溶媒効果を取り込んだ金属錯体の電子状態に関する理論的研究
溶媒効果を取り込んだ金属錯体の電子状態に関する理論的研究
批准号:
06J03297
负责人:
横川 大輔
金额:
$1.79万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2008
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英文摘要
1.溶媒和積分方程式理論の並列化計算タンパク質を取り囲む水分子、および内部に取り込まれた水分子はタンパク質の3次元構造や機能を解明する上で非常に重要である。これを従来の分子シミュレーションで理論的に計算すると、十分信頼性のある統計平均をとるためには、非常に長時間の計算を必要とした。そこで申請者は、高並列計算が可能な溶媒和積分方程式の導出を行った。これにより、タンパク質周辺の水和構造を、適切に計算することが可能になった。本年度はこの方法を用い、バクテリオロドプシンの内部水の解析、および抗Fvダンシルフラグメント周辺の水和構造を詳細に検討した。2.電子の広がりを露に考慮したRISM-SCF法(RISM-SCF-SEDD法)の開発積分方程式理論の一つであるRISM法と量子化学計算を組み合わせたRISM-SCF法は、溶液中の電子状態が計算できるだけでなく、溶質分子周辺の溶媒和構造も計算できる非常に有用な方法である。しかし、従来のRISM-SCF法では、本来電子がもつ空間的な広がりを無視しているため、幾つかの分子で非物理的な結果しか得られない場合があった。前年度までに、申請者は電子の広がりを考慮したRISM-SCF法(RISM-SCF-SEDD法)の開発を行った。これにより、RISM-SCF法の適用できる分子を大幅に増やすことに成功した。本年度は、溶液中の分子の構造最適化を行うために、新規RISM-SCF法の下で、核座標に対するgradientを与える式の導出、ならびにプログラムの開発を行った。さらに、より高精度の計算を行うために、本方法を密度汎関数理論とCoupled Cluster法と組み合わせた。このプログラムを用いて、溶媒効果が非常に重要になる水溶液中の分子の構造最適化計算、および互変異性化反応の解析を行い、実験結果を非常によく再現することに成功した。
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DOI:
10.1016/j.cplett.2007.06.086
发表时间:
2007-08
期刊:
Chemical Physics Letters
影响因子:
2.8
作者:
[K. Iida;D. Yokogawa;Hirofumi Sato;S. Sakaki]
通讯作者:
K. Iida;D. Yokogawa;Hirofumi Sato;S. Sakaki
Electronic Structure and Solvation Structure of [Ru (CN) 6] 4-/3-in Aqueous Solution: A RISM-SCF Study
[Ru (CN) 6] 4-/3-in 水溶液的电子结构和溶剂化结构:RISM-SCF 研究
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
J. Mol. Liq. 136
影响因子:
--
作者:
[H. Sato, I. Kawamoto, D. Yokogawa & S. Sakaki]
通讯作者:
D. Yokogawa & S. Sakaki
RISM-SCF-SEDD法と高精度量子化学計算による溶液分子の理論的研究
使用RISM-SCF-SEDD方法和高精度量子化学计算对溶液分子进行理论研究
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
影响因子:
--
作者:
[横川大輔, 佐藤啓文, 榊茂好]
通讯作者:
榊茂好
Solvation effects in oxidative addition reaction of Methyliodide to Pt (II) complex : A theoretical study with RISM-SCF method
碘甲烷与 Pt (II) 络合物氧化加成反应中的溶剂化效应:RISM-SCF 方法的理论研究
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Chem. Phys. Lett. 458
影响因子:
--
作者:
[S. Hayaki, D. Yokogawa, H. Sato, S. Sakaki]
通讯作者:
S. Sakaki
New generation of the reference interaction site model self-consistent fieId method: Introduction of spatial electron density distribution to the solvation theory
新一代参考相互作用位点模型自洽场方法:将空间电子密度分布引入溶剂化理论
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
」. Chem. Phys 126
影响因子:
--
作者:
[D.Yokogawa, H.Sato, and S.Sakaki]
通讯作者:
and S.Sakaki
共 14 条
14・15世紀における帝国国制の変動と金印勅書
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批准号:09J03078
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.9万
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财政年份:2009
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负责人:横川 大輔
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依托单位:
NMR緩和分散法と理論化学計算に基づいた蛋白質遷移状態の構造決定法の開発
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批准号:09J02201
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$5.76万
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财政年份:2009
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负责人:横川 大輔
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依托单位: