多細胞生物の発生における糖鎖発現パターンの体系的技術と解析ソフトの開発

开发多细胞生物发育过程中糖链表达模式的系统技术和分析软件

• 批准号: 17700296
• 负责人: 伊藤 將弘
• 金额: $ 2.37万
• 依托单位: Ritsumeikan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2005
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2005 至 2006
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17700296/
• 关键词: 分子表現型; 糖脂質; MALDI-TOF MS; 構造予測プログラム; 細胞内局在; 脊索動物; ゲノムワイド解析; 比較グリコオーム; MALDI TOF MS; 構造予測システム; 酸性糖脂質; スルファチド; ウロン酸含有糖脂質; ホヤ

糖脂質は,細胞間認識等の機能を持つ物質交代で生合成される物質であるが,糖脂質の研究例は乏しく,ゲノムワイド解析の技術も開発されていない.そこで本年度は,ゲノムワイド解析技術の開発とマボヤの糖脂質構造と細胞局在を決定した.(1)糖脂質構造予測システムの構築半システムは,PSD解析データからフラグメント抽出プログラムにより抽出したフラグメント間の分子量差から構成糖を予測し,(1)この操作を親マスから順に行うことで糖鎖配列を作成する,(2)作成された糖鎖配列から還元末端糖を見出す,(3)その糖鎖配列を基に糖鎖構造を推測し,推測構造をPSD解析した場合に観測されうるフラグメントを作成し,実際の観測データとマッチングすることで,糖鎖構造予測を行う,(4)出力の順位付けは,予測に用いたフラグメントのイオン強度和の降順とした.予測精度の検証は,計算により予測対象となる全ての構造の擬似フラグメントを作成し,それを入力データとして調べたところ,全ての予測対象構造が1位に予測され,ノイズを混入した場合でも正解構造が上位に予測されることを確認した.そこで,本システムを用いて,既知8構造に対して予測を行ったところ,全構造に対して上位(1位は7/8)に予測された.(2)マボヤHalocynthia roretz/糖脂質の組識別分布解析我々の研究室では,脊椎動物や発生のモデル生物であるホヤのスフィンゴ糖脂質構造解析を進め,新規の糖脂質化学構造を決定してきている.マボヤH.roretziこおいては,新規酸性糖脂質と数種類の中性糖脂質の構造を決定している.本研究では,その機能解明に向け,まずはそれら糖脂質の組織別分布を,肝膵臓とそれ以外の組織(主に筋膜体等)の2つに分画して調べた.肝膵臓と筋膜体等において,弱アルカリ安定脂質画分中の総糖脂質画分の割合はそれぞれ28.1%と3.2%で,総糖脂質画分中の酸性糖脂質画分の割合は77.1%と29.2%であった.

Glycolipids, intercellular intelligence and other mechanisms can be used to account for the production of synthetic compounds, the study of glycolipids is not available, and the technology is used to analyze the technology. In the current year, the analytical technology is in operation. (1) the glycolipid system is used to determine the molecular weight of sugar and lipids. (1) the structure of glycolipid is determined. (1) the structure of glycolipid is determined. The molecular weight difference of glycolipid and the molecular weight difference of glycolipid are determined by PSD analysis. (1) make sure that the sugar is arranged in a row, (2) make it into a sugar column, (2) make a sugar column, (2) make Sugar is made to the market, and (4) to pay for the price, and to pay for the strength and decrease of the strength. In order to improve the accuracy, calculate the accuracy of the system, and calculate the accuracy of the system. In our laboratory, we know that 8-year-old products are used in the first place, and that the whole system (1 bit 7-bit 8) is used. (2) the distribution of Halocynthia roretz/ glycolipids is analyzed in our laboratory, and spinal animals are used in laboratory experiments. The new rule of glycolipid chemical production determines the concentration of sugar and lipid. The production of new acid glycolipids, such as neutral glycolipids, determines the concentration of H.roretzi. In this study, the machine was able to understand the orientation, the tissue distribution of glycolipid, and the distribution of liver tissue (main fascia, etc.). The liver, fascia, body, etc., the liver, fascia, etc.

项目成果

Isolation and characterization of two novel uronic acid-containing acidic glycosphingolipids from the ascidian, Halocynthia roretzi

海鞘中两种新型含糖醛酸酸性鞘糖脂的分离和表征

• 期刊: Glycobiology submitted
• 作者: Masahiro Ito;Yuki Matsumuro;So yamada;Tomonori Kitamura;Saki Itonori;Mutsumi Sugita
• 通讯作者: Mutsumi Sugita

Prediction of the O-glycosylation Sites in Protein by Layered Neural Networks and Support Vector Machines

• DOI: 10.1007/11893004_122
• 发表时间: 2006-10
• 作者: I. Nishikawa;Hirotaka Sakamoto;Ikue Nouno;T. Iritani;K. Sakakibara;M. Ito

油脂・脂質の基礎と応用-栄養・健康から工業まで-

油脂的基础知识和应用——从营养健康到工业——

• 发表时间: 2005
• 作者: Masahiro Ito;Yuki Matsumuro;So yamada;Tomonori Kitamura;Saki Itonori;Mutsumi Sugita;日本油化学編(第4章分担)
• 通讯作者: 日本油化学編(第4章分担)

A novel sulfatide, GlcCer-16 sulfate, from ascidian Ciona intestinalis

来自海鞘海鞘的新型硫苷脂 GlcCer-16 硫酸盐

• 发表时间: 2007
• 期刊: Journal of Oleo Science 56
• 作者: So Yamada;Yuki Matsumuro;Takashi Inoue;Tomonori Kitamura;Saki Itonori;Mutsumi Sugita;Masahiro Ito
• 通讯作者: Masahiro Ito

Isolation and characterization of a novel uronic acid-containing acidic glycosphingolipid from the ascidian, Halocynthia roretzi

海鞘中新型含糖醛酸酸性鞘糖脂的分离和表征

• 发表时间: 2007
• 期刊: Journal of Lipid research 48
• 作者: Masahiro Ito;Yuki Matsumuro;So Yamada;Tomonori Kitamura;Saki Itonori;Mutsumi Sugita
• 通讯作者: Mutsumi Sugita