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PCB分解土壌細菌のカタボライト調節メカニズムの解明

阐明土壤多氯联苯降解细菌的分解代谢调节机制

基本信息

批准号：
16780050
负责人：
大坪嘉行
金额：
$ 2.37万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至 2005
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-16780050/
关键词：
カタボライト調節 beta-proteobacteria 二成分調節系

项目摘要

1)Psudomonas sp. KKS102のrDNAの塩基配列を決定したところ、KKS102株はbeta-proteobacteriaであるAcidovorax属に属することが明らかとなった。2)KKS102のビフェニルPCB分解代謝オペロンのpEプロモーターのカタボライト調節メカニズムの解明を引き続き行った。昨年度までの研究によりカタボライト調節に関与する遺伝子として二成分制御系のセンサーキナーゼ(BphP)およびレスポンスレギュレーター(BphQ)をコードする遺伝子が取得され、その遺伝子破壊株が作製されていた。またpEプロモーターのカタボライト調節はBphQによる転写活性化を各種炭素源が阻害することがその本質であることが明らかにされていたが、どのようにしてBphQの活性が調節されているかについては未解明であった。BphQの転写レベルがコハク酸によって変化しないことがLacZをレポーターとしたアッセイ系により明らかとなったこと、人工的なプロモーター下でbphQを発現させてもカタボライト調節が見られることから、bphQが何らかの転写後制御を受けていることが示唆された。レスポンスレギュレーターはそのおよそ55番目付近に存在するアスパラギン酸のリン酸化によってその活性が制御される例が広く知られている。そこでこの残基(実際は58番目のアスパラギン酸残基)に変異を入れたbphQ遺伝子をbphPQの破壊株に導入した株を作製し解析したところ、通常のカタボライト調節が観察されこのアミノ酸残基がカタボライト調節に関与していることが否定された。以上、pEプロモーターのBphQによるカタボライト調節にはbphQの転写後制御が関わることが示唆されるとともに、BphQが従来知られているレスポンスレギュレーターと異なり、その活性調節にアスパラギン酸55が関与しないことが明らかとなった。

1)KKS 102 strain is a member of the genus Acidovorax. 2) KKKS 102's PCB In the past year, the research has focused on the regulation of gene expression and gene expression in two-component control systems, such as gene expression and gene expression (BphP), gene expression and gene expression (BphQ). The activity of BphQ is regulated by the regulation of BphQ activity and the regulation of BphQ activity by the regulation of BphQ activity. Since the writing element of BphQ can be changed to a constant level and the LacZ can be replaced with a constant level of functionality, bphQ can be displayed under the artificial NAPRO monitor and the manual keyboard control can be seen, and the post-writing control of bphQ can be improved. The activity of the enzyme is controlled by the presence of 55 enzymes. The residue (in fact, 58 amino acid residues) is different from that of bphQ gene, and the plant is introduced into bphPQ gene. The above, pE, BphQ, BphQ, BphQ,

项目成果

期刊论文数量（6）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

High-temperature-induced transposition of IS elements in Burkholderia multivorans ATCC 17616

高温诱导的多食伯克霍尔德菌 ATCC 17616 中 IS 元件的转位

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Applied and Environmental Microbiology 71
影响因子：
0
作者：
Ote;M.;Mita;K.;Kawasaki;H.;Daimon;T.;Kobayashi;M.;Shimada;T.;Yoshiyuki Ohtsubo
通讯作者：
Yoshiyuki Ohtsubo

Organization and localization of the dnaA and dnaK gene regions on the multichromosomal genome of Burkholderia multivorans ATCC 17616.

多食伯克霍尔德氏菌 ATCC 17616 多染色体基因组上 dnaA 和 dnaK 基因区域的组织和定位。

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
J. Biosci. Bioeng 99
影响因子：
0
作者：
Nagata;Y.;5人;Tsuda;M
通讯作者：
M

Distribution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes on three replicons in Sphingobium japonicum UT26

日本鞘氨醇UT26 3个复制子上γ-六氯环己烷降解基因的分布

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
FEMS Microbiol. Lett. 256
影响因子：
0
作者：
Nagata;Y. et al.
通讯作者：
Y. et al.

Functional analysis of unique class II insertion sequence IS 1071

独特的 II 类插入序列 IS 1071 的功能分析

DOI：
发表时间：
2006
期刊：
Applied and Environmental Microbiology 72
影响因子：
0
作者：
Shunsuke Funaguma;Shin-ichi Hashimoto;Yutaka Suzuki;Naoko Omuro;Sumio Sugano;Kazuei Mita;Susumu Katsuma;Toru Shimada;Kiwamu Minamisawa;Naofumi Ito;Masahiro Sota
通讯作者：
Masahiro Sota

Two rhizobial strains, Mesorhizobium loti MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum USDA110, encode haloalkane dehalogenases with novel structures and substrate specificities

两种根瘤菌菌株，Mesorhizobium loti MAFF303099 和 Bradyrhizobium japonicum USDA110，编码具有新颖结构和底物特异性的卤代烷脱卤酶

DOI：
发表时间：
2005
期刊：
Applied and Environmental Microbiology 71
影响因子：
0
作者：
Daimon;T.;Katsuma;S.;Iwanaga;M.;Kang;W.-K.;Shimada;T.;Yukari Sato
通讯作者：
Yukari Sato

DOI：
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大坪嘉行其他文献

Isolation of aromatic ring-hydroxylating oxygenase genes by cultivation-independent functional screening of metagenome from soil artificially contaminated with aromatic hydrocarbons

通过对人工芳香烃污染土壤中的宏基因组进行独立于培养的功能筛选来分离芳香环羟基化加氧酶基因

DOI：
发表时间：
2012
期刊：
影响因子：
0
作者：
大坪嘉行;奥野周;永田裕二;津田雅孝;大畑智史ら;永山浩史ら;H. Kato et al.;M. Tabata et al.;Y. Nagata et al.;H. Nagayama et al.
通讯作者：
H. Nagayama et al.