Analysis of the unculturable microbial populations in human gut microbiota

人类肠道微生物群中不可培养的微生物种群分析

• 批准号: 20510187
• 负责人: KUWAHARA Tomomi
• 金额: $ 3.08万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20510187/
• 关键词: 腸内菌叢; 難培養菌; ゲノム; Segmented filamentous bacteria; シークエンス; 代謝経路; 腸管免疫; Th17; ヒト腸内菌; 難培養性細菌; フラジェリン; 菌叢解析; ゲルマイクロドロップ法; 16S rDNA; セルソーター; 多様性

Human harbors the numerous microbes at environmentally exposed anatomical sites. These microbes constitute the unique ecosystem called resident microflora. Gut microflora is the largest microbial ecosystem in human, which contains over 100 trillions of microbes of nearly 1,000 species. Gut microflora provides beneficial effects to the host through digestion of nutrients, synthesis of essential vitamins, and colonization resistance to enteric pathogens. However, the molecular mechanism of host-microbe symbiosis in the gut is largely unknown due to the fact that the majority of gut microflora is unculturable bacteria. It is important to disclose the biology of the unculturable populations to address the molecular interaction between the host and intestinal microbes. Herein, we determined the whole genome sequence of segmented filamentous bacteria that are representative gut unculturable microbes.

人类在环境暴露的解剖部位上拥有许多微生物。这些微生物构成了一个独特的生态系统，称为居民菌群。肠道菌群是人类中最大的微生物生态系统，其中包含超过100万亿微生物的近1,000种。肠道菌群通过消化营养，必需维生素的合成以及对肠道病原体的定殖抗性为宿主提供有益的影响。然而，由于大多数肠道菌群是无法培养的细菌，因此肠道中宿主 - 微生物共生的分子机制在很大程度上是未知的。重要的是要披露不可养殖种群的生物学，以解决宿主和肠道微生物之间的分子相互作用。在此，我们确定了代表性肠道不可培养的微生物的分段细菌的整个基因组序列。

项目成果

Molecular genetic investigations of contaminated contact lens storage cases as reservoirs for Pseudomonas aeruginosa keratitis.

作为铜绿假单胞菌角膜炎储存库的受污染隐形眼镜储存盒的分子遗传学研究。

• 发表时间: 2010
• 期刊: Jpn J Ophthalmol 54
• 作者: Ogushi Y;Eguchi H;Kuwahara T;Hayabuchi N;Kawabata M.
• 通讯作者: Kawabata M.

Genomic analysis of unculturable gut microbe,「超高速ゲノム解読時代における細菌学研究」

不可培养肠道微生物的基因组分析，“超高速基因组解码时代的细菌学研究”

• 发表时间: 2010
• 作者: Kataoka K;et al.;鈴木美穂・高橋祥子・道羅英夫・切岩祥和・藤原正幸・深尾陽一郎・本橋令子;桑原知巳;桑原知巳
• 通讯作者: 桑原知巳

ヒト常在フローラ研究の最前線

人类菌群研究的前沿

• 发表时间: 2008
• 作者: Kataoka K;et al.;鈴木美穂・高橋祥子・道羅英夫・切岩祥和・藤原正幸・深尾陽一郎・本橋令子;桑原知巳;桑原知巳;桑原知巳;桑原知巳;桑原知巳
• 通讯作者: 桑原知巳

難培養性腸内細菌ゲノムへのアプローチー

难培养肠道细菌基因组研究进展

• 发表时间: 2010
• 作者: Kataoka K;et al.;鈴木美穂・高橋祥子・道羅英夫・切岩祥和・藤原正幸・深尾陽一郎・本橋令子;桑原知巳
• 通讯作者: 桑原知巳

Efficient Electrotransformation of Bacteroides fragilis

• DOI: 10.1128/aem.02420-09
• 发表时间: 2010-05-01
• 期刊: APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 4.4
• 作者: Ichimura, Minoru;Nakayama-Imaohji, Haruyuki;Kuwahara, Tomomi
• 通讯作者: Kuwahara, Tomomi