候補遺伝子アプローチによる薬剤毎の間質性肺炎原因多型の究明と診断法確立

使用候选基因方法研究引起间质性肺炎的每种药物的多态性并建立诊断方法

• 批准号: 25870378
• 负责人: 水澤 精穂
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-25870378/
• 关键词: 薬学; 薬剤誘発間質性肺炎; 候補遺伝子シークエンス; 服薬前診断; ファーマコゲノミクス

重篤な薬剤副作用である間質性肺炎の原因同定を効率的に実施する手技の確立が目的であった。副作用は、発症頻度から、原因究明は検体数収集が可能となる市販後が主となる。副作用原因について臨床開発段階で推察できるのであれば、（副作用頻度が仮に一割程度でも服薬前診断で回避できるなら）副作用を主因とする開発中止を阻止し、治療の選択肢を増やす蓋然性が高まる。本来的に、臨床開発および市販後調査共に全ゲノム解析が理想ではあるが、現状ではコストと計算所要時間に無理がある。その打開策として、薬剤毎の薬物動態と薬力学関連遺伝子を候補として当該領域の多型と副作用の調査が出来ることが重要で、それでも副作用原因が同定されない場合にゲノム広全域にステージアップさせることが効率的となる。本課題は、間質性肺炎を招く薬剤で、①薬剤毎の薬物動態／薬力学関連（候補）遺伝子の抽出と、②ターゲット領域のシークエンス法を平成25～27年度に確立する計画であった。平成26年度については、昨年度までの報告の通り、Illumina社GWAS Omin2.5Mによる遺伝子型と照合し、99%以上の一致を確認しており、候補遺伝子抽出の仕組みの構築が主たる作業となった。ここまでは順調に実施され、当年度時点において遺伝統計学的な手法を用い計算機上に実装するのが主たる内容であった。だが基本設計の部分での精度の確保が達成されておらず、更なる検討が必要と考えられる。この点は、機器製造者提供部分で解決できない情報処理が課題であるが、その精度についてはあるいは、今後医療制度内で懸案となる個人を識別する疫学的な情報より得られる臨床的知見との連携を、実装を見据えて情報面で計画する必要があるのではないかと考える。

The cause of interstitial pneumonia is the same as that of the effective treatment. Side effects are not the same as the frequency of symptoms, and the investigation of the cause is not the same as the possibility of collecting the number of cases. The causes of side effects include the clinical development stage, the prediction of side effects, the frequency of side effects, the prevention of side effects, the increase of treatment options, and the high probability of side effects. The original, clinical development and post-marketing investigation are all based on the analysis of the ideal, the current situation and the calculation of the required time. The open policy is to use the dynamic and mechanical-related factors of the drug in the field. When the investigation of multiple types and side effects in the field is carried out, the causes of side effects are determined. In the case of global drug use, the probability of side effects is determined. This project aims to establish a plan for the development of interstitial pneumonia in 2005 - 2007, including: (1) extraction of dynamic/dynamic correlation (candidate) genes of various drugs; and (2) identification and treatment methods in different fields. Heisei 26 years of research, yesterday's report of communication, Illumina GWAS Omin2.5M research, more than 99% of the consistency of the identification, candidate selection, construction of the main work. This is the main content that can be implemented in sequence, used in genetic statistics at the time of the year, and installed on a computer. Part of the basic design is to ensure that accuracy is achieved, and further examination is necessary. This point, machine manufacturers provide part of the solution to the problem of information processing, precision, future medical system, pending cases, individual identification, epidemiological information, clinical knowledge, connection, installation, information surface planning, necessary, examination, etc.

项目成果

NUDT3 rs206936 is associated with body mass index in obese Japanese women.

• DOI: 10.1507/endocrj.ej13-0100
• 发表时间: 2013-08
• 期刊: Endocrine journal
• 影响因子: 2
• 作者: A. Kitamoto;T. Kitamoto;Seiho Mizusawa;H. Teranishi;R. So;T. Matsuo;Y. Nakata;H. Hyogo;H. Ochi;Takahiro Nakamura;S. Kamohara;N. Miyatake;K. Kotani;R. Komatsu;N. Itoh;I. Mineo;J. Wada;M. Yoneda;A. Nakajima;T. Funahashi;S. Miyazaki;K. Tokunaga;H. Masuzaki;T. Ueno;K. Chayama;K. Hamaguchi;Kentaro Yamada;T. Hanafusa;S. Oikawa;T. Sakata;Kiyoji Tanaka;Y. Matsuzawa;K. Nakao;A. Sekine;K. Hotta

Association of polymorphisms in GCKR and TRIB1 with nonalcoholic fatty liver disease and metabolic syndrome traits

• DOI: 10.1507/endocrj.ej14-0052
• 发表时间: 2014-07-01
• 期刊: ENDOCRINE JOURNAL
• 影响因子: 2
• 作者: Kitamoto, Aya;Kitamoto, Takuya;Hotta, Kikuko
• 通讯作者: Hotta, Kikuko

Targeted next-generation sequencing and fine linkage disequilibrium mapping reveals association of PNPLA3 and PARVB with the severity of nonalcoholic fatty liver disease

• DOI: 10.1038/jhg.2014.17
• 发表时间: 2014-05-01
• 期刊: JOURNAL OF HUMAN GENETICS
• 影响因子: 3.5
• 作者: Kitamoto, Takuya;Kitamoto, Aya;Hotta, Kikuko
• 通讯作者: Hotta, Kikuko

Genome-wide scan revealed that polymorphisms in the PNPLA3, SAMM50, and PARVB genes are associated with development and progression of nonalcoholic fatty liver disease in Japan

• DOI: 10.1007/s00439-013-1294-3
• 发表时间: 2013-07-01
• 期刊: HUMAN GENETICS
• 影响因子: 5.3
• 作者: Kitamoto, Takuya;Kitamoto, Aya;Hotta, Kikuko
• 通讯作者: Hotta, Kikuko