权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

Identification of genomic region that confers Stx2 producibility of Stx2phages in Escherichia coli O157.

鉴定大肠杆菌 O157 中赋予 Stx2 噬菌体 Stx2 生产能力的基因组区域。

基本信息

批准号：
20790339
负责人：
OGURA Yoshitoshi
金额：
$ 2.75万
依托单位：
University of Miyazaki
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-20790339/
关键词：
感染症微生物毒素遺伝子ゲノム

项目摘要

Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157 causes severe food-borne illness in humans. The key virulence factor of EHEC is Shiga toxins (Stx1 and Stx2), which are encoded by lambdoid bacteriophages. It is known that producibility of both Stx1 and Stx2 are diversified among strains, but the reasons remain obscure. In this study, in order to reveal the genomic context of the diversity of toxin producibility among O157 strains, we performed fine comparison of Stx phages. Stx1 and Stx2 production levels among O157 strains isolated in Japan were highly divergent. We could not found any correlation between toxin producibility and phylogroups of strains. By comparative genomics, we found high degree of genomic diversity among Stx phage genomes. Now, we are analyzing correlation between toxin producibility and Stx phage types.

肠出血性大肠杆菌（EHEC）O157可导致人类严重的食源性疾病。肠出血性大肠杆菌的关键毒力因子是由类噬菌体编码的滋贺毒素（Stx 1和Stx 2）。已知Stx 1和Stx 2的产生在菌株之间是多样化的，但原因仍然不清楚。为了揭示O157菌株产毒多样性的基因组背景，我们对Stx菌株进行了精细的比较。在日本分离的O157菌株中，Stx1和Stx2的产生水平差异很大。未发现菌株产毒量与菌株群间的相关性。通过比较基因组学研究，我们发现Stx噬菌体基因组之间存在高度的基因组多样性。目前，我们正在分析毒素产生与Stx噬菌体类型的相关性。

项目成果

期刊论文数量（0）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Comparative genomics reveal the mechanism of the parallel evolution of O157 and non-O157 enterohemorrhagic Escherichia coli

DOI：
10.1073/pnas.0903585106
发表时间：
2009-10-20
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子：
11.1
作者：
Ogura, Yoshitoshi;Ooka, Tadasuke;Hayashi, Tetsuya
通讯作者：
Hayashi, Tetsuya

Genomic comparison of the Oantigen biosynthesis gene clusters of Escherichia coli 055 strains belonging to three distinct lineages

属于三个不同谱系的大肠杆菌055菌株O抗原生物合成基因簇的基因组比较

DOI：
发表时间：
2008
期刊：
Microbiology 154(2)
影响因子：
0
作者：
Iguchi A.;et.al.
通讯作者：
et.al.

Global regulation by horizontally transferred regulators establishes the pathogenicity of Escherichia coli

DOI：
10.1093/dnares/dsm033
发表时间：
2008-02-01
期刊：
DNA RESEARCH
影响因子：
4.1
作者：
Abe, Hiroyuki;Miyahara, Akira;Tobe, Toru
通讯作者：
Tobe, Toru

A precise reconstruction of the emergence and constrained radiations of Escherichia coli O157 portrayed by backbone concatenomic analysis

DOI：
10.1073/pnas.0812949106
发表时间：
2009-05-26
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA
影响因子：
11.1
作者：
Leopold, Shana R.;Magrini, Vincent;Tarr, Phillip I.
通讯作者：
Tarr, Phillip I.

Fosmid mapping法とWhole genome PCR scanning法を用いた腸管病原性大腸菌B171株のgenomic islandの網羅的な同定と配列決定.

使用 Fosmid 作图和全基因组 PCR 扫描对致病性大肠杆菌 B171 菌株的基因组岛进行全面鉴定和测序。