担子菌類多様生保全ための遺伝子資源データベースの構築とアレイ作成

担子菌多样性遗传资源数据库构建及芯片制作

• 批准号: 06J08183
• 负责人: 須原 弘登
• 金额: $ 0.77万
• 依托单位: Tottori University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-06J08183/
• 关键词: 担子菌; 多様性; 保全生物学; データベース; 分子系統; コウヤクタケ; 分類学

遺伝子資源の収集と保存1-1.研究の内容世界的にも整備の遅れている、キノコ類(主に担子菌類)の培養菌株の収集・保存を行い、収集した菌株をもちいた分類(系統分類)学的研究や、新規バイオリソースとしての機能性成分の探索等、キノコ類をもちいた研究を行うための基盤の確立を目指し研究を行った。1-2.研究の成果遺伝子資源収集のために国内各地で採取調査を行い標本、分離株、DNAサンプルの作製を行い、一部に関してはDNA解析を行った。県内に於ける通年調査(28回)と大分、北海道、沖縄、東京(小笠原)など、調査は国内約30ケ所で行った。遺伝子資源として500株程度の分離株を得たDNA試料約200点を得た。このうち、約50点についてDNA解析を行った。引き続きDNA解析を行っている。解析したサンプルの大半はGenBankなどの公的データベースに登録のないものであり、担子菌類の遺伝子情報として新規であり、有用な情報と言える。未解析の試料についてもその大半は遺伝子情報のないもの(種)である事が、予想され、新規の担子菌類遺伝子データベースを確立して行く上で非常に有効な情報となる事が期待できる。H18年度以前の解析分を含めると現在200種400株程度の担子菌類の遺伝子情報を取得しており、その大半は公的データベースに登録が無いものであり、本情報は今後構築する担子菌類遺伝子データベースの核となりうる。

Save the sub-resource cluster 1-1. To study the contents of the world, we should focus on the preservation of strains in the content world, the preservation of strains (main basidiomycetes), the classification of strains (systematic classification), the exploration of functional components, and so on. 1-2. The results of the research are collected in the sub-resource collection. In all parts of the country, the header books, sub-lines, DNA banks and DNA analysis banks are collected from all over the country. It is located in Ogasawara, Hokkaido, Ogasawara, Ogasawara, Hokkaido, Ogasawara, Hokkaido, Ogasawara, and so on. A total of 500 isolates were isolated from the sub-resources, and about 200 DNA were obtained. At about 50: 00, the DNA parse line will be closed. Please refer to the DNA parsing line. Analyze the information of more than half of the GenBank companies that register information, fungal pathogens, new regulations and useful information. Most of the information has not been analyzed, and most of the information has not been analyzed. Most of the information has not been analyzed, and most of the information has not been analyzed. Most of the information has not been analyzed. Prior to the year H18, 200 species of 400 strains of basidiomycetes have been identified, and more than half of them have registered without prior information. In the future, we will be responsible for the detection of basidiomycetes.