A novel identification method of pathogenic Nocardia based on whole genome information

基于全基因组信息的致病性诺卡氏菌鉴定新方法

• 批准号: 19590441
• 负责人: MIKAMI Yuzuru
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Chiba University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2007
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2007 至 2008
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-19590441/
• 关键词: Nocardia; pathogenic actinotnycete; molecular taxonomy; gyrB gene; identification; ノカルジア; 病原放線菌; 分子分類学; 感染症; gyrB遺伝子

病原性Nocardiaの62菌種の基準株を用いて, 必須遺伝子であるgyrBの解析情報に基づく新しい分類体系の確立と同定法の開発を目的に研究を進めた. gysB情報に基づくNocardiaの系統学的な位置関係を16S rRNA遺伝子と比較した場合,16S rRNAの遺伝子に比べて, 3.6倍の差を示した. 病原性放線菌の中で, Nocardiaと同じくミコール酸を含む放線菌は8菌属があるがgyrB geneの特定の領域の配列を用いることにより, 容易に区別する方法を見出し報告することができた. また, 簡便な鑑別法を考案して報告した.

In order to use the pathogenic Nocardia strain 62 basic strain, it is necessary to analyze the situation of the pathogenic strain of gyrB, establish a new classification system, establish the same method, and conduct further research. In gysB, the position of 16s rRNA is much higher than that of Nocardia, and the difference of 16s rRNA is 3.6times. In pathogenic bacteria, Nocardia is the same as that in other bacteria. 8 strains of bacteria belong to the genus of bacteria, which are used in specific fields. It is easy to identify the results of the report by using the method. The identification method, the examination case, the report and the report.

项目成果

Phylogenetic studies of Gordonia species based on gyrB and secAl gene analysis

基于gyrB和secAl基因分析的大戟属物种系统发育研究

• 发表时间: 2009
• 期刊: Mycopathol 167
• 作者: Kang Y;Mikami Y;他2名
• 通讯作者: 他2名

Nocardia exalbida brain abscess in a partient with follicular lymphoma

滤泡性淋巴瘤患者的诺卡氏菌脑脓肿

• 发表时间: 2008
• 期刊: Int J Hematol 88
• 作者: Ono M;Mikami Y;他6名
• 通讯作者: 他6名

アゾール系抗真菌剤clotrimazoleのNocardia farcinicaにおける標的分子の探索

寻找唑类抗真菌克霉唑在猪诺卡氏菌中的靶分子

• 发表时间: 2008
• 作者: 志保沢里奈;小暮高久;三上襄
• 通讯作者: 三上襄

病原性放線菌Nocardia farcinicaにおけるアミカシン高度耐性化遺伝子の単離と解析

病原放线菌诺卡氏菌阿米卡星高抗性基因的分离与分析

• 发表时间: 2007
• 作者: 小暮高久;島田玲緒奈;矢澤勝清;三上襄
• 通讯作者: 三上襄

A Comprehensive phylogeny of Gordnia species based on 16S rDNA, gyrB, and secA1 gene analysis

基于 16S rDNA、gyrB 和 secA1 基因分析的 Gordnia 物种综合系统发育

• 发表时间: 2007
• 作者: 康穎情;武田健二郎;伊藤淳二;矢澤勝清;三上襄
• 通讯作者: 三上襄