Development of an intramolecular basis set superposition error correction and its applications to biomolecules

分子内基组叠加误差校正的发展及其在生物分子中的应用

• 批准号: 19550028
• 负责人: FEDOROV Dmitri
• 金额: $ 3.08万
• 依托单位: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19550028/
• 关键词: 化学反応; FMO; AFO; zeolite; GAMESS; BSSE; TDDFT; 励起状態; heparin

研究成果の概要:巨大分子用量子化学計算法(FMO 法)の開発を続けて、励起状態に拡張し、分子結晶と共有結合結晶の為新機能を開発し、溶媒中等の構造最適化を行える様にした。応用として、螺旋多糖heparin の水和電子状態と分子結晶quinacridone の電子励起又はzeolite における小分子吸着過程を調べた。基底関数重ね合わせ誤差補正法のプログラムを開発した。

Summary of the research results: the quantum chemical calculation algorithm (FMO method) is used to start the quantum chemical analysis, the excitation state analysis and the molecular crystal analysis of the macromolecules. The results show that the combination of the new mechanical energy switch and the solvent medium is the most efficient one. Quinacridone electrodes were used to stimulate the absorption of small molecules in the process of absorption by using hydrogen peroxide, spirally polysaccharides heparin water and electronic state molecules crystal quinacridone electrodes. The base number is in good agreement with the difference between the two.

项目成果

Quantum-Mechanical Calculations of Proteins : Why and How

蛋白质的量子力学计算：原因和方法

• 发表时间: 2008
• 作者: D. G. Fedorov;K. Kitaura
• 通讯作者: K. Kitaura

The Fragment Molecular Orbital-Based Time-Dependent Density Functional Theory for Excited States in Large Systems. In : The Fragment Molecular Orbital Method : Practical Applications to Large Molecular Systems(D. G. Fedorov, K. Kitaura, Eds.)

大型系统中激发态的基于片段分子轨道的时变密度泛函理论。

• 发表时间: 2009
• 作者: M. Chiba;D. G. Fedorov;K. Kitaura
• 通讯作者: K. Kitaura

FMO法のGAMESSへの実装

FMO方法在GAMESS中的实现

• 发表时间: 2008
• 作者: 上原広充;大川侑久;野口秀典;阿部正明;佐々木陽一;魚崎浩平;Triana Widianti;D. G. Fedorov
• 通讯作者: D. G. Fedorov

Theoretical Analysis of the Intermolecular Interaction Effects on the Excitation Energy of Organic Pigments: Solid State Quinacridone

• DOI: 10.1021/jp804943m
• 发表时间: 2008-10-30
• 期刊: JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A
• 影响因子: 2.9
• 作者: Fukunaga, Hiroo;Fedorov, Dmitri G.;Kitaura, Kazuo
• 通讯作者: Kitaura, Kazuo

巨大分子用量子化学計算法の開発とその適用

大分子量子化学计算方法的发展及其应用

• 发表时间: 2008
• 作者: D. G. Fedorov ;北浦和夫
• 通讯作者: 北浦和夫