3本鎖DNA結合蛋白質STM1の3本鎖DNA認識機構と生物学的意義の解明

阐明三链DNA结合蛋白STM1的三链DNA识别机制及其生物学意义

• 批准号: 08J00286
• 负责人: 片山 拓馬
• 金额: $ 0.77万
• 依托单位: Tokyo University of Science
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-08J00286/
• 关键词: 3本鎖DNA; 3本鎖DNA結合蛋白質; ゲルシフト; 遺伝子発現制御; グルシフト

出芽酵母の3本鎖DNA結合蛋白質STM1の同定に用いられた3本鎖DNAであるPur19:Pur33:Pyr33について、配列を短縮したものや、塩基に一連の点変異を導入した変異型3本鎖DNA用オリゴヌクレオチドを調製し、変異型3本鎖DNAを形成させた。変異型3本鎖DNAと、既に我々が明らかにしているSTM1の3本鎖DNA結合ドメイン(STM1DBD)との結合活性をゲルシフト法で測定し、Pur19:Pur33:Pyr33の長さを短縮した場合や塩基に点変異を導入した場合に、変異のない場合と比べてどのくらい結合活性が変化するかを解析した。Pur19:Pur33:Pyr33の長さが短くなると、STM1DBDとの結合能は低下したが、Pur19:Pur33:Pyr33に点変異を導入しても、STM1DBDとの結合能はほとんど変化しなかった。さらに、Pur19:Pur33:Pyr33と塩基配列が全く異なる、ヒトのRas遺伝子上流の塩基配列から構成される3本鎖DNAとSTM1DBDとの結合能をゲルシフト法で解析したところ、STM1DBDはPur19:Pur33:Pyr33に結合するのと同等のレベルの結合能で、Ras遺伝子上流の塩基配列からなる3本鎖DNAとも結合した。以上より、STM1DBDは、3本鎖DNAの塩基配列よりも3本鎖DNAの形状を認識して結合することが明らかになった。転写制御因子など2本鎖DNAに特異的に結合する蛋白質の2本鎖DNA認識機構に関する知見は急速に蓄積されつつあるが、3本鎖DNAに特異的に結合する蛋白質の3本鎖DNAの認識機構に関する報告は無く、これを明らかにした本研究成果の意義は大きい。また、ヒトのRas遺伝子上流配列から形成させた3本鎖DNAとSTM1DBDとの結合能が明らかとなったことは、ヒトにおける3本鎖DNA結合蛋白質と3本鎖DNAによる遺伝子発現制御の可能性を示唆し、重要である。

Yeast sprouting yeast 3 copies of DNA binding protein STM1 were used to determine the size of 3 books of DNA binding proteins, matching of 3 copies of short copies of DNA, placement of short copies of genes, and introduction of 3 copies of DNA into 3 copies of Saccharomyces cerevisiae. This is the third edition of DNA, the third edition, the second edition, the third edition, the second edition, the second The combination of long-term and short-term performance of Pur19:Pur33:Pyr33, combination of STM1DBD and Pur19:Pur33:Pyr33, and combination of STM1DBD and STM1DBD can improve the performance of the system. In this paper, we use the method of analyzing the whole data, the data of the whole Ras, the data of the upstream of the Ras, the combination of the DNA and the STM1DBD, the analysis of the data, the combination of the STM1DBD and the Pur19:Pur33:Pyr33, the binding energy of the DNA, the data of the DNA, the binding energy of the data, and the data of the DNA. The above books, STM1DBD books, and 3 books of DNA books are equipped with 3 books of books of DNA shapes. In this paper, we write the combination of protein and protein in the DNA special edition. In this DNA, we have learned that there is a rapid accumulation of information about the rapid storage of the protein in the database, and that the results of this study are of great significance. 3. The report on the combination of protein in the DNA database is not available, and it is clear that the results of this research are significant. The high-level configuration of the first and third Ras cells to form a combination of the three DNA STM1DBD devices can show the possibility and importance of the combination of the three DNA binding proteins and the three DNA binding proteins.

项目成果

出芽酵母3本鎖DNA結合蛋白質STM1の3本鎖DNA認識機構

酿酒酵母三链DNA结合蛋白STM1的三链DNA识别机制

• 发表时间: 2009
• 作者: 片山拓馬;鳥越秀峰
• 通讯作者: 鳥越秀峰

Synergistic Stabilization of Nucleic Acid Assembly by 2′-O,4′-C-Methylene-Bridged Nucleic Acid Modification and Additions of Comb-Type Cationic Copolymers

• DOI: 10.1021/bi801795z
• 发表时间: 2009-04-21
• 期刊: BIOCHEMISTRY
• 影响因子: 2.9
• 作者: Torigoe, Hidetaka;Maruyama, Atushi;Katayama, Takuma
• 通讯作者: Katayama, Takuma