新規GalNAc特異的グリコシダーゼの立体構造に基づくオリゴ糖の合成と機能性開拓
新規GalNAc特異的グリコシダーゼの立体構造に基づくオリゴ糖の合成と機能性開拓
批准号:
16J03683
负责人:
佐藤 真与
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2016
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2016-04-22 至 2019-03-31
中文摘要
ビフィズス菌はヒトに有用な腸内細菌であり、難消化性糖質を利用するための様々な独自の機構や酵素を保持することが明らかとなってきた。本研究では、ビフィズス菌が利用するヒト由来の糖鎖に含まれる、N-アセチル基を有するN-アセチルガラクトサミンやN-アセ チルグルコサミンの代謝に関わるビフィズス菌由来の酵素に着目し、それらのX線結晶構造解析を行い、その分子機構を明らかにして いくことを目的としている。本年度はBifidobacterium bifidum由来α-N-アセチルガラクトサミニダーゼ(NagBb)、同種由来β-N-アセチルガラクトサミニダーゼ(SiaBb3)、そしてBifidobacterium longum由来UDP-グルコースヘキソース1-リン酸ウリジリルトランスフェラーゼ(GalT)に関して研究を行なった。NagBbに関しては、研究データをまとめ、J. Biol. Chem.誌にて論文を発表した。また、活性中心部位に存在するユニークな金属イオンの同定を試みるため、金属定量も行なった。SiaBb3に関しては、発現系、精製方法を確立した。結晶化スクリーニングまで行ったが、強い反射を得られる条件決定までには至らず、今後も引き続き模索していく必要がある。GalTに関しては、結晶最適化を行い多数のデータを得、現在解析中である。活性中心部位と基質の電子密度マップが見られないため、結晶化条件のさらなる改善・再検討が必要である。
英文摘要
ビフィズス菌はヒトに有用な腸内細菌であり、難消化性糖質を利用するための様々な独自の機構や酵素を保持することが明らかとなってきた。本研究では、ビフィズス菌が利用するヒト由来の糖鎖に含まれる、N-アセチル基を有するN-アセチルガラクトサミンやN-アセ チルグルコサミンの代謝に関わるビフィズス菌由来の酵素に着目し、それらのX線結晶構造解析を行い、その分子機構を明らかにして いくことを目的としている。本年度はBifidobacterium bifidum由来α-N-アセチルガラクトサミニダーゼ(NagBb)、同種由来β-N-アセチルガラクトサミニダーゼ(SiaBb3)、そしてBifidobacterium longum由来UDP-グルコースヘキソース1-リン酸ウリジリルトランスフェラーゼ(GalT)に関して研究を行なった。NagBbに関しては、研究データをまとめ、J. Biol. Chem.誌にて論文を発表した。また、活性中心部位に存在するユニークな金属イオンの同定を試みるため、金属定量も行なった。SiaBb3に関しては、発現系、精製方法を確立した。結晶化スクリーニングまで行ったが、強い反射を得られる条件決定までには至らず、今後も引き続き模索していく必要がある。GalTに関しては、結晶最適化を行い多数のデータを得、現在解析中である。活性中心部位と基質の電子密度マップが見られないため、結晶化条件のさらなる改善・再検討が必要である。
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α-N-アセチルガラクトサミニダーゼの金属結合サイトと阻害剤を用いた解析
使用金属结合位点和抑制剂分析 α-N-乙酰氨基半乳糖苷酶
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[佐藤真与, Dorothee Liebschner, 山田悠介, 松垣直宏, 千田俊哉, 荒川孝俊, 芦田久, 伏信進矢]
通讯作者:
伏信進矢
ビフィズス菌由来N-アセチルヘキソサミン 1-キナーゼの立体構造とオリゴ糖合成に向けた改変
双歧杆菌N-乙酰己糖胺1-激酶的三维结构及其寡糖合成修饰
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[佐藤真与, 荒川孝俊, 西本完, 北岡本光, 伏信進矢]
通讯作者:
伏信進矢
西オーストラリア大学(オーストラリア)
西澳大利亚大学(澳大利亚)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
The First Crystal Structure of a Family 129 Glycoside Hydrolase from a Probiotic Bacterium Reveals Critical Residues and Metal Co-factors
来自益生菌的 129 家族糖苷水解酶的第一个晶体结构揭示了关键残留物和金属辅因子
DOI:
10.1074/jbc.m117.777391
发表时间:
2017
期刊:
Journal of Biological Chemistry
影响因子:
4.8
作者:
[Mayo Sato, Dorothee Liebschner, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Takatoshi Arakawa, Siobhan S. Wills, Mitchell Hattie, Keith A. Stubbs, Tasuku Ito, Toshiya Senda, Hisashi Ashida and Shinya Fushinobu]
通讯作者:
Hisashi Ashida and Shinya Fushinobu
Crystal structure of glycoside hydrolase family 129 α-N-acetylgalactosaminidase from Bifidobacterium bifidum
双歧杆菌糖苷水解酶家族 129 α-N-乙酰半乳糖胺酶的晶体结构
DOI:
--
发表时间:
2017
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mayo Sato, Dorothee Liebschner, Yusuke Yamada, Naohiro Matsugaki, Takatoshi Arakawa, Toshiya Senda, Hisashi Ashida, and Shinya Fushinobu]
通讯作者:
and Shinya Fushinobu
共 6 条
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