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センサータンパク質における多様な機能獲得機構の解析

センサータンパク質における多様な機能獲得機構の解析
传感器蛋白各种功能获取机制的分析
批准号:
18770135
负责人:
山崎 洋一
金额:
$2.37万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2006
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2006 至 2007

项目摘要

项目成果

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本研究では、センサータンパク質のPASドメイン部位における多様な機能獲得機構をその補欠分子に着目して、解析した。同一の補欠分子を持ちながら異なる反応を示すPASドメインタンパク賢として同一のp-クマル酸を有する2種類のPhotoactive Yellow Protein(PYP)について、その分光学的な特性の解析を行った。その結果、この2種類のPASドメインタンパク質はアミノ酸の類似性が約60%にもかかわらず、その可視吸収スペクトル、光反応性に大きな違いが現れていることが、明らかになった。しかし、さらに詳細に、光反応を解析して、その分光学的な分子種を同定していくと、両者の分光学的な相違は、局所環境で違い付けられた性質であることが示され、基本的には同一のメカニズムで達成されていることが明らかになった。具体的には、両者の極端に異なる反応速度の違い一部は、2つの保存性の低い残基によって調整さてており、非保存性のアミノ酸残基による多様な性質の獲得を示していた。また。相互作用タンパク質との反応性についても、このような反応速度の違いは寄与していると考えられ、保存性残基の土台の上に、異なる機能を表現していく非保存性の残基の役割が記述されていることが考えられた。また、補欠分子を持たない光合成色素合成遺伝子発現抑制因子(PPSR)におけるPASドメインの役割を、その相互作用タンパク質であるAPPAとの相互作用において検証した。その結果、PPSRに2個存在するPASドメインのうち1つが、相互作用における接触部位であることを明らかにした。このさい、今まで機能未知であったAPPAタンパク質のC末端部位に結合することも同時に明らかにした。以上のことから、PASドメイン部位が、タンパク質-タンパク質相互作用部位であると同時に、その相互作用が補欠分子の状態に影響を与えていることが示唆された。
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会议论文
Preparation of Large Crystals of Photoactive Yellow Protein for Neutron Diffraction and High Resolution Crystal Structure Analysis
用于中子衍射和高分辨率晶体结构分析的光活性黄色蛋白大晶体的制备
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Photochem. Photobiol. 83(2)
影响因子: --
作者: [Shigeo Yamaguchi, Hironari Kamikubo, Nobutaka Shimizu, Yoichi Yamazaki, Yasushi Imamoto, Mikio Kataoka]
通讯作者: Mikio Kataoka
Array of Aromatic Amino Acid Side Chains Located Near the Chromophore of Photoactive Yellow Protein.
位于光活性黄色蛋白发色团附近的芳香氨基酸侧链阵列。
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Photochem Photobiol. 83
影响因子: --
作者: [Morishita T, Harigai M, Yamazaki Y, Kamikubo H, Kataoka M, Imamoto Y]
通讯作者: Imamoto Y
Attempt to simplify the amino-acid sequence of photoactive yellow protein with a set of simple rules.
尝试用一组简单的规则来简化光敏黄色蛋白的氨基酸序列。
DOI: --
发表时间: 2007
期刊: Proteins. (in press)
影响因子: --
作者: [Shirai K, Yamazaki Y, Kamikubo H, Imamoto Y, Kataoka M]
通讯作者: Kataoka M
Identification of spectral species in the Photoactive Yellow Protein of Rhodobacter capsulatus.
荚膜红杆菌光活性黄色蛋白中光谱种类的鉴定。
DOI: --
发表时间: 2007
期刊:
影响因子: --
作者: [Y. Yamazaki, H. Kamikubo, Y. Imamoto, M. Kataoka]
通讯作者: M. Kataoka
8
    ロボット支援肝切除術は真に低侵襲なのか?acute phaseに着目して
    • 批准号:
      24K19395
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • 资助金额:
      $3.0万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      山崎 洋一
    • 依托单位:
    Dynamic analysis of droplet formation and control of bioactivity by photo-reversible liquid-liquid phase separation
    • 批准号:
      23K18096
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • 资助金额:
      $4.16万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      山崎 洋一
    • 依托单位:
    PASドメイン類似タンパク質PYPの相互作用解析
    • 批准号:
      14780512
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $2.18万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      山崎 洋一
    • 依托单位:
    バクテリオロドプシンのプロトン輸送を制御するタンパク骨格の構造変化の解析
    • 批准号:
      98J08993
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $2.3万
    • 财政年份:
      1998
    • 负责人:
      山崎 洋一
    • 依托单位:
    海外基金