食道癌に対する放射線化学療法感受性における遺伝子多型の役割

遗传多态性在食管癌放化疗敏感性中的作用

基本信息

  • 批准号:
    19591566
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 财政年份:
    2007
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2007 至 2008
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

[目的]「食道癌に対する放射線化学療法への感受性は,DNA修復や薬剤代謝遺伝子のsingle nucleotide polymorphism(SNP)によって差があるのか?」という疑問を明らかにすることである.2年間で約40例の食道癌手術症例を対象とし,癌組織及び正常組織よりgenomic DNAを抽出する.そのDNAをGeneChip Human Mapping 10K array(Affymetrix)にapplyし,DNA修復や薬剤代謝遺伝子上のSNPを検出する.SNP解析結果を放射線化学療法への反応性,あるいは抗悪性腫瘍薬による副作用出現といった臨床情報との相関性について検討し,食道癌における治療感受性規定遺伝子SNPの同定を行う.[対象]StageI,II:放射線化学療法前の内視鏡的生検検体StageIII,IV:手術検体癌病変からの検体摘出[方法]腫瘍組織よりDNA(250ng<)を抽出し、既に設置してある-80度冷凍庫に保存。その後抽出DNAを処理し、GeneChip Human Mapping 10K array(Affymetrix)にhybridizationする。(1)XbaI 処理、(2)アダプターにライゲーションする、(3)PCR による増幅、(4)断片化し terminaldeoxynucleotidyl transferaseを用いてビオチン化する、(4)チップにハイブリダイズする。(5)チップをstreptavidin-phycoerythrin処理,MAS 5.0 softwareにて蛍光量の測定[結果]進行食道がん12例に対して、放射線化学療法(Chemo-radio therapy: CRT)して(1)著効(CRTでCRかつCRT後1年以上再発なし)6例と2(2)無効(CRTでPRかつCRT後1年以内に再発し死亡した) 6例に上記遺伝子検索を行った。現在、データの解析は進行中である。
[目的]澄清这个问题:“对食管癌对放射化学疗法的敏感性是否取决于药物代谢基因中的DNA修复和单核苷酸多态性(SNP)?”这项研究在两年内针对大约40例食管癌症手术病例,并从癌症组织和正常组织中提取基因组DNA。该DNA用于使用Genechip人类映射10K适用于阵列(Affymetrix),以检测SNP在DNA修复和药物代谢基因上。检查了SNP分析结果与临床信息(例如放射化学疗法反应或由抗塑性药物引起的副作用的出现)的相关性,并确定可确定的SNP,这些SNP对于食管癌中的治疗敏感性确定。 [受试者] I期,II:放射化学疗法III之前的内镜活检标本,IV:癌症病变的手术标本[方法] DNA(250ng <)是从肿瘤组织中提取的,并存储在已经安装的-80°C冰箱中。然后对提取的DNA进行处理并杂交到人类映射10K阵列(Affymetrix)中。 (1)xbai处理,(2)与适配器结扎,(3)通过PCR扩增,(4)使用末端脱氧核苷酸转移酶进行碎片化,生物素化,(4)与芯片杂交。 (5)使用MAS 5.0软件[结果]在12例晚期食管癌症中进行上述基因搜索的尖端和荧光治疗,并在接受放射化学疗法(CRT)(CRT)(1)CRT(CRT和CRT)中(CRT)和不超过1年(CRT之后的1年)和2(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)(2)无效性(与CRT和死亡有关的PR)。目前,数据分析正在进行中。

项目成果

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