エゾシカの遺伝的集団構成の解明および古代DNA分析による進化と移動の歴史の研究

通过古代DNA分析阐明梅花鹿的遗传种群组成并研究进化和迁徙历史

• 批准号: 07J52052
• 负责人: 名畑 太智
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: Hokkaido University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-07J52052/
• 关键词: エゾシカ; 父系遺伝子; ミトコンドリアDNA; 遺伝的多様性; 系統地理; 古代DNA; 北海道; 日本列島

北海道全域におけるエゾシカ集団の構造の変動および遺伝的多様性の変遷を調べために、父系遺伝するY染色体上のZFY遺伝子の多型を本州産・大陸産を含めたニホンジカ集団において解析した。これまでのニホンジカのミトコンドリアDNA系統解析により、日本列島には南北に分かれる二つの系統が分布していることがわかっている。本研究の結果、ニホンジカ集団から三つのZFYタイプを見出した。そのうちの一つは、アジア大陸産のニホンジカからのみ見つかり、日本列島において見つかった他の二つのタイプの祖先型であると推定された。日本列島のニホンジカについては、北海道エゾシカにおいて二つのZFYタイプが分布していたが、本州産等では一つのタイプのみが分布していた。北海道に特異的でかつ広く分布するZFYタイプの分布頻度が高いことや、従来のミトコンドリアDNAの系統地理的データと考え合わせると、エゾシカ集団は過去のボトルネックにより強い遺伝的浮動の効果を受け、集団構造が大きく変動したことが示唆された。さらに、大陸に生息するシカ属の近縁種アカシカについてもZFYの多様性を同様に調べたところ、ニホンジカとは異なる別の二つのタイプが見出され、その地理的分布パターンは従来のミトコンドリアDNAの地理的分布と一致した。一方、北海道の縄文時代から出土したエゾシカ骨の古代ミトコンドリアDNA分析により、現生エゾシカでは見られないタイプが複数見出され、過去の複数回のボトルネックによる集団構造の変動が示唆された。

Hokkaido's entire Hokkaido community has a multi-faceted structure and a patrilineal legacy system. Analysis of the polytype of the ZFY genetic polytype on the Y chromosome, produced in Honshu and produced in mainland China.これまでのニホンジカのミトコンドリアDNA system analysisにより, Japan The island is divided into two parts, the north and south, and the distribution system is divided into two parts. The results of this study are the results of the research.そのうちの一つは, アジア国产のニホンジカからのみ见つかり, Japan Archipelago において见つかった他の二つのタイプのancestor type であると presumed された. Japanese Archipelago Japanese Archipelago, Hokkaido Japanese Archipelago ZFY The distribution of タイプがしていたが, Honshu-produced では一つのタイプのみがDistribution of していた. Hokkaido's unique distribution frequency of ZFY distribution is highいことや、従来のミトコンドリアDNAの phylogeography データとtest合わせると、エゾシ団は上のボトルネックにより强い伝The floating effect is affected by the floating effect, and the collective structure is large and dynamic.さらに、Continental にるシカのNearly species アカシカについてもZFYの多様性を同様に动べたところ、ニホンジカとはdifferent The geographic distribution of the DNA is consistent with the distribution of the geographical distribution of the DNA. One side, Hokkaido's ancient unearthed bones from the Hokkaido period, DNA analysis of ancient bones, and modern エゾシカThe plural of では见られないタイプが见出され, and the plural of pastののトルネックによる集団structuringの変动が说唆された.

项目成果

父系遺伝子ZFYに基づくアカシカおよびニホンジカの分子系統地理

基于父本基因ZFY的马鹿和梅花鹿分子系统发育地理学

• 发表时间: 2007
• 作者: 上田 啓貴;三浦 英生;上田 啓貴;Nobuki Ueta;Nobuki Ueta;上田 啓貴;竹田 香織;竹田 香織;竹田 香織[邦訳](スザンナ・クレペリオ[著]);名畑太智;名畑太智
• 通讯作者: 名畑太智

ZFY遺伝子によるニホンジカおよびアカシカの系統地理

ZFY基因对梅花鹿和马鹿的系统发育地理学研究

• 发表时间: 2007
• 作者: 上田 啓貴;三浦 英生;上田 啓貴;Nobuki Ueta;Nobuki Ueta;上田 啓貴;竹田 香織;竹田 香織;竹田 香織[邦訳](スザンナ・クレペリオ[著]);名畑太智
• 通讯作者: 名畑太智