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溶媒効果を取り込んだ金属錯体の電子状態に関する理論的研究

考虑溶剂效应的金属配合物电子态的理论研究

基本信息

批准号：
06J03297
负责人：
横川大輔
金额：
$ 1.79万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2006
资助国家：
日本
起止时间：
2006 至 2008
项目状态：
已结题

项目摘要

1.溶媒和積分方程式理論の並列化計算タンパク質を取り囲む水分子、および内部に取り込まれた水分子はタンパク質の3次元構造や機能を解明する上で非常に重要である。これを従来の分子シミュレーションで理論的に計算すると、十分信頼性のある統計平均をとるためには、非常に長時間の計算を必要とした。そこで申請者は、高並列計算が可能な溶媒和積分方程式の導出を行った。これにより、タンパク質周辺の水和構造を、適切に計算することが可能になった。本年度はこの方法を用い、バクテリオロドプシンの内部水の解析、および抗Fvダンシルフラグメント周辺の水和構造を詳細に検討した。2.電子の広がりを露に考慮したRISM-SCF法(RISM-SCF-SEDD法)の開発積分方程式理論の一つであるRISM法と量子化学計算を組み合わせたRISM-SCF法は、溶液中の電子状態が計算できるだけでなく、溶質分子周辺の溶媒和構造も計算できる非常に有用な方法である。しかし、従来のRISM-SCF法では、本来電子がもつ空間的な広がりを無視しているため、幾つかの分子で非物理的な結果しか得られない場合があった。前年度までに、申請者は電子の広がりを考慮したRISM-SCF法(RISM-SCF-SEDD法)の開発を行った。これにより、RISM-SCF法の適用できる分子を大幅に増やすことに成功した。本年度は、溶液中の分子の構造最適化を行うために、新規RISM-SCF法の下で、核座標に対するgradientを与える式の導出、ならびにプログラムの開発を行った。さらに、より高精度の計算を行うために、本方法を密度汎関数理論とCoupled Cluster法と組み合わせた。このプログラムを用いて、溶媒効果が非常に重要になる水溶液中の分子の構造最適化計算、および互変異性化反応の解析を行い、実験結果を非常によく再現することに成功した。

1. The simultaneous calculation of solvent and positive fraction equation theory, the simultaneous calculation of the theory of solvent and positive component equation, the simultaneous calculation of the theory of solvent and the theory of positive fraction equation, the simultaneous calculation of the theory of solvent and positive fraction equation, the simultaneous calculation of the theory of solvent and positive fraction equation, the simultaneous calculation of the theory of solvent and positive fraction equation, the simultaneous calculation of the theory of solvent and positive fraction equation, the simultaneous calculation of the theory of solvent and positive fraction equation. We have come to pay attention to the calculation of the theory of molecular economics, the statistics of very reliable statistics, and the calculation of necessary statistics for very long periods of time. It is possible that the solvent and the equation of positive components may be derived from the equation of positive components. It is necessary to calculate the amount of water in the water and make it, cut it, and calculate that it is possible. This year, this year, the method is used to analyze the internal water supply, the anti-Fv method is used to prevent the occurrence of internal water, and to improve the performance of the system. two。 The RISM-SCF method (RISM-SCF-SEDD method), the theory of positive equations, the RISM method, the quantum chemical calculation, the RISM-SCF method, the electron state method in solution, the molecular cycle, the solvent, the solvent and the computer, the calculation method is very useful. By using the RISM-SCF method, the computer in the space of the original computer, the computer, and the molecule, the results show that the computer is in good agreement with each other. In the previous year, the RISM-SCF method (RISM-SCF-SEDD method) has been opened for both applicants and applicants. In the RISM-SCF method, the molecule was used to determine the success of the molecule. This year, the most effective method for the production of molecules in solution, the new RISM-SCF method, the nuclear seat label and the formula are derived, and the operation is carried out. In this method, density measurement, mathematical theory and Coupled Cluster method are used to calculate the accuracy of the calculation. The results show that it is very important to use the solvent to optimize the calculation of molecules in aqueous solution, to analyze each other and to analyze them, and the results show that the results are very important.