THEORETICAL AND COMPUTATIONAL ANALYSES OF DRUG-RECEPTOR INTERACTION CONSIDERING HYDROPHOBIC INTERACTION

考虑疏水相互作用的药物-受体相互作用的理论和计算分析

• 批准号: 20590036
• 负责人: CHUMAN Hiroshi
• 金额: $ 3万
• 依托单位: The University of Tokushima
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2010
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20590036/
• 关键词: 創薬理論計算化学; 定量的構造活性相関; 自由エネルギーの代表項による結合エネルギーの線形表現; フラグメント型非経験的分子軌道法; 一般化Born法; 疎水相互作用エネルギー; 炭酸脱水酵素-阻害剤; ノイラミニダーゼー抗インフルエンザ剤; フラボノイド; 薬物-受容体相互作用エネルギー; 分配係数; タンパク質の水和エネルギー; HIV-1プロテアーゼ阻害剤; 炭酸脱水酵素阻害剤; log P; 非経験的分子軌道法; 疎水相互作用; チトクロームP450; HIV-

We have proposed a novel Quantitative Structure-Activity Relationship (QSAR) involving molecular calculations such as Fragment Molecular Orbital one, and applied this procedure (Linear Expression by Representative Energy terms ; LERE) to several cases of ligands-protein interaction system in order to demonstrate the validity of the LERE procedure. As a result, we confirmed that the procedure provides valuable information which can not be obtained with any other methods.

我们提出了一种新的定量构效关系（QSAR）方法（如片段分子轨道方法），并将该方法应用于配体-蛋白质相互作用体系的几种情况，以证明莱雷方法的有效性。因此，我们确认该程序提供了无法通过任何其他方法获得的有价值的信息。

项目成果

Density Functional Theory Study of Hydrogen Atom Abstraction from a Series of para-Substituted Phenols : Why is the Hammett Constant Able to Represent Radical Reaction Rates?

从一系列对位取代酚中提取氢原子的密度泛函理论研究：为什么哈米特常数能够代表自由基反应速率？

• 发表时间: 2011
• 期刊: J.Org.Chem. in press
• 作者: Tatsusada Yoshida;Koji Hirozumi;Masataka Harada;Seiji Hitaoka;Hiroshi Chuman
• 通讯作者: Hiroshi Chuman

ヒトCathepsinA活性に対するArg344置換の影響に関する実験および分子科学計算に基づく解析

基于实验和分子科学计算分析Arg344取代对人组织蛋白酶A活性的影响

• 发表时间: 2010
• 作者: H.Arima;K.Motoyama.;郡恵理
• 通讯作者: 郡恵理

Expression and Molecular Dynamics Studies on Effect of Amino Acid Substitutions at Arg344 in Human Cathepsin A

人组织蛋白酶 A 中 Arg344 氨基酸取代影响的表达和分子动力学研究

• 发表时间: 2009
• 作者: Seiji Hitaoka;Eri Kori;Masataka Harada;Yoshito Kadota;Yasushi Horikawa;Tatsusada Yoshida;Kouji Itou;Hiroshi Chuman
• 通讯作者: Hiroshi Chuman

QSAR Studies Using Descriptors Derived from ab initio Fragment MO Calculation of Protein-Ligand Complex Structures

使用源自蛋白质-配体复合结构的从头开始片段 MO 计算的描述符进行 QSAR 研究

• 发表时间: 2009
• 作者: Seiji Hitaoka;Eri Kori;Masataka Harada;Yoshito Kadota;Yasushi Horikawa;Tatsusada Yoshida;Kouji Itou;Hiroshi Chuman;Seiji Hitaoka;Seiji Hitaoka;Tatsusada Yoshida;Tatsusada Yoshida;比多岡清司;吉田達貞
• 通讯作者: 吉田達貞

Comparative QSAR Analyses of a Series of Benzene Sulfonamide Inhibitors Based on Ab Initio Fragment MO Calculation of Their Complex Structures with Carbonic Anhydrase

基于碳酸酐酶复杂结构从头计算片段 MO 计算的一系列苯磺酰胺抑制剂的比较 QSAR 分析

• 发表时间: 2009
• 作者: Seiji Hitaoka;Eri Kori;Masataka Harada;Yoshito Kadota;Yasushi Horikawa;Tatsusada Yoshida;Kouji Itou;Hiroshi Chuman;Seiji Hitaoka;Seiji Hitaoka;Tatsusada Yoshida;Tatsusada Yoshida;比多岡清司;吉田達貞;Yohei Munei
• 通讯作者: Yohei Munei