B型肝炎ウイルス塩基配列とサブゲノタイプのマイニング解析による病態関連遺伝子同定
通过乙型肝炎病毒碱基序列和亚基因型挖掘分析鉴定疾病相关基因
基本信息
- 批准号:20590784
- 负责人:
- 金额:$ 1.25万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
B型肝炎ウイルス(HBV)感染者の臨床像を規定するウイルス側の要因を同定するため、当科に入院、あるいは外来に通院している無治療の無症候性HBVキャリア、B型慢性肝炎、B型肝硬変、B型肝細胞癌の患者ならびに内服治療している核酸アナログ製剤に対する耐性出現例、計50名より同意を得た後、血清を採取した。うち6例についてはDNAを単離し、A fragmentとB fragmentに分けてPCRを行い、直接シークエン法にてHBV全シークエンスを解析した。HBVゲノタイプ、サブゲノタイプについても解析した。現在解析した慢性肝炎例からの6株についてはゲノタイプCであった。上記50例の臨床データを収集している。並行して、HBV genotype Cの2倍長のウイルス遺伝子を組み込んだプラスミドを作成し、臨床から同定されるウイルス遺伝子変異による宿主細胞への影響の解析を試みることで、臨床像と特定遺伝子配列の関連について検討する準備を整えた。さらに、HBV遺伝子発現による宿主細胞蛋白への影響を網羅的に解析するためにプロテオミクス解析、PCRアレイ解析を試みるとともに、プロテオミクス解析のための準備を整えた。現在、全塩基配列のデータを集積しつつある。今後サンプルとデータを教室員が引き継いで、まず塩基配列データと臨床データを集積している。病態に関連する塩基配列についてウイルス遺伝子データ、臨床データがそろった時点でデータマイニングの手法により解析していく予定である。
The patients infected with hepatitis B virus (HBV) were infected with hepatitis B virus (HBeAg). It was stipulated that patients with chronic hepatitis B, chronic hepatitis B, patients with type B liver cancer, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis B, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cancer, patients with chronic hepatitis B, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cancer, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis B, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cancer, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis B, patients with type B liver cirrhosis, patients with chronic hepatitis A total of 50 people agreed to get it, and then the serum was collected. There were 6 cases of DNA isolation, A fragment
项目成果
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