Phylogeography of the dense populations of Ophiura sarsii on the upper continental slope

上大陆坡沙氏蛇尾密集种群的系统发育地理学

• 批准号: 18570099
• 负责人: FUJITA Toshihiko
• 金额: $ 2.07万
• 依托单位: National Museum of Nature and Science, Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-18570099/
• 关键词: 棘皮動物; クモヒトデ類; 深海; 遺伝子交流; 地理的分布; 高密度ベッド; cox1; ctb; 種分化; 個体群; coxl

北日本の深海底に広がるキタクシノハクモヒトデ高密度ベッドの遺伝的構造を調べるために, ミトコンドリアDNAの塩基配列により, 系統地理学的な解析を行った. シトクロームc酸化酵素サブユニット1(cox1)の部分配列(1285 bp)およびシトクロームb(ctb)の全長(1141bp)を太平洋, オホーツク海, 日本海から採集した39個体について決定した. 調査海域を, 北海道~北東北沖の太平洋, 南東北沖の太平洋, 日本海, オホーツク海の4海域に分け, それぞれの地域集団として解析を行ったところ, cox1には20種類のハプロタイプが認められ, そのうち4種類のハプロタイプが2つの海域に2種類のハプロタイプが3つの海域に出現した. ctbでは26種類のハプロタイプが認められ, そのうち3種類のハプロタイプが2つの海域に出現した. cox1の塩基多様度はオホーツク海が他の3海域よりも低く, ctbでは北海道~北東北沖の太平洋が他の海域よりも高かった. ペアワイズFst値で遺伝的な類似度を比較すると, cox1では北海道~北東北沖の太平洋と日本海の間, 北海道~北東北沖の太平洋とオホーツク海の間で, ctbでは北海道~北東北沖の太平洋と他の3海域との間で有意差が認められた. これらの結果から, 海域間の遺伝的交流が多少ともあるものの, 海域による遺伝的構造の差が認められることが示唆された.キタクシノハクモヒトデの亜種とされているエゾクシノハクモヒトデは, 日本海だけでなく東北沖の太平洋にも出現することがわかった. 分布水深はやや重なり同所的に出現する場所もあり, また, 形態的な差は明瞭であるものの中間形と思われる個体も稀に見つかることから, 両種間の系統関係をさらに詳細に調べる必要があることがわかった.

为了研究北部海洋高密度床的遗传结构，使用线粒体DNA的碱基序列进行了植物地理分析。细胞色素C氧化酶亚基1（COX1）（1285 bp）的子序列和细胞色素B（CTB）（1141 bp）的总长度是从太平洋，Okhotsk海和日本海中收集的39个个体的。调查区分为四个地区：北海道海岸东北东北部，东北东北沿岸的太平洋，日本海和俄克斯海海，分析是作为当地集团进行的。 COX1中有20个单倍型，其中4种单倍型出现在两个区域，两种类型的单倍型出现在三个区域。在CTB中观察到26个单倍型，其中三个出现在两个水域中。 Okhotsk海中COX1的核苷酸多样性低于其他三个水域，而北海道海岸到CTB东北部东北部的太平洋高于其他水域。将遗传相似性与成对的FST值进行比较，北海道沿岸与东北东北部之间的太平洋之间存在显着差异，在北海道海岸与东北东北部之间的太平洋之间以及北东北沿岸东北东北部到东北东部和其他三个Waters的太平洋之间。这些结果表明，尽管海洋之间存在一些遗传交换，但海洋之间的遗传结构存在差异。 Ezokushino海星被认为是Nittakushino海星的亚种。水深度略有重叠，有些区域在症状上显得较小，尽管形态学差异很明显，但似乎很少发现中间的个体，因此我们发现两种物种之间的系统发育关系需要更详细地研究。

项目成果

Ophiuroids (Echinodermata) of Genus Ophiura collected from deep waters off Pacific coast of northern Japan

蛇尾类（棘皮动物），属蛇尾属，采自日本北部太平洋沿岸深水区

• 发表时间: 2009
• 期刊: National Museum of Nature and Scinece Monographs 39
• 作者: Fujita;T.;Iwasaki;U. and Okanishi;M.
• 通讯作者: M.

Preliminary analysis on genetic structure of dense populations of Ophiura sarsii on the upper slope around northern Japan

日本北部上坡沙氏蛇尾密集种群遗传结构初步分析

• 发表时间: 2009
• 作者: Fujita;T. and Kuramochi;T.
• 通讯作者: T.