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Dynamic simulation and system analysis for gene regulatory networks
基因调控网络的动态模拟与系统分析
基本信息
- 批准号：18300098
- 负责人：
- 金额：$ 11.46万
- 依托单位：
- 依托单位国家：日本
- 项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- 财政年份：2006
- 资助国家：日本
- 起止时间：2006 至 2008
- 项目状态：已结题
- 来源：
- 关键词：
项目摘要
大腸菌アンモニア同化システムの動的モデルをシステム解析することにより環境中のアンモニア濃度の変化に対してシステムがヒステリシスを示すことを予測して, 生物実験を用いて証明した。ヒステリシスがポジティブフィードバック制御に起因することを、理論解析により明らかにした。また、システムのロバストネス解析によって, 窒素同化システムは、ロバストな部分とファインチューンの部分明確に分かれていることわかった.
The analysis of Escherichia coli in the environment and the prediction of its concentration in the environment have been proved by the application of Escherichia coli. The reason for this is that In addition, the analysis of the structure of the system, the analysis of the structure of the system and the analysis of the structure of the system.
项目成果
期刊论文数量（0）
专著数量（0）
科研奖励数量（0）
会议论文数量（0）
专利数量（0）
A gradual update method for simulating the steady-state solution of stiff differential equations in metabolic circuits
模拟代谢电路中刚性微分方程稳态解的逐步更新方法
- DOI：
- 发表时间：2009
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Toyofuku T;Takahashi K;Miyamto K;Yokoo Y;Uno T;Wang L;Shintani M;Miwakeichi F;and Tonoike M;Emi Shiraishi Kazuhiro Maeda Hiroyuki Kurata
- 通讯作者：Emi Shiraishi Kazuhiro Maeda Hiroyuki Kurata
Module-based analysis of robustness tradeoffs in the heat shock response system.
- DOI：10.1371/journal.pcbi.0020059
- 发表时间：2006-07-28
- 期刊：
- 影响因子：4.3
- 作者：Kurata H;El-Samad H;Iwasaki R;Ohtake H;Doyle JC;Grigorova I;Gross CA;Khammash M
- 通讯作者：Khammash M
CADLIVE : Computer aided design of biochemical systems. Supp lement of Journal of Biotechnology
CADLIVE：生化系统的计算机辅助设计。
- DOI：
- 发表时间：2008
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Yousuke Nishio;Yoshihiro Usuda;Kazuhiko Matsui;Hiroyuki Kurata;岡田浩之・高橋英之・大森隆司;Hiroyuki Kurata
- 通讯作者：Hiroyuki Kurata
Searching multiple sets of kinetic parameters values reproducing target experimental data in dynamic biochemical models(S063-1-2)
在动态生化模型中搜索再现目标实验数据的多组动力学参数值（S063-1-2）
- DOI：
- 发表时间：2008
- 期刊：
- 影响因子：0
- 作者：Kazuhiro Maeda;Hiroyuki Kurata
- 通讯作者：Hiroyuki Kurata
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Synthesis of novel redox systems having thiophenes highly integrated with quinone methides structure
具有与醌甲基化物结构高度集成的噻吩的新型氧化还原体系的合成
- 批准号：
23550053 - 财政年份：2011
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Biological design principle-based synthetic biology
基于生物设计原理的合成生物学
- 批准号：
22300101 - 财政年份：2010
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Synthesis and Response toward External Stimulli of Bithiophene Derivatives Bridged by Spirodienone Structure
螺环二烯酮结构桥连联噻吩衍生物的合成及其对外界刺激的响应
- 批准号：
20550039 - 财政年份：2008
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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笼状低聚噻吩的合成、性质及基础
- 批准号：
18550034 - 财政年份：2006
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Synthesis and Properties of Novel Non-planar Extended Quinonoid Molecules Having o-Quinonoid Structure
具有邻醌结构的新型非平面延伸醌类分子的合成及性能
- 批准号：
16550036 - 财政年份：2004
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Image analysis of fibroblast movement regulation and dynamic simulation
成纤维细胞运动调控的图像分析及动态模拟
- 批准号：
15500198 - 财政年份：2003
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Synthesis and Properties of Non-planar Extended Quinonoid Molecules Aimed for Molecular-switching Function
用于分子开关功能的非平面延伸醌类分子的合成与性能
- 批准号：
13640534 - 财政年份：2001
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
相似海外基金
Elucidation of the conditions for the establishment of piRNA clusters through comparison of cultured cell genome and individual genomes
通过培养细胞基因组和个体基因组的比较阐明piRNA簇建立的条件
- 批准号：
20K22620 - 财政年份：2020
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
ユビキタス海洋動物プランクトン、ワカレオタマボヤの集団ゲノム科学
普遍存在的海洋浮游动物 Wakareotamaboya 的群体基因组科学
- 批准号：
20F20760 - 财政年份：2020
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
Development of a rapid DNA typing system
快速DNA分型系统的开发
- 批准号：
19K16246 - 财政年份：2019
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Analysis of Signaling Mechanisms in Acquired Middle Ear Cholesteatoa via a Bioinformatics Approach
通过生物信息学方法分析获得性中耳胆脂瘤的信号机制
- 批准号：
19K18790 - 财政年份：2019
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Microbiome mining: machine learning for discovery of genetic dark matter, metabolic pathways, and ecological processes from metagenomes
微生物组挖掘：通过机器学习从宏基因组中发现遗传暗物质、代谢途径和生态过程
- 批准号：
18H03367 - 财政年份：2018
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Development a cloud-based analysis environment that enables bioinformatics analysis for nanopore sequencer in the field
开发基于云的分析环境，支持现场纳米孔测序仪的生物信息学分析
- 批准号：
17K18045 - 财政年份：2017
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Genome wide association analysis of lifestyle and dining habit
生活方式和饮食习惯的全基因组关联分析
- 批准号：
16K12717 - 财政年份：2016
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
Bioinformatics analyses to search for ribosomal peptide biosynthetic genes from filamentous fungi
生物信息学分析寻找丝状真菌核糖体肽生物合成基因
- 批准号：
16K07226 - 财政年份：2016
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of a novel bioinformatics method to analyze big genome sequence data for efficient knowledge discovery
开发一种新的生物信息学方法来分析大基因组序列数据以实现有效的知识发现
- 批准号：
26330327 - 财政年份：2014
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Exploration of gene impairments assosiated with non-coding DNA, which involves in an Alu sequences causing male infertility
探索与非编码 DNA 相关的基因损伤，其中涉及导致男性不育的 Alu 序列
- 批准号：
25670679 - 财政年份：2013
- 资助金额：
$ 11.46万 - 项目类别：
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research