プロテオーム解析を用いたホヤ母性因子による発生運命決定機構の解明

利用蛋白质组分析阐明海鞘母体因素的发育命运决定机制

• 批准号: 06J06181
• 负责人: 山田 力志
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06J06181/
• 关键词: プロテオミクス; 質量分析; ホヤ; 母性タンパク質; 初期発生; ゲノムワイド解析; リン酸化; 翻訳後修飾; 分化決定因子; 遺伝子局在機構

本研究は、ホヤのタンパク質の動態を出来る限り網羅的に捕らえることで、mRNAを研究するだけでは分からない、受精から初期発生において重要な役割をする、母性に存在するタンパク質を同定する事を目的としている。受精に関連するプロテオーム解析のうち、雌側の因子である卵黄膜については、800個以上の含有タンパク質を同定し、さらに卵黄膜以外の卵プロテオームと比較する事で、約100個の卵黄膜特異的タンパク質を同定した。そのなかには、自己非自己認識に重要であると考えられるタンパクやZPドメインを含むタンパク質11個を始め受精に重要な役割を果たすであろう多くの候補分子を明らかにし、報告した[Yamada et al.,J.Biol,Chem.(2009年2月9日電子版発表、印刷中)]。現在、雄側の重要な因子が含まれていると考えられると考えられる精子ラフト画分に注目し、同様の解析を行っている。発生初期のプロテオミクスに関しては、前年度の未受精卵と受精後20分、40分、60分(第一卵割直前)に加え、4、8、16細胞期の胚の細胞質、膜画分に含まれるタンパク質及び原腸胚、尾芽胚、幼生の胚全体に含まれるタンパク質の同定を行い、3000個以上のタンパク質を含む、胚発生過程におけるタンパク質のプロファイルを作成した。現在引き続き、分化決定因子が各割球に偏って存在する事が分かっている8細胞期に注目、単離割球を得、各割球に含まれるタンパク質の網羅的同定を行っている。これらの結果とすでに得られている、4、8、16細胞期胚全体のデータとを比較することで、分化決定に重要なタンパク質の候補を得ることができると期待できる。一方、前年度より引き続き、ホヤプロテオミクスに必要な情報学的基盤の整備を行っており、本年度は、マニュアルによるキュレーションを行った信頼性の高い遺伝子モデルセット作成し共著者として報告した[Satou et al.,Genome Biol.(2008年10月14日電子版発表、印刷中)]。

This study focuses on the study of the dynamics of maternal quality, the identification of genes, the identification of genes, and the identification of genes in the early stages of fertilization. The analysis of fertilization correlation, female side factors, more than 800 yolk membrane-specific factors, and about 100 yolk membrane-specific factors [Yamada et al.] J.Biol,Chem. (2009 February 9, 2009 electronic version of the table, printing)]. Now, the male side of the important factors include the study of sperm, the analysis of the same line. At the beginning of development, the unfertilized eggs of the previous year, 20 minutes, 40 minutes and 60 minutes after fertilization (before the first egg cleavage), the cytoplasm and membrane of the embryos at the addition, 4, 8 and 16 cell stages, including the cytoplasm and the cytoplasm of the gastrula embryos, tail bud embryos and young embryos, were all contained in the same line, and more than 3000 embryos were contained in the cytoplasm. The process of embryo development is a process of quality control. Now, the differentiation determining factors are present in the 8-cell stage of each cutting ball, and the differentiation determining factors are present in the 8-cell stage of each cutting ball. The results of this study were compared with the results of the study of the whole population of 4, 8, and 16 cell embryos. A report on the preparation of the necessary information base in the previous year was submitted by Satou et al. Genome Biol. (2008 October 14, 2010 electronic version of the table, in print)].

项目成果

Embryonic expression profiles and conserved localization mechanisms of pem/postplasmic mRNAs of two species of ascidian, Ciona savignyi

两种海鞘（Ciona savignyi）的胚胎表达谱和 pem/postplasmic mRNA 的保守定位机制

• 发表时间: 2006
• 期刊: Development Biology 296・2
• 作者: 佐久間貴士;堀裕;荒武賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;荒武賢一朗;荒武賢一朗;荒武賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;渡辺 尚志;菊池 勇夫;Satou Y.;Yamada L.;Harada Y.;Harada Y.;Prodon F.;Prodon F.;miwata K.;Yamada L.
• 通讯作者: Yamada L.

LC/MS/MS-based proteomic approach for early embryogenesis of ascidian.

基于 LC/MS/MS 的蛋白质组学方法用于海鞘早期胚胎发生。

• 发表时间: 2007
• 作者: 佐久間貴士;堀裕;荒武賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;荒武賢一朗;荒武賢一朗;荒武賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;渡辺 尚志;菊池 勇夫;Satou Y.;Yamada L.;Harada Y.;Harada Y.;Prodon F.;Prodon F.;miwata K.;Yamada L.;齋藤貴子;山田力志;Endo T.;Yonezawa K;Yamada L.
• 通讯作者: Yamada L.

Comprehensive egg-coat proteome of an ascidian Ciona intestinalis reveals gamete recognition molecules involved in self-sterility.

海鞘的综合卵壳蛋白质组揭示了参与自体不育的配子识别分子。

• 发表时间: 2009
• 期刊: J. Biol. Chem. 284
• 作者: Yamada;L.;Saito;T.;Taniguchi;H.;Sawada;H.;Harada;Y.
• 通讯作者: Y.

Systematic analysis of embryonic expression profiles of zinc finger genes in Ciona intestinalis.

• DOI: 10.1016/j.ydbio.2006.01.024
• 发表时间: 2006-04
• 期刊: Developmental biology
• 影响因子: 2.7
• 作者: Kyoko Miwata;Takuto Chiba;Reiko Horii;Lixy Yamada;A. Kubo;Daisuke Miyamura;N. Satoh;Y. Satou

Mass spectrometry-based proteomic analysis for ascidian early embryog enesis:質量分析を用いたホヤ初期胚のプロテオーム解析

基于质谱的海鞘早期胚胎发生蛋白质组分析：利用质谱对海鞘早期胚胎进行蛋白质组分析

• 发表时间: 2008
• 作者: 佐久間貴士;堀裕;荒武賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;荒武賢一朗;荒武賢一朗;荒武賢一朗;荒武 賢一朗;荒武 賢一朗;渡辺 尚志;菊池 勇夫;Satou Y.;Yamada L.;Harada Y.;Harada Y.;Prodon F.;Prodon F.;miwata K.;Yamada L.;齋藤貴子;山田力志
• 通讯作者: 山田力志