プロトン駆動型べん毛モータの動態の光ナノ計測と分子シミュレーション

质子驱动鞭毛马达动力学的光学纳米测量和分子模拟

基本信息

  • 批准号:
    08J03125
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 0.77万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2008
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2008 至 2009
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

1.べん毛モーター固定子蛋白質MotA Pro-173の機能解析運動性細菌は、細胞膜に埋まって存在するべん毛モーターを回転させることにより、モーターに連結するべん毛繊維をスクリューのように回転させて泳ぐ。べん毛モーターはプロトンの電気化学的ポテンシャル差を回転力に変換することが知られているが、詳しい作動機構は明らかにされていない。本研究では、細菌べん毛モーターの作動機構を解明することを目的として、サルモネラ菌べん毛モーターの固定子蛋白質MotAのPro-173がAlaに変異したことにより機能が低下した、変異型べん毛モーター(P173A)について、光学顕微鏡を用いた一分子計測法による出力特性解析を行なった。直径0.1-2.0μmのポリスチレンビーズをべん毛繊維に付着させ、ビーズの位置変化をフォトダイオードや高速度CCDカメラで検出する、ビーズ法と呼ばれる手法を用いて、モーターの回転速度とトルクを求めた。その結果、P173Aモーターは野生型と同等のトルクを発生できるが、野生型に比べてプロトンの透過活性が著しく低下していることが分かった。P173Aモーターの出力特性を、動力学的モデルを用いて再現することにより、MotAのPro-173を中心とした固定子蛋白質の構造変化がプロトンの透過反応を促進しており、P173Aの変異によって正常なプロトン透過が阻害されたことが分かった。本研究の結果は、プロトン流とモーター蛋白質のダイナミクスの共役を明らかにした点で重要である。2.エレクトロローテション本研究では、高周波の回転電場中でビーズ法を行なう手法を確立した。電場の周波数や溶液導電率等を考慮した条件検討により、べん毛繊維に付着させたビーズに電場強度依存的な外部トルクを与えることに成功した。今後、この手法を用いることで、これまで以上に広範かつ多様な条件での出力解析が可能になると期待できる。
1. Functional analysis of MotA Pro-173, a protein immobilized on the cell membrane of motile bacteria. The electrical and chemical characteristics of the reaction mechanism are different, and the reaction mechanism is different. In this study, we investigated the mechanism of bacterial growth by molecular measurement and analysis of the force characteristics of immobilized protein MotA Pro-173A. The diameter of 0.1-2.0μm is different from the diameter of 0.1 -2.0μm. The position of 0.1- 2.0 μ m is different from that of 0.1 - 2.0 μ m. The position of 0.1 - 2.0 μ m is different from that of 0.1 - 2.0 μ m. The position of 0.1 - 2.0 μ m is different from that of 0.1 - 2.0 μ m. As a result, P173A was found to have a lower transmission activity than wild-type and wild-type. P173A is A kind of protein that can be used to improve the strength and dynamics of P173A. The structure of P173A is mainly composed of Pro-173 and MotA. The results of this study are important for understanding the role of protein in protein metabolism. 2. In this study, the method of high frequency electric field was established. The frequency of the electric field and the conductivity of the solution are considered. In the future, this method will be used in the above range and under various conditions, the output analysis will be possible and expected.

项目成果

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会议论文数量(0)
专利数量(0)
MotB(D33E)変異体とそのサプレッサー変異体モーターのトルク発生機構の解析
MotB(D33E)突变体及其抑制突变电机扭矩产生机制分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    中村修一;etal;蔡栄淑
  • 通讯作者:
    蔡栄淑
Forward and backward stepping rotation by proton-driven bacterial flagellar motor
质子驱动细菌鞭毛马达向前和向后步进旋转
  • DOI:
  • 发表时间:
    2010
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    中村修一;etal
  • 通讯作者:
    etal
Role of a conserved prolyl residue (Pro173) of MotA in the mechanochemical reaction cycle of the proton-driven flagellar motor of Salmonella.
MotA 的保守脯氨酰残基 (Pro173) 在沙门氏菌质子驱动鞭毛马达的机械化学反应循环中的作用。
  • DOI:
    10.1016/j.jmb.2009.08.022
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Shuichi Nakamura;Yusuke V. Morimoto;N. Kami‐ike;T. Minamino;K. Namba
  • 通讯作者:
    K. Namba
Characterisation of filament assembly in Caulobacter crescentus
新月柄杆菌丝组装的表征
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Birchall;C.
  • 通讯作者:
    C.
Effect of Intracellular pH on the Torque-Speed Relationship of Bacterial Proton-Driven Flagellar Motor
  • DOI:
    10.1016/j.jmb.2008.12.034
  • 发表时间:
    2009-02-20
  • 期刊:
  • 影响因子:
    5.6
  • 作者:
    Nakamura, Shuichi;Kami-ike, Nobunori;Namba, Keiichi
  • 通讯作者:
    Namba, Keiichi
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
  • 发表时间:
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  • 影响因子:
    0
  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    山上 亜美;安川 直樹;中村 修一
  • 通讯作者:
    中村 修一
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  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    安川 直樹;山上 亜美;中村 修一
  • 通讯作者:
    中村 修一

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知道了