Das Transkriptionsnetzwerk der sigma S-vermittelten generellen Streßantwort in Escherichia coli: Promotorstrukturen, Netzwerkarchitektur und Verbindungen zu anderen globalen Netzwerken

大肠杆菌中 sigma S 介导的一般应激反应的转录网络:启动子结构、网络架构以及与其他全球网络的连接

基本信息

项目摘要

Die Sigma-S- oder RpoS-Untereinheit der RNA-Polymerase ist der Masterregulator an der Spitze eines komplexen hierarchisch gegliederten Transkriptions-Netzwerkes in E.coli, das der Bewältigung vielfältiger Streßbedingungen dient. Im vorliegenden Projekt sollen der Umfang dieses Transkriptionsnetzwerkes, seine informationsverarbeitende "Binnenstruktur" und seine Verknüpfung mit dem ebenfalls global agierenden cAMP-CRP-Netzwerk, sowie die molekulare und physiologische Funktion wichtiger Module und signalverarbeitender und regulatorischer Komponenten aufgeklärt werden. Dazu gehören u.a. (i) die Klärung der Frage, worauf die Sigma-S-Selektivität von Promotoren molekular beruht, (ii) die Identifizierung aller Sigma-S-abhängigen Gene einschließlich ihrer Zuordnung zu spezifisch regulierten Modulen innerhalb des Sigma-S-Netzwerkes, (iii) die Identifizierung und Charakterisierung der Modul-Regulatoren, (iv) die detaillierte molekulare Charakterisierung eines Quorum-Sensing-Moduls innerhalb des Sigma-S-Netzwerks, sowie (v) die Klärung der sowohl positiven wie negativen, direkten wie indirekten Kontrolle der rpoS-Transkription durch cAMP-CRP, und dabei auch die Suche nach einem globalen selbst cAMP-CRP-kontrollierten Regulator, der als Gegenspieler von Sigma-S an der Koordinierung von Wachstums- und Streßfunktionen beteiligt ist. Methodisch werden hierbei genomweite Transkriptionsanalysen und Bindestellenlokalisationsanalysen auf DNA-Microarrays mit genetischen, molekularbiologischen und biochemischen Techniken kombiniert werden. Diese Analyse des Sigma-S-Netzwerkes dürfte die bisher wohl umfassendste Untersuchung eines globalregulatorischen Netzwerks in E.coli sein und sollte damit einen wichtigen Meilenstein auf dem Weg zu einem Verständnis des gesamtzellulären Regulationsnetzwerkes darstellen.
De Sigma-S-Order Rpos-Untereinheit der RNA-聚合酶主调制子和Der Spitze Eines Komplexen Hierarchisch Gegliederten Transkritions-Netzwerkes in E.Coli,das der Bew ltigung vielälTiger Stre?bedingungen.我是一个跨国界的项目,提供的信息不同,这些信息不同,它们代表着全球范围内的代理--CRP-Netzwerk、Sowie die molekulare和生理学功能模块以及信号的提供者和管理者。主要内容如下:(一)服务于框架,服务于服务对象--S--服务对象;(二)服务对象,即服务对象;(四)服务对象,包括服务对象、服务对象和服务对象在德国,冯·西格玛-S和科迪尼隆·冯·瓦赫斯图斯-以及施特勒·贝特莱特。方法采用基因芯片技术、分子生物学和生化技术进行基因芯片和DNA定位分析。DES分析在大肠杆菌中发现了一种新的全球调控因子

项目成果

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Coordination Funds
协调基金
  • 批准号:
    314714080
  • 财政年份:
    2016
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Priority Programmes
Sensory Mechanisms and Local Signaling in c-di-GMP-mediated Signal Transduction in Escherichia coli
大肠杆菌 c-di-GMP 介导的信号转导的感觉机制和局部信号传导
  • 批准号:
    314334421
  • 财政年份:
    2016
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  • 项目类别:
    Priority Programmes
Heterogeneity of Matrix Production in Bacterial Biofilm Formation
细菌生物膜形成中基质产生的异质性
  • 批准号:
    276330018
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    2015
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    Priority Programmes
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细菌生物膜形成中 c-di-GMP 信号传导的关键分子机制
  • 批准号:
    269737138
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
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  • 项目类别:
    Research Grants
Bacterial "life-style" choices: Coordination of motility and biofilms functions by GGDEF/EAL proteins in Escherichia coli
细菌“生活方式”选择:大肠杆菌中 GGDEF/EAL 蛋白协调运动和生物膜功能
  • 批准号:
    23693070
  • 财政年份:
    2006
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  • 项目类别:
    Research Grants
Struktur/Funktions-Beziehungen der sigma S-haltigen "Stress"-RNA-Polymerase in Escherichia coli
大肠杆菌中含有 sigma S 的“应激”RNA 聚合酶的结构/功能关系
  • 批准号:
    5424677
  • 财政年份:
    2004
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Research Grants
Global regulation by proteolysis in Escherichia coli: Molecular recognition, signal integration and quantitative analysis of proteolysis-controlled regulatory circuits
大肠杆菌蛋白水解的全局调节:蛋白水解控制调节电路的分子识别、信号整合和定量分析
  • 批准号:
    5360932
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Priority Programmes
Large-scale extracellular matrix architecture and tissue-like morphogenesis as emerging properties of bacterial multicellularity
大规模细胞外基质结构和组织样形态发生作为细菌多细胞性的新兴特性
  • 批准号:
    504035721
  • 财政年份:
  • 资助金额:
    --
  • 项目类别:
    Priority Programmes
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