Fish and Chips: the ciaRH regulatory network of Streptococcus pneumoniae

炸鱼薯条：肺炎链球菌的 ciaRH 调控网络

• 批准号: 5360325
• 负责人: Professorin Dr. Regine Hakenbeck
• 金额: --
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 2001-12-31 至 2004-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5360325?language=en
• 关键词: Fish; Chips; ciaRH; regulatory; network

Die Funktion bakterieller Zwei-Komponenten Signal-transduzierender Systeme (two component signal transducing systems, TCSTS) wird definiert durch die Signale, die über die Rezeptor-Histidin Proteinkinase detektiert, und die Gene, die von dem dazugehörigen Responseregulator in Abhängigkeit von dem Signal reguliert werden. Die in dem vorliegenden Antrag beschriebenen Projekte haben das Ziel, das Regulationsnetzwerk in das das TCSTS ciaR/ciaH in Streptococcus pneumoniae involviert ist, zu charakterisieren. Der Antrag basiert grundsätzlich auf zwei methodischen Ansätzen, die sich bei der Darstellung von Regulons ergänzen. DNA Targetfragmente, die spezifisch mit Responseregulatoren interagieren, können in einem "Solid Phase DNA Binding Assay" isoliert und über Hybridisierung gegen einen genomischen DNA Microarray identifiziert werden, um Aufschluß über potentiell regulierte Gene des entsprechenden Regulators zu erhalten; diese Methode wurde in meinem Labor am Beispiel des Responseregulators CiaR von S. pneumoniae entwickelt. Transkriptomanalysen, in dem die Expressionsmuster von Wildtyp und TCSTS Mutanten unter verschiedenen Bedingungen verglichen werden, erfassen auch indirekt regulierte Gene, d.h. das globale Regulon von TCSTS. Das TCSTS ciaH/ciaR, dem wir eine Schlüsselfunktion für die Integrität der Zellwand zuschreiben nimmt eine besondere Stellung ein. Es ist involviert in beta-Lactamresistenz, und seine Rolle bei der Regulation der genetischen Kompetenz ist beispielhaft für die Vernetzung mit anderen Regulationssystemen. Auf der Grundlage bisher erfolgter phänotypischer und genetischer Analysen des cia TCSTS soll dessen Funktion detailliert analysiert werden, wobei induzierende Bedingungen, crosstalk-Mechanismen, und die Gene, die für phänotypische Veränderungen wie Lyseverhalten und Kompetenzdefizienz verantwortlich sind, charakterisiert werden sollen.

双组分信号转导系统（two-component signal transduzierender Systeme，TCSTS）的功能通过信号、受体-组氨酸蛋白激酶（Rezeptor-Histidin Protein kinase，HPKK）的检测和基因来确定，它们是信号调节韦尔登的应答调节因子。在该项目中，与肺炎链球菌相关的TCSTS ciaR/ciaH的监管系统具有特征性。Antrag基于两种方法，这种方法是调节子的调节。DNA靶片段，特异性结合反应调节因子，在固相DNA结合试验中分离并杂交一个基因组DNA微阵列韦尔登，以检测潜在的反应调节因子基因;该方法在我的实验中用于研究S.肺炎支原体感染。通过对野生型和TCSTS突变体表达谱的分析，发现野生型和TCSTS突变体在韦尔登的表达中也有调节基因，即d.h. TCSTS的全局调节子。Das TCSTS ciaH/ciaR，dem wir eine Schlüsselfunktion für die Integrität der Zellwand zuschreiben nimmt eine besondere Stellung ein. Es ist involviert in beta-Lactamresistenz，und seine Rolle bei der Regulation der genetischen Kompetenz ist beispielhaft für die Vernetzung mit anderen Regulationssystemen.通过对TCSTS的基本特征和遗传学分析，详细分析了TCSTS的功能，包括识别、串扰机制和基因，以及与Lyseverhalten和Kompetenzdefizienz相同的特征。