaki Kudo, Susumu Yoshikawa: "De Novo Design, Synthesis, and Function of Semi-Artificial Myoglobin Conjugated with Coiled-Coil Two-α-Helix Peptides"Chemistry-A European Journal. (in press). (2004)
Seiji Sakamoto、Atsushi Itoh、Kazuaki Kudo、Susumu Yoshikawa:“与卷曲螺旋二螺旋肽结合的半人工肌红蛋白的从头设计、合成和功能”化学-A 欧洲期刊(出版中)。 )
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
内在性GABA(A)受容体のケミカルラベルを基軸とする薬剤アッセイ系の構築
-
批准号:23K04960
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
-
资助金额:$3.0万
-
财政年份:2023
-
负责人:坂本 清志
-
依托单位:
タンパク質活性中心近傍における特異的基質認識部位・機能制御部位の人工構築
-
批准号:17710180
-
项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
-
资助金额:$2.24万
-
财政年份:2005
-
负责人:坂本 清志
-
依托单位:
人工ヘムタンパク質の創製とその人工進化に基づく選択的ヘム機能の発現および制御
-
批准号:98J00160
-
项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
-
资助金额:$1.15万
-
财政年份:1998
-
负责人:坂本 清志
-
依托单位:
海外基金