金属錯体・DNA複合超分子.二次元情報グリッドの創製

金属配合物/DNA复合超分子。二维信息网格的创建

基本信息

  • 批准号:
    16750148
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.98万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
  • 财政年份:
    2004
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2004 至 2005
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究では、DNAにより構成される2次元基盤及び、基盤の塩基配列情報を読み出す分子としての亜鉛フィンガータンパク質に金属錯体を結合したユニットにより、機能性物質群を分子レベルで精緻に配置することを目的をとして研究を行った。本研究の開始時点では、DNAの格子としてポルフィリン分子を使いグリッド化を検討したが、より効率的な手法としてDNAのみからなる2次元DNA基盤となるDXモチーフを使用した。また、機能部位の配列するユニットである2ユニットの亜鉛フィンガーと金属錯体を結合したユニットの合成を行った。ZFとしてGGGGCGを認識する2ドメインのF1F2、および、トリスビピリジンRu(II)及び、Os(II)錯体を結合したフィンガーの合成に成功した。基盤のDXには4または5本鎖からなる数種類があるが、本研究では5本鎖からなる逆平行型のDXを用いた。X線構造解析により明らかにされたDNAのZF結合部位とZF本体の空間配置を考慮して、認識塩基配列のDX内での位置を設計した。ZFとDXとの結合及び相互作用についてはゲルシフトアッセイ(EMSA)を用いて調べた。EMSA実験でのDXは全て[γ-^<32>P]ATPで1つのssDNAを5' -末端標識後に、アニーリングしたものを用いた。認識部位の位相、位置、数を変えた様々なテンプレートを用いてスクリーニングを行い、DX分子をテンプレートに用いることによって、金属錯体間の距離を精密に制御して多数配列した系を構築できることを明らかにした。また、ジンクフィンガーによる機能部位配列と組み合わすことができる新しいDNA基盤分子として、リンカーを介して金属ポルフィリンを結合した2重鎖DNAの合成にも成功した。
This study aims to investigate the molecular structure of DNA and the molecular structure of DNA. At the beginning of this study, DNA molecules were used in the study of DNA synthesis and efficiency. The combination of the functional sites and the metal complexes ZF GGCG recognizes the two components of F1F2, Ru(II) and Os(II), and successfully synthesizes them. The DX of the base plate is 4 × 5 X-ray structural analysis of DNA binding sites and the spatial arrangement of ZF bodies should be considered to understand the position of ZF alignment within DX. ZF and DX combine and interact with each other. EMSA implements DX complete with [γ-^<32>P]ATP, 1-ssDNA, 5' -terminal marker, and 5-terminal marker. The phase, position and number of recognition sites are precisely controlled, and the distance between metal and DX molecules is precisely controlled. A new DNA template was synthesized.

项目成果

期刊论文数量(1)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Roles of the Invariant Peptide Fragment Forming NH…O....
形成 NH…O… 的不变肽片段的作用
  • DOI:
  • 发表时间:
    2005
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山村晃;佐々木康司;田中香織;森松依子;関口喜則;松本邦男;小野田 晃
  • 通讯作者:
    小野田 晃
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  • 通讯作者:
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