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Development of an intramolecular basis set superposition error correction and its applications to biomolecules

Development of an intramolecular basis set superposition error correction and its applications to biomolecules
分子内基组叠加误差校正的发展及其在生物分子中的应用
批准号：
19550028
负责人：
FEDOROV Dmitri
金额：
$3.08万
依托单位：
National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2007
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2007 至 2008
来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19550028/
关键词：
化学反応FMOAFOzeoliteGAMESSBSSETDDFT励起状態heparin

项目摘要

项目成果

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研究成果の概要:巨大分子用量子化学計算法(FMO 法)の開発を続けて、励起状態に拡張し、分子結晶と共有結合結晶の為新機能を開発し、溶媒中等の構造最適化を行える様にした。応用として、螺旋多糖heparin の水和電子状態と分子結晶quinacridone の電子励起又はzeolite における小分子吸着過程を調べた。基底関数重ね合わせ誤差補正法のプログラムを開発した。
英文摘要
研究成果の概要:巨大分子用量子化学計算法(FMO 法)の開発を続けて、励起状態に拡張し、分子結晶と共有結合結晶の為新機能を開発し、溶媒中等の構造最適化を行える様にした。応用として、螺旋多糖heparin の水和電子状態と分子結晶quinacridone の電子励起又はzeolite における小分子吸着過程を調べた。基底関数重ね合わせ誤差補正法のプログラムを開発した。
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会议论文
Quantum-Mechanical Calculations of Proteins : Why and How
蛋白质的量子力学计算：原因和方法
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [D. G. Fedorov, K. Kitaura]
通讯作者： K. Kitaura
The Fragment Molecular Orbital-Based Time-Dependent Density Functional Theory for Excited States in Large Systems. In : The Fragment Molecular Orbital Method : Practical Applications to Large Molecular Systems(D. G. Fedorov, K. Kitaura, Eds.)
大型系统中激发态的基于片段分子轨道的时变密度泛函理论。
DOI： --
发表时间： 2009
期刊：
影响因子： --
作者： [M. Chiba, D. G. Fedorov, K. Kitaura]
通讯作者： K. Kitaura
FMO法のGAMESSへの実装
FMO方法在GAMESS中的实现
DOI： --
发表时间： 2008
期刊：
影响因子： --
作者： [上原広充, 大川侑久, 野口秀典, 阿部正明, 佐々木陽一, 魚崎浩平, Triana Widianti, D. G. Fedorov]
通讯作者： D. G. Fedorov
Theoretical Analysis of the Intermolecular Interaction Effects on the Excitation Energy of Organic Pigments: Solid State Quinacridone
DOI： 10.1021/jp804943m
发表时间： 2008-10-30
期刊： JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A
影响因子： 2.9
作者： [Fukunaga, Hiroo, Fedorov, Dmitri G., Kitaura, Kazuo]
通讯作者： Kitaura, Kazuo
共 26 条
    蛋白質・巨大分子系のための量子シミュレーターの開発
    国内基金
    海外基金
    FMO3-TMAO-PERK通路调控系统性硬化症纤维化进程的机制研究
    FMO3/TMAO轴调节卵母细胞-胎盘发育在胎儿生长受限中的作用及机制研究
    • 批准号：
      82301929
    • 项目类别：
      青年科学基金项目
    • 资助金额：
      30万元
    • 批准年份：
      2023
    • 负责人：
      蔺晓菁
    • 依托单位：
      重庆医科大学
    FMO2调控卵巢癌相关成纤维细胞活化以旁分泌途径促进上皮性卵巢癌转移的机制研究
    • 批准号：
      22ZR1450700
    • 项目类别：
      省市级项目
    • 资助金额：
      --
    • 批准年份：
      2022
    • 负责人：
      张稼闻
    • 依托单位：
      上海市第一人民医院
    TMA/FMO3/TMAO通路代谢物作为缺血性脑卒中预后标志的筛选和预警研究
    • 批准号：
      --
    • 项目类别：
      面上项目
    • 资助金额：
      52万元
    • 批准年份：
      2022
    • 负责人：
      仲崇科
    • 依托单位：
      苏州大学