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アデニレーションドメインに対するテーラーメイドケミカルラベリング法の開発

アデニレーションドメインに対するテーラーメイドケミカルラベリング法の開発
开发腺苷酸化结构域的定制化学标记方法
批准号:
15J06198
负责人:
今野 翔
金额:
$1.09万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2015
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2015-04-24 至 2017-03-31

项目摘要

项目成果

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平成27年度は、アデニレーション(A)ドメインに対する合成分子プローブを基盤として、ペプチド性抗生物質であるグラミシジンS生産菌のプロテオーム中に存在する内在性GrsA及びGrsBのラベル化・検出法の確立を図った。まず、精製タンパク質においてラベル化されることが確認されているL-Pheに基質特異性を有するGrsAについて、グラミシジンS生産菌であるAneurinibacillus migulanus株のプロテオーム中に存在する内在性GrsAのラベル化・検出を試みた。L-Pheをリガンド部に有するL-Phe-AMS-BPyneを用いて種々条件を検討した結果、GrsAの分子量に相当する120 kDaの位置に特異的にラベル化されるバンドが確認された。そこで、このタンパク質が内在性GrsAであるか確認するため、タグ分子をビオチンに変換し、タンパク質の精製及び同定を試みたところ、内在性GrsAであることが明らかになった。次に、一つのタンパク質上に4つのAドメインが存在するGrsBに対するラベル化実験を行うことにした。GrsBは4つのモジュールからなる約500 kDaの巨大NRPSであり、そのAドメインはそれぞれ L-Pro、L-Val、L-Orn、L-Leuを基質とする。そこで、リガンド部にL-Pro、L-Val、L-Orn、L-Leu を有する4種類のプローブ及び阻害剤をそれぞれ合成し、A. migulanusのプロテオームに処理した。その結果、全てのプローブにおいて内在性GrsBの選択的ラベル化が確認された。また、プローブと阻害剤を組み合わせた競合実験から、それぞれのプローブはリガンド部のアミノ酸依存的にGrsB上の対応した基質特異性を有するAドメインを特異的にラベル化していることが明らかになった。
期刊论文(0)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间: 2015
期刊:
影响因子: --
作者: [今野翔, 石川文洋, 鈴木健裕, 堂前直, 掛谷秀昭]
通讯作者: 掛谷秀昭
DOI: 10.1021/acschembio.5b00097
发表时间: 2015-09-01
期刊: ACS CHEMICAL BIOLOGY
影响因子: 4
作者: [Ishikawa, Fumihiro, Konno, Sho, Kakeya, Hideaki]
通讯作者: Kakeya, Hideaki
DOI: 10.1039/c5cc04953a
发表时间: 2015-01-01
期刊: CHEMICAL COMMUNICATIONS
影响因子: 4.9
作者: [Kasai, Shota, Konno, Sho, Kakeya, Hideaki]
通讯作者: Kakeya, Hideaki
Profiling of nonribosomal peptide synthetase activities using active site-directed proteomic probes for adenylation domains
使用腺苷酸化结构域的活性定点蛋白质组探针分析非核糖体肽合成酶活性
DOI: --
发表时间: 2015
期刊:
影响因子: --
作者: [Sho Konno, Fumihiro Ishikawa, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Hideaki Kakeya]
通讯作者: Hideaki Kakeya
6
    Development of transition-state analogs for peptide macrocyclases
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