RNAの選択的化学修飾を目指した官能基転移能を持つ人工核酸の開発

开发具有官能团转移能力的人工核酸,用于RNA的选择性化学修饰

基本信息

  • 批准号:
    08J05090
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 1.15万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 财政年份:
    2008
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2008 至 2010
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究ではRNAの部位特異的修飾を目指し、官能基を転移する機能性核酸の開発を行った。これまでに、ジカルボニル型のα,β不飽和ケトンを転移基とすることで、中性条件下でシトシンに対して、アルカリ性条件下または遷移金属カチオン存在下でグアニンに対して選択的な修飾に成功していた。引き続き、金属錯体形成による転移官能基活性化を検討するため、金属キレート部位をもつ2-ピリジンモノケトン型転移基を設計した。様々な2価の金属カチオンを用いて反応の検討を行ったところ、触媒量のNi^<2+>でシトシン選択的に進行することを見出した。さらに大過剰のNi^<2+>存在下では選択性がグアニンに変わることも見出した。2-ピリジンモノケトン型転移基は、金属非存在下では非常に安定であること、極微量の金属によって反応の制御が可能であることから、ラベル化やRNA編集技術等様々な展開が可能である。次に官能基転移反応をクリック反応と組み合わせることで、簡便かつ効率的なRNAの部位特異的修飾法を検討した。具体的には、末端アルキンを持つ転移基を合成し転移反応の検討を行った。その結果、わずか10分で90%のRNAを修飾することに成功した。続いて、蛍光基やビオチン等の様々な化合物のアジド体を用いクリック反応を行った。反応は単純な化合物では10分以内に、大きな化合物でも50分以内に定量的に進行した。さらにこのラベル化法をmRNAに対して行ったところ、ビオチン基を修飾することに成功した。この迅速かつ高収率なラベル化法は、これまでにない画期的な手法であり、今後、多種多様の修飾が可能になると考えている。
In this study, site-specific modifications of RNA were identified and functional groups were transferred to develop functional nucleic acids. In the presence of α-,β-unsaturated molecules, the modification of α-, β-unsaturated molecules is successful under neutral conditions. The design of a 2-phase transition group for the formation of a metal complex and the activation of a transition group for the formation of a metal complex The metal oxide layer of the catalyst layer is formed by the metal oxide layer and the catalyst layer. In the presence of a large number of Ni^<2+>, it is possible to select the right candidate. 2-D transition matrix, metal non-existence, very stable, small amount of metal, anti-reaction control, possible, rare-reaction, RNA compilation technology, etc. A site-specific modification of RNA with high efficiency is discussed. The specific structure of the system is described in detail below. 90% of RNA modifications were successful. The chemical composition of the compound is characterized by high purity, high purity and high purity. Pure compounds are quantified within 10 minutes and large compounds within 50 minutes. This is the first time that we've had a successful response to this challenge. This is a quick and easy way to improve the quality of your products.

项目成果

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Site-specific modification of RNA by functionality-transfer ODNprobes
通过功能转移 ODN 探针对 RNA 进行位点特异性修饰
  • DOI:
  • 发表时间:
    2009
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Jiageng Chen;Yuichi Futa;Atsuko Miyaji;and Chunhua Su;堀田圭佑,佐野由希子,肥後芳樹,楠本真二;T. Shindo;Tsutomu Chiba;Onizuka K.
  • 通讯作者:
    Onizuka K.
A NEW ODORLESS PROCEDURE FOR THE SYNTHESIS OF 2′-DEOXY-6-THIOGUANOSINE AND ITS INCORPORATION INTO OLIGODEOXYNUCLEOTIDES
  • DOI:
    10.1080/15257770903155576
  • 发表时间:
    2009-01-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.3
  • 作者:
    Onizuka, Kazumitsu;Taniguchi, Yosuke;Sasaki, Shigeki
  • 通讯作者:
    Sasaki, Shigeki
Site-specific modification by functionality-transfer oligonucleotide with the photo-inducible reactivity
通过具有光诱导反应性的功能转移寡核苷酸进行位点特异性修饰
  • DOI:
  • 发表时间:
    2008
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Kazumitsu Onizuka;et al.;Kazumitsu Onizuka;Kazumitsu Onizuka
  • 通讯作者:
    Kazumitsu Onizuka
A new usage of functionalized oligodeoxynucleotide probe for site-specific modification of a guanine base within RNA.
  • DOI:
    10.1093/nar/gkp930
  • 发表时间:
    2010-03
  • 期刊:
  • 影响因子:
    14.9
  • 作者:
    Onizuka K;Taniguchi Y;Sasaki S
  • 通讯作者:
    Sasaki S
Activation and Alteration of Base Selectivity by Metal Cations in the Functionality-Transfer Reaction for RNA Modification
  • DOI:
    10.1021/bc100131j
  • 发表时间:
    2010-08-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.7
  • 作者:
    Onizuka, Kazumitsu;Taniguchi, Yosuke;Sasaki, Shigeki
  • 通讯作者:
    Sasaki, Shigeki
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