DEVELOPMENT OF MULTILEVEL FRAGMENT MOLECULAR ORBITAL METHOD
DEVELOPMENT OF MULTILEVEL FRAGMENT MOLECULAR ORBITAL METHOD
多级片段分子轨道方法的发展
批准号：
20350004
负责人：
KITAURA Kazuo
金额：
$12.4万
依托单位：
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
项目状态：
已结题
起止时间：
2008 至 2010
中文摘要
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英文摘要
We have develped the multilevel fragment molecular orbital method in which effective fragment potential (EFP), molecular mechanics (MM), and polarizable continuum solvent model (PCM) have been interfaced with the the fragment molecular orbital (FMO) method. The method facilitates geometry optimizations and molecular dynamics simulations of large molecular systems and is expected to be usuful in simulation studies of biomolecules.
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Detailed Electronic Structure Studies Revealing the Nature of Protein-Ligand Binding, in "The Fragment Molecular Orbital Method : Practical Applications to Large Molecular Systems",(D.G. Fedorov, K.Kitaura (Eds.))(Boca Raton)
详细的电子结构研究揭示了蛋白质-配体结合的本质，在“片段分子轨道方法：大分子系统的实际应用”中，（D.G. Fedorov，K.Kitaura（编辑））（博卡拉顿）
详细的电子结构研究揭示了蛋白质-配体结合的本质，在“片段分子轨道方法：大分子系统的实际应用”中，（D.G. Fedorov，K.Kitaura（编辑））（博卡拉顿）
DOI：
--
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
--
作者：
[I.Nakanishi, D.G.Fedorov, K.Kitaura]
通讯作者：
K.Kitaura
ホームページ等。
主页等
主页等
DOI：
--
发表时间：
期刊：
影响因子：
--
作者：
[]
通讯作者：
A combined effective potential-fragment molecular orbital method. I. The energy expression and initial applications
一种有效的势-碎片分子轨道组合方法。
一种有效的势-碎片分子轨道组合方法。
DOI：
--
发表时间：
2009
期刊：
J.Chem.Phys. 131
影响因子：
--
作者：
[T.Nagata, D.G.Fedorov, K.Kitaura, M.S.Gordon]
通讯作者：
M.S.Gordon
Fully analytic gradient in the fragment molecular orbital method
片段分子轨道法中的完全解析梯度
片段分子轨道法中的完全解析梯度
DOI：
--
发表时间：
期刊：
J.Cehm.Phys. 134 in press
影响因子：
--
作者：
[T.Nagata, K.Brorsen, D.G.Fedorov, K.Kitaura, M.S.Gordon]
通讯作者：
M.S.Gordon
Binding free energy calculations of protein-ligand complexes using the fragment molecular orbital method combined with continuum solvent model
片段分子轨道法结合连续溶剂模型计算蛋白质-配体复合物的结合自由能
片段分子轨道法结合连续溶剂模型计算蛋白质-配体复合物的结合自由能
DOI：
--
发表时间：
2009
期刊：
影响因子：
--
作者：
[松下智久, 浜崎亜富, 尾関寿美男, Kazuo Kitaura]
通讯作者：
Kazuo Kitaura
共 8 条
Electronic structure calculations on K^+ ion channel protein
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批准号：14540482
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项目类别：Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额：$2.62万
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财政年份：2002
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负责人：KITAURA Kazuo
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依托单位：
海外基金