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不確実な情報のもとで論理推論を行い機能性分子を産生する反応システムの構築

不確実な情報のもとで論理推論を行い機能性分子を産生する反応システムの構築
构建在不确定信息下进行逻辑推理产生功能分子的反应系统
批准号:
20200005
负责人:
小宮 健
金额:
$20.8万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research a proposed research project)
财政年份:
2008
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2008 至 2010

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项目成果

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溶液中に存在する分子の分布をセンシングし、プログラムにしたがって分子が情報を処理し、出力として機能性分子を合成する、自律的な反応システムの実現に向けて、要素機能を実現する反応モジュールを構築した。microRNA(miRNA)もしくはモデルとしてのオリゴDNAをセンシングする「検査反応モジュール」について、高感度な検出および多種の検出ができることを実証した。また、DNA配列に符号化した診断プログラムにしたがい、カスケード化されたDNA合成により転写パターン情報を処理する「診断反応モジュール」を構築し、カスケード反応が特異性高く進行することを確認した。本研究で構築する一連のプロセスを実行する知的な反応システムは、複数の分子が多段階に反応するシステムであるため、多様な反応パラメータを実験のみで効果的に調整することは困難であった。そこで反応モデルを構築して、ハイスループットなリアルタイムPCR装置を用いた蛍光測定とシミュレーションを併用しながら、最適な反応条件の検討を行った。さらに、ガン細胞に特徴的なmiRNA転写パターンと推論した場合、ガン抑制に有効なRNA配列を出力する「投薬反応モジュール」のモデル反応として、カスケード化されたDNA合成に続いて同一反応溶液中で起こるRNA合成反応を実現した。本反応システムを細胞に対して動作させることを目指し、カスケード反応を小さな分子で制御できるように拡張する機構についても検討した。
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会议论文
Construction of molecular modules for an intelligent molecular robot that implements sensing, judgment and synthesis for controlling biological events without human intervention
智能分子机器人的分子模块构建,无需人工干预即可实现感知、判断和合成来控制生物事件
DOI: --
发表时间: 2011
期刊:
影响因子: --
作者: [K.Komiya, A.Kobayashi, Masayuki Yamamura]
通讯作者: Masayuki Yamamura
Transcription control by a synthetic thermal band pass filter implemented with a single DNA molecule
通过使用单个 DNA 分子实现的合成热带通滤波器进行转录控制
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: [K.Komiya, M.Yamamura, J.A.Rose]
通讯作者: J.A.Rose
標的核酸の検出方法及びキット
靶核酸检测方法及试剂盒
DOI: --
发表时间: 2010
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
自律DNA分子計算-in vitroインテリジェンスの構築
自主DNA分子计算——构建体外智能
DOI: --
发表时间: 2010
期刊: 計測自動制御学会論文集
影响因子: --
作者: [小宮健, ジョンA.ローズ, 山村雅幸]
通讯作者: 山村雅幸
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    実世界で動作するDNAナノマシン構築手法の確立
    クロック制御された動作をする知的DNAナノマシンの構築
    • 批准号:
      21700331
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $2.75万
    • 财政年份:
      2009
    • 负责人:
      小宮 健
    • 依托单位:
    DNAオシレータの構築
    • 批准号:
      18700298
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $2.24万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      小宮 健
    • 依托单位:
    自律演算するDNAコンピューター
    • 批准号:
      01J06242
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.92万
    • 财政年份:
      2001
    • 负责人:
      小宮 健
    • 依托单位: