ビフィズス菌とキサントモナス属細菌に共通して存在する新規糖鎖分解酵素郡の機能解析
双歧杆菌和黄单胞菌常见的新型糖酵解酶的功能分析
基本信息
- 批准号:22K05655
- 负责人:
- 金额:$ 2.58万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2022
- 资助国家:日本
- 起止时间:2022-04-01 至 2025-03-31
- 项目状态:未结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
令和4年度は、ウリ類褐斑病細菌(Xcu)に認められるビフィズス菌由来HypBA1およびHypBA2のホモログのクローニングと大腸菌を用いた組換えタンパク質発現を行い、それぞれの基質特異性について調査を行った。HypBA1のホモログは、Xcuのゲノム上に2つ存在していたことから、それぞれをXcuHypBA1-1とXcuHypBA1-2とし、pET-23bを用いてクローニング後、大腸菌でタンパク質を発現させたところ、いずれも可溶化タンパク質を得ることができた。そこで、これらの基質特性を調べたところ、XcuHypBA1-1は、1つのアラビノース(Ara)とヒドロキシプロリン(Hyp)が結合したAra-HypからAraを遊離することが分かった。一方、XcuHypBA1-2は、Ara-Hypに加え、Ara2-Hypにも作用することが分かった。ビフィズス菌由来HypBA1は、Araが2つ結合したβ-Ara2に作用することから、Xcu由来のHypBA1は、ビフィズス菌のものと機能が異なることが分かった。次に、XcuHypBA2のタンパク質発現を試みたところ、pET-23bではタンパク質が発現しなかったことから、pCold-TFを用いて融合タンパク質で発現させたところ可溶化タンパク質を得た。基質特性を調べたところ、Ara3-Hypからβ-Ara2を遊離することが分かった。これは、ビフィズス菌由来のHypBA2と同じ機能であった。XcuHypBA2をコードしている上流には、病原性遺伝子の転写に関わる因子(HrpX)が結合する領域(PIP-box)が認められたことから、XcuをHrpX誘導培地で培養し、遺伝子発現解析を行ったところ、XcuHypBA2遺伝子の発現が促進されることが分かった。つまり、Xcuが植物に感染する際、本遺伝子の発現がHrpXにより誘導されることが示唆された。
And four year は, ウ リ class leaf spot (Xcu) bacteria に recognize め ら れ る ビ フ ィ ズ ス bacteria origin HypBA1 お よ び HypBA2 の ホ モ ロ グ の ク ロ ー ニ ン グ と coliform を with い た group in え タ ン パ ク mass line 発 now を い, そ れ ぞ れ の substrate specificity に つ い を line っ て survey た. HypBA1 の ホ モ ロ グ は, Xcu の ゲ ノ ム に 2 つ exist on し て い た こ と か ら, そ れ ぞ れ を XcuHypBA1-1 と XcuHypBA1-2 と し, pET - 23 b を い て ク ロ ー ニ ン グ, coliform で タ ン パ ク qualitative を 発 now さ せ た と こ ろ, い ず れ も solubilization タ ン パ ク qualitative を must る こ Youdaoplaceholder0 た た. そ こ で, こ れ ら の matrix feature を adjustable べ た と こ ろ, は XcuHypBA1-1, 1 つ の ア ラ ビ ノ ー ス (Ara) と ヒ ド ロ キ シ プ ロ リ ン (Hyp) が し た Ara - Hyp か ら Ara を free す る こ と が points か っ た. One side, XcuHypBA1-2 に, Ara-Hypに plus え, Ara2-Hypに った effect する った とが part った った. ビ フ ィ ズ ス bacteria origin HypBA1 は, Ara が 2 つ combining し た beta Ara2 に role す る こ と か ら, Xcu origin の HypBA1 は, ビ フ ィ ズ ス bacteria の も の と function が different な る こ と が points か っ た. に, XcuHypBA2 の タ ン パ ク qualitative 発 を now try み た と こ ろ, pET - 23 b で は タ ン パ ク qualitative が 発 now し な か っ た こ と か ら, pCold - TF を い て fusion タ ン パ ク qualitative で 発 now さ せ た と こ ろ solubilization タ ン パ ク qualitative を た. The matrix characteristics are を modulation べたと とが ろ ろ ろ, Ara3-Hyp ら らβ-Ara2を free する とが とが division った った. Youdaoplaceholder2 れ ビフィズス and ビフィズス bacteria originate from HypBA2と and じ function であった. XcuHypBA2 を コ ー ド し て い る upper に は, pathogenicity but 伝 の planning write に masato わ る factor (HrpX) が す る areas (PIP - box) が recognize め ら れ た こ と か ら, Xcu を HrpX induced the petty で し, heritage 伝 son 発 now line analytical を っ た と こ ろ, XcuHypBA2 but 伝 の 発 が promote now Youdaoplaceholder0 される とが points とが った. つ ま り, Xcu が plant に infection す る interstate, this but 伝 の 発 now が HrpX に よ り induced さ れ る こ と が in stopping さ れ た.
项目成果
期刊论文数量(0)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
中村 正幸其他文献
Xanthomonas属細菌由来β-L-アラビノフラノシダーゼの結晶構造
黄单胞菌β-L-阿拉伯呋喃糖苷酶的晶体结构
- DOI:
- 发表时间:
2017 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
澤野 孝太;丸山 瞬;荒川 孝俊;中村 正幸;石渡 明弘;伊藤 幸成;藤田 清貴;伏信 進矢 - 通讯作者:
伏信 進矢
中村 正幸的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
相似海外基金
糖鎖分解酵素NEU1による脂肪分解抑制のメカニズムの解明
阐明糖酵解酶 NEU1 抑制脂肪分解的机制
- 批准号:
21K06550 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 2.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
特異的糖鎖分解酵素を用いた植物プロテオグリカンの情報伝達機構の解明
使用特定糖酵解酶阐明植物蛋白聚糖的信息传递机制
- 批准号:
16J05924 - 财政年份:2016
- 资助金额:
$ 2.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
線虫由来の糖鎖分解酵素の生理機能の解明と糖鎖の代謝機構の解析に関する研究
线虫源糖酵解酶生理功能解析及糖链代谢机制研究
- 批准号:
03J05700 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 2.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
多機能性蛋白による糖鎖分解酵素の制御機構とその欠損症の分子病理
多功能蛋白对糖酵解酶的控制机制及其缺陷的分子病理学
- 批准号:
07259222 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 2.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
糖鎖分解酵素遺伝子の機能障害の解析と動物モデル作製による糖鎖遺伝子情報の解析
通过建立动物模型分析糖酵解酶基因的功能障碍和聚糖基因信息分析
- 批准号:
06267208 - 财政年份:1994
- 资助金额:
$ 2.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
多機能性蛋白による糖鎖分解酵素の制御機構とその欠損症の分子病理
多功能蛋白对糖酵解酶的控制机制及其缺陷的分子病理学
- 批准号:
06267224 - 财政年份:1994
- 资助金额:
$ 2.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
多機能性蛋白による糖鎖分解酵素の制御機構とその欠損症の分子病理
多功能蛋白对糖酵解酶的控制机制及其缺陷的分子病理学
- 批准号:
05274229 - 财政年份:1993
- 资助金额:
$ 2.58万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas