Development of a Sequence-specific detection probe of damaged nucleobase for noninvasive DNA damage imaging.

开发用于非侵入性 DNA 损伤成像的受损核碱基序列特异性检测探针。

• 批准号: 20790010
• 负责人: KODAMA Tetsuya
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• 财政年份: 2008
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2008 至 2009
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20790010/
• 关键词: 生体関連物質; 人工核酸; 分子認識; 酸化損傷塩基; 可視化; 三重鎖; 機能性核酸; 8-OxoG

To develop a sequence-specific detection method of damaged nucleobase for noninvasive DNA damage imaging, we successfully created a novel bridged nucleic acid monomer that can recognize 8-hydroxyguanine in double-stranded DNA in a sequence-specific manner. Additionally, several nucleic acids, which convert into an oxidative lesion 5-formyluridne in double-stranded DNA in response to photo irradiation, were also synthesized. Moreover, we designed and synthesized a triplex forming oligonucleotide probe by organizing the 8-hydroxyguanine-recognizing nucleic acid monomer and acid-labile phosphoramidite linkage, and the fluorescent labeling of the probe was achieved for its noninvasive imaging use.

为了开发一种用于非侵入性DNA损伤成像的损伤核碱基序列特异性检测方法，我们成功地构建了一种新型桥接核酸单体，可以以序列特异性的方式识别双链DNA中的8-羟基鸟嘌呤。此外，还合成了几种核酸，这些核酸在光照射下可在双链DNA中转化为氧化损伤5-甲酰基尿苷。此外，我们设计并合成了一个由8-羟基鸟嘌呤识别的核酸单体和酸不稳定的磷酸酰胺键组成的三联体形成的寡核苷酸探针，并实现了探针的荧光标记，用于无创成像。

项目成果

Synthesis of Light-Responsive Bridged Nucleic Acid and Changes in Affinity with Complementary ssRNA

光响应性桥接核酸的合成以及与互补 ssRNA 的亲和力变化

• 发表时间: 2009
• 期刊: ChemBioChem 10
• 作者: DOHI;Toshifumi;et.al.;Kunihiko Morihiro(研究補助)
• 通讯作者: Kunihiko Morihiro(研究補助)

二重鎖DNA中の8-オキソグアニン塩基を選択的に認識する人工核酸プローブ

选择性识别双链DNA中8-氧代鸟嘌呤碱基的人工核酸探针

• 发表时间: 2008
• 作者: 兒玉哲也;三好哲也;小比賀聡;今西武;土肥寿文;兒玉哲也
• 通讯作者: 兒玉哲也

Synthesis of Light-responsive Bridged Nucleic Acid and Changes in Affinity with Complementary ssRNA.

光响应桥接核酸的合成以及与互补 ssRNA 的亲和力变化。

• 发表时间: 2009
• 期刊: ChemBioChem 10
• 作者: Kunihiko Morihiro;Tetsuya Kodama;Masaru Nishida;Takeshi Imanishi;Satoshi Obika
• 通讯作者: Satoshi Obika

Design, Synthesis, and Evaluation of a Novel Bridged Nucleic Acid, 2', 5'-BNAON, with S-type Sugar Conformation Fixed by N-O Linkage.

新型桥接核酸 2, 5-BNAON 的设计、合成和评估，其具有通过 N-O 连接固定的 S 型糖构象。

• 发表时间: 2009
• 期刊: Tetrahedron 65
• 作者: Tetsuya Kodama;Chieko Matsuo;Hidetsugu Ori;Tetsuya Miyoshi;Satoshi Obika;Kazuyuki Miyashita;Takeshi Imanishi
• 通讯作者: Takeshi Imanishi

DNA配列選択的な8-ヒドロキシグアニン検出プローブの創製研究

DNA序列选择性8-羟基鸟嘌呤检测探针的构建研究

• 发表时间: 2008
• 作者: S. Obika;S. Haitani;A. Itoh;N. Tsuda;H. Inohara;A. Fujisaka;A. Matsumoto;T. Imanishi;兒玉哲也
• 通讯作者: 兒玉哲也