Molecular mechanism of protein folding by group II chaperonin
Molecular mechanism of protein folding by group II chaperonin
批准号:
19370038
负责人:
YOHDA Masafumi
金额:
$11.4万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份:
2007
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2007 至 2008
中文摘要
超好熱性古細菌Thermococcus strain KS-1由来グループ2型シャペロニンは、ATPにより頂点ドメインに位置するhelical protrusionを中心とした構造変化が引き起こされ、open 構造からclosed 構造へと変化することで、補足した変性タンパク質をシャペロニン内部空洞に閉じ込め、foldingを促進する。このATP依存的な構造変化はサブユニット間の協同した作用により引き起こされるが、その詳細は解明されていない。我々は、シャペロニンリング内の特定の位置に、「ATP加水分解部位に変異を導入した変異体サブユニット」と「helical protrusion欠損変異体サブユニット」をそれぞれ様々に導入したシャペロニンを作成し、これらのシャペロニンのfolding活性やATP依存的な構造変化を生化学的実験およびX線小角散乱実験などを用いて解析し、サブユニット間の協同性を解析した。本解析の結果、2型シャペロニンのATP依存的なopen構造からclosed構造への変化では、最初にATP結合・加水分解により各サブユニットのhelical protrusionを中心とした局所的な構造変化が起こり、その後、隣接したhelical protrusion間の相互作用が起こることでclosed構造を形成するようになることを明らかにした。また、常温での機能解析を可能にするため、低温適応変異体を構築した。この変異体の変異アミノ酸は構造変化の情報伝達に重要な役割を持つことが示唆されている。
英文摘要
超好熱性古細菌Thermococcus strain KS-1由来グループ2型シャペロニンは、ATPにより頂点ドメインに位置するhelical protrusionを中心とした構造変化が引き起こされ、open 構造からclosed 構造へと変化することで、補足した変性タンパク質をシャペロニン内部空洞に閉じ込め、foldingを促進する。このATP依存的な構造変化はサブユニット間の協同した作用により引き起こされるが、その詳細は解明されていない。我々は、シャペロニンリング内の特定の位置に、「ATP加水分解部位に変異を導入した変異体サブユニット」と「helical protrusion欠損変異体サブユニット」をそれぞれ様々に導入したシャペロニンを作成し、これらのシャペロニンのfolding活性やATP依存的な構造変化を生化学的実験およびX線小角散乱実験などを用いて解析し、サブユニット間の協同性を解析した。本解析の結果、2型シャペロニンのATP依存的なopen構造からclosed構造への変化では、最初にATP結合・加水分解により各サブユニットのhelical protrusionを中心とした局所的な構造変化が起こり、その後、隣接したhelical protrusion間の相互作用が起こることでclosed構造を形成するようになることを明らかにした。また、常温での機能解析を可能にするため、低温適応変異体を構築した。この変異体の変異アミノ酸は構造変化の情報伝達に重要な役割を持つことが示唆されている。
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Functional characterization ofrecombinant prefoldin complexes from ahyperthermophilic archaeon
超嗜热古菌重组前折叠蛋白复合物的功能表征
DOI:
--
发表时间:
2008
期刊:
Thermococcus sp. strain KS-1. J Mol Biol 377
影响因子:
--
作者:
[Iizuka R, Sugano Y, Ide N, Ohtaki A, Yoshida T, Fujiwara S, Imanaka T, YohdaM]
通讯作者:
YohdaM
DOI:
10.1016/j.jmb.2007.12.010
发表时间:
2008-02-29
期刊:
JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY
影响因子:
5.6
作者:
[Ohtaki, Akashi, Kida, Hiroshi, Yohda, Masafumi]
通讯作者:
Yohda, Masafumi
DOI:
10.1074/jbc.m805303200
发表时间:
2008-12-12
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Kanzaki, Taro, Iizuka, Ryo, Yohda, Masafumi]
通讯作者:
Yohda, Masafumi
Characterization of a sHsp of Schizosaccharomyces pombe, SpHsp l5.8, and theimplication of its functional mechanism by comparison with another sHsp, SpHsp l6.0.
粟酒裂殖酵母sHsp(SpHsp l5.8)的表征,以及通过与另一种sHsp(SpHsp l6.0)比较来暗示其功能机制。
DOI:
--
发表时间:
2009
期刊:
Proteins 74
影响因子:
--
作者:
[Sugino C, Hirose M, Tohda H, Yoshinari Y, Abe T, Giga-Hama Y, Iizuka R, Shimizu M, Kidokoro s, Ishii N, & Yohda M.]
通讯作者:
& Yohda M.
DOI:
10.1074/jbc.m806577200
发表时间:
2008-12-26
期刊:
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY
影响因子:
4.8
作者:
[Hashimoto, Koichi, Suzuki, Hiroyuki, Odaka, Masafumi]
通讯作者:
Odaka, Masafumi
共 41 条
Creation of a self-organizing protein nano-structures using bacterial micro compartments
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批准号:23651106
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.58万
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财政年份:2011
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负责人:YOHDA Masafumi
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依托单位:
Elucidation of mechanism for conformational change and protein folding of the group 2 chaperonin
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批准号:21370067
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$12.06万
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财政年份:2009
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负责人:YOHDA Masafumi
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依托单位:
Distribution of Amino Acid Racemases and D-Amino Acids in Archaea and Their Function
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批准号:09460053
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$8.7万
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财政年份:1997
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负责人:YOHDA Masafumi
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依托单位:
海外基金