Identifications of small molecule drug-binding proteins by using the affinities

利用亲和力鉴定小分子药物结合蛋白

基本信息

批准号：
16310155
负责人：
SUGAWARA Fumio
金额：
$ 10.11万
依托单位：
Tokyo University of Science
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2006
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16310155/
关键词：
anti-cancer drug camptothecin etoposide phage display binding protein receptor SPR QCM 医薬 FKBP 抗癌剤プロスタグランディン G-タンパク質表面プラズモン共鳴クオーツマイクロバランス振動法オーファン受容体 EP1 E2F

项目摘要

This research subject aimed to develop new and facile methods to identify drug targeted binding proteins.In 2004 and 2005, we studied on two anti-cancer drugs, camptothecin and etoposide as ligand to identify the binding proteins as receptors. The affinities between drug small molecules and binding proteins have been applied for our phase display screenings, which will give us high affinity phage particles displaying drug binding proteins and/or peptides. Based on the cDNA sequence data composed of the selected phages, the homology search with BLAST or FASTA program informed us that camptothecin receptor can be a prostaglandin receptor EP1 and etoposide receptor can be a transcription factor E2F. We established those bindings by SPR (surface plasmon resonance) and/or QCM (quartz crystal micro balance).In 2006, we improved two methods. First, we employed PEG (polyethylene glycerol) beads for organic synthesis to avoid non-specific bindings between drug and proteins. Second, we immobilized ligand on a gold QCM sensor chip to afford "self-assembled membrane". In either case, we successfully identified FKBP12 as a receptor of SLF as a ligand.Overall, we have successfully identified new target molecules of anti-cancer drugs with our improved methods. It can be expected to identify both binding proteins and receptors for drugs and other biological important small molecules.

这项研究主题旨在开发新的，便捷的方法来鉴定有靶向的结合蛋白。在2004年和2005年，我们研究了两种抗癌药物，凸甲状腺素和依托泊苷作为配体，以识别结合蛋白作为受体。药物小分子与结合蛋白之间的亲和力已应用于我们的相位显示筛选，这将为我们提供高亲和力的噬菌体颗粒，显示药物结合蛋白和/或肽。基于由选定的噬菌体组成的cDNA序列数据，使用BLAST或FASTA程序的同源搜索告诉我们，Camptothecin受体可以是前列腺素受体EP1 EP1，而依托泊苷受体可以是转录因子E2F。我们通过SPR（表面等离子体共振）和/或QCM（石英晶体微平衡）建立了这些结合。在2006年，我们改进了两种方法。首先，我们使用PEG（聚乙烯甘油）珠进行有机合成，以避免药物和蛋白质之间的非特异性结合。其次，我们将配体固定在金QCM传感器芯片上，以提供“自组装膜”。无论哪种情况，我们都成功地将FKBP12鉴定为SLF的受体。随后，我们通过改进的方法成功地确定了抗癌药物的新靶标分子。可以预期，可以鉴定药物和其他生物学重要小分子的结合蛋白和受体。

项目成果

期刊论文数量（163）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Pseudodeflectusin, a novel isochroman derivative from Aspergillus pseudodeflectus a parasite of the sea weed, Sargassum fusiform, as a selective human cancer cytotoxin

DOI：
10.1016/j.bmcl.2004.04.050
发表时间：
2004-07-05
期刊：
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS
影响因子：
2.7
作者：
Ogawa, A;Murakami, C;Mizushina, Y
通讯作者：
Mizushina, Y

生理活性物質Sulfoquinovosylacylglycerolの生体内標的分子検索

体内靶分子寻找生物活性物质磺基喹诺酰基甘油

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
札幌医科大学医学部付属臨海医学研究所紀要 6
影响因子：
0
作者：
Satoko Aoki;Keisuke Ohta;F.Sugawara;K.Sakaguchi
通讯作者：
K.Sakaguchi

Structural relationship of cureumin derivatives binding to the BRCT domain of human DNA polymerase lambda.

姜黄素衍生物与人 DNA 聚合酶 lambda 的 BRCT 结构域结合的结构关系。

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Genes Cells. 11
影响因子：
0
作者：
Takeuchi T;Ishidoh T;Iijima H;Kuriyama I;Shimazaki N;Koiwai O;Kuramochi K;Kobayashi S;Sugawara F;Sakaguchi K;Yoshida H;Mizushina Y
通讯作者：
Mizushina Y

Structural relationship of curcumin derivatives binding to the BRCT domain of human DNA polymerase lambda

姜黄素衍生物与人 DNA 聚合酶 lambda BRCT 结构域结合的结构关系

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Genes Cells. 11
影响因子：
0
作者：
Takeuchi T;Ishidoh T;Iijima H;Kuriyama I;Shimazaki N;Koiwai O;Kuramochi K;Kobayashi S;Sugawara F;Sakaguchi K;Yoshida H;Mizushina Y
通讯作者：
Mizushina Y

Total synthesis and stereochemistry of the antitumor antibiotics PD 113,271

抗肿瘤抗生素的全合成和立体化学 PD 113,271